More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3758 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 809 aa  1593    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  45.64 
 
 		 803 aa  640    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  35.99 
 
 		 856 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  36.1 
 
 		 835 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  36.12 
 
 		 815 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  34.57 
 
 		 806 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  34.82 
 
 		 840 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  35.14 
 
 		 840 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  34.31 
 
 		 807 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  34.77 
 
 		 803 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  34.18 
 
 		 803 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  34.7 
 
 		 855 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 		 799 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2215  MscS mechanosensitive ion channel  36.02 
 
 		 820 aa  347  7e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 817 aa  335  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  33.5 
 
 		 814 aa  332  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  33.75 
 
 		 832 aa  332  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  32.72 
 
 		 804 aa  327  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 		 815 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 814 aa  321  3.9999999999999996e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 		 816 aa  320  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  30.47 
 
 		 815 aa  319  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  33.16 
 
 		 803 aa  317  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1404  MscS Mechanosensitive ion channel  30.21 
 
 		 817 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  30.95 
 
 		 794 aa  310  8e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  31.31 
 
 		 883 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  32.15 
 
 		 820 aa  302  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  32.15 
 
 		 820 aa  302  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 866 aa  300  5e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  32.19 
 
 		 814 aa  300  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  33.12 
 
 		 808 aa  298  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  33.12 
 
 		 809 aa  297  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  33.12 
 
 		 809 aa  297  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  31.63 
 
 		 853 aa  297  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  33.12 
 
 		 809 aa  297  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4029  putative mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 832 aa  295  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  33.16 
 
 		 813 aa  292  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  32.7 
 
 		 773 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  34.53 
 
 		 909 aa  289  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  34.16 
 
 		 947 aa  288  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  34.16 
 
 		 909 aa  288  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  31.89 
 
 		 910 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 879 aa  282  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 874 aa  268  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  30.75 
 
 		 832 aa  266  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  27.99 
 
 		 825 aa  259  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 		 860 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  28.94 
 
 		 845 aa  254  5.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  28.59 
 
 		 859 aa  233  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  26.54 
 
 		 844 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 		 867 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  26.27 
 
 		 843 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  28.2 
 
 		 840 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  26.5 
 
 		 825 aa  213  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 796 aa  205  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  37.36 
 
 		 830 aa  186  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  26.96 
 
 		 868 aa  184  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  31.2 
 
 		 891 aa  174  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 785 aa  173  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  38.05 
 
 		 849 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  36.94 
 
 		 847 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  37.36 
 
 		 847 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.72 
 
 		 806 aa  160  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  29.32 
 
 		 752 aa  154  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  33.46 
 
 		 1144 aa  144  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  31.77 
 
 		 877 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  32.45 
 
 		 291 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  28.34 
 
 		 753 aa  140  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  32.94 
 
 		 298 aa  139  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  32.87 
 
 		 685 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 842 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  28.76 
 
 		 732 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  31.97 
 
 		 637 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1107 aa  132  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  31.01 
 
 		 299 aa  132  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 1235 aa  131  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  31.64 
 
 		 1127 aa  131  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  29.93 
 
 		 843 aa  131  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 		 560 aa  130  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 		 1158 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  30.53 
 
 		 1080 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  32.16 
 
 		 1120 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  32.16 
 
 		 1120 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  32.16 
 
 		 1120 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  32.16 
 
 		 1120 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  32.16 
 
 		 1120 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  32.16 
 
 		 1120 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  32.16 
 
 		 1120 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  32.16 
 
 		 1118 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  32.16 
 
 		 1120 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 833 aa  128  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 981 aa  127  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  31.91 
 
 		 636 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 1067 aa  126  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  31.35 
 
 		 1120 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  31.35 
 
 		 1120 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  31.35 
 
 		 1120 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  31.7 
 
 		 1072 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  31.7 
 
 		 1118 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 1066 aa  125  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>