More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03384 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 803 aa  1588    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  45.64 
 
 		 809 aa  581  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  35.38 
 
 		 835 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  35.27 
 
 		 806 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  36.73 
 
 		 815 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  34.8 
 
 		 807 aa  386  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  37.34 
 
 		 856 aa  379  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 799 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  33.89 
 
 		 803 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  33.97 
 
 		 803 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  35.61 
 
 		 840 aa  365  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  33.94 
 
 		 804 aa  363  8e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  35.49 
 
 		 840 aa  362  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  33.63 
 
 		 855 aa  360  6e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2215  MscS mechanosensitive ion channel  35.61 
 
 		 820 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 		 803 aa  351  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  32.06 
 
 		 794 aa  321  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  32.07 
 
 		 817 aa  320  5e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  29.43 
 
 		 815 aa  314  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  30.57 
 
 		 814 aa  313  7.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1404  MscS Mechanosensitive ion channel  29.72 
 
 		 817 aa  304  5.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  32.49 
 
 		 813 aa  300  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  30.93 
 
 		 866 aa  291  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  31.17 
 
 		 815 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 814 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 832 aa  283  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  32.07 
 
 		 820 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  32.07 
 
 		 820 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  32.07 
 
 		 814 aa  281  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  35.99 
 
 		 853 aa  280  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4029  putative mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 		 832 aa  277  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 909 aa  274  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 947 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  31.06 
 
 		 910 aa  272  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  32.61 
 
 		 809 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.61 
 
 		 809 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  32.61 
 
 		 808 aa  270  7e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 883 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  32.24 
 
 		 809 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  28.91 
 
 		 879 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  31.11 
 
 		 816 aa  265  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  32.33 
 
 		 773 aa  263  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 		 909 aa  261  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  30.64 
 
 		 860 aa  251  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 859 aa  251  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  29.31 
 
 		 832 aa  244  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  27 
 
 		 867 aa  244  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 		 844 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  28.63 
 
 		 825 aa  241  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  28.91 
 
 		 874 aa  240  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 843 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  26.4 
 
 		 825 aa  239  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 		 845 aa  228  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 840 aa  211  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  33.68 
 
 		 830 aa  195  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  41.38 
 
 		 796 aa  175  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  37.25 
 
 		 849 aa  174  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  27.16 
 
 		 868 aa  174  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  37.63 
 
 		 847 aa  171  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  37.63 
 
 		 847 aa  171  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  34.24 
 
 		 891 aa  156  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  34.24 
 
 		 785 aa  157  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  29.51 
 
 		 877 aa  147  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  29.02 
 
 		 752 aa  147  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  32.63 
 
 		 1144 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  33.21 
 
 		 806 aa  144  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  32.8 
 
 		 1080 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  34.1 
 
 		 685 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  33.14 
 
 		 1118 aa  142  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  33.14 
 
 		 1118 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  33.14 
 
 		 1118 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  33.14 
 
 		 1120 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  34.48 
 
 		 1115 aa  141  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  33.14 
 
 		 1120 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  33.78 
 
 		 1120 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  33.78 
 
 		 1120 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  33.78 
 
 		 1120 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  33.78 
 
 		 1120 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  33.78 
 
 		 1120 aa  140  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  33.78 
 
 		 1120 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  33.78 
 
 		 1120 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  33.78 
 
 		 1120 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  36.33 
 
 		 1107 aa  139  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  36.33 
 
 		 1107 aa  139  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  32.72 
 
 		 1067 aa  139  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  33.78 
 
 		 1118 aa  139  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  36.33 
 
 		 1107 aa  139  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  36.33 
 
 		 1107 aa  139  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  36.33 
 
 		 1107 aa  139  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  36.33 
 
 		 1107 aa  139  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  36.33 
 
 		 1107 aa  139  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  36.07 
 
 		 1067 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  36.33 
 
 		 1107 aa  139  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  36.33 
 
 		 1107 aa  139  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  38.43 
 
 		 1127 aa  139  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 1072 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  33 
 
 		 1107 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 1072 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 1072 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 1067 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>