More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0384 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  100 
 
 
752 aa  1520    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  40.4 
 
 
753 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  40.72 
 
 
732 aa  281  4e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  27.15 
 
 
785 aa  250  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  27.15 
 
 
891 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  42.61 
 
 
874 aa  226  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  40.2 
 
 
840 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  38.63 
 
 
806 aa  207  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  35.25 
 
 
868 aa  206  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  24.97 
 
 
825 aa  201  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  38.89 
 
 
796 aa  196  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  36.18 
 
 
859 aa  192  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  30.73 
 
 
845 aa  189  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  38.93 
 
 
847 aa  190  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  38.93 
 
 
847 aa  190  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  40.64 
 
 
843 aa  188  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 
795 aa  188  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 
879 aa  188  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  42.92 
 
 
860 aa  188  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  30.39 
 
 
832 aa  187  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  34.75 
 
 
947 aa  185  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  37.54 
 
 
849 aa  185  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  34.75 
 
 
909 aa  185  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  39.31 
 
 
909 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  41.59 
 
 
299 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  29.04 
 
 
853 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  37.17 
 
 
685 aa  177  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  41.64 
 
 
807 aa  177  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  39.39 
 
 
291 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  39.39 
 
 
883 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  36.14 
 
 
830 aa  175  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  33.42 
 
 
910 aa  174  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  33.8 
 
 
844 aa  171  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  33.45 
 
 
843 aa  170  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  39.44 
 
 
298 aa  169  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  43.3 
 
 
784 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  32.63 
 
 
866 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  36.76 
 
 
322 aa  168  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  36.53 
 
 
1117 aa  168  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  35.27 
 
 
1118 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  35.27 
 
 
1118 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  35.27 
 
 
1120 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  35.27 
 
 
1118 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  35.27 
 
 
1120 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  34.91 
 
 
1120 aa  164  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  34.91 
 
 
1120 aa  164  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  34.91 
 
 
1120 aa  164  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  34.91 
 
 
1120 aa  164  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  34.91 
 
 
1120 aa  164  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  34.91 
 
 
1120 aa  164  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  34.91 
 
 
1120 aa  164  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  34.91 
 
 
1120 aa  164  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  34.91 
 
 
1118 aa  164  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  30.69 
 
 
867 aa  162  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  32.97 
 
 
825 aa  161  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  37.84 
 
 
1115 aa  160  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  42.86 
 
 
864 aa  160  8e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  42.49 
 
 
636 aa  160  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  38.5 
 
 
472 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  34.68 
 
 
1144 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  42.49 
 
 
636 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  30.16 
 
 
806 aa  160  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  42.08 
 
 
816 aa  159  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  34.25 
 
 
1158 aa  156  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 
1235 aa  157  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  36.36 
 
 
1111 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 
877 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  30.99 
 
 
807 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  40.27 
 
 
560 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  37.9 
 
 
861 aa  154  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 
815 aa  153  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  37.74 
 
 
981 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  36.36 
 
 
1117 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  36.4 
 
 
1105 aa  152  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  41.03 
 
 
428 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  37.25 
 
 
301 aa  151  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  35.71 
 
 
1133 aa  150  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  35.11 
 
 
1110 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  39.56 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  34.25 
 
 
1120 aa  150  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  34.25 
 
 
1120 aa  150  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  34.25 
 
 
1120 aa  150  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  34.15 
 
 
435 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  35.91 
 
 
1134 aa  149  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 
842 aa  149  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  35.45 
 
 
1134 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  33.82 
 
 
287 aa  148  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  39.82 
 
 
447 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0101  putative AefA  39.22 
 
 
338 aa  147  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159695  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 
809 aa  147  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  37.05 
 
 
451 aa  147  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  30.5 
 
 
814 aa  147  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  28.8 
 
 
803 aa  147  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  34.7 
 
 
1102 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  37.39 
 
 
637 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  32.4 
 
 
773 aa  146  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  40.1 
 
 
1130 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 
799 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  33.71 
 
 
804 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
803 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>