More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5378 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  64.36 
 
 		 879 aa  990    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  63.8 
 
 		 883 aa  981    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 909 aa  1786    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  87.72 
 
 		 909 aa  1505    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  65.54 
 
 		 910 aa  1085    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  87.5 
 
 		 947 aa  1474    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  41.57 
 
 		 853 aa  520  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  37.45 
 
 		 866 aa  477  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  34.94 
 
 		 874 aa  418  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  37.07 
 
 		 860 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  35.22 
 
 		 832 aa  363  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  34.48 
 
 		 845 aa  345  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2215  MscS mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 820 aa  306  8.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311174 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  31.5 
 
 		 859 aa  294  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  31.08 
 
 		 825 aa  293  7e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  31.3 
 
 		 815 aa  289  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 		 835 aa  288  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  33.29 
 
 		 809 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  30.81 
 
 		 844 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  30.76 
 
 		 803 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  31.04 
 
 		 843 aa  282  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  30.37 
 
 		 825 aa  281  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  31.13 
 
 		 803 aa  281  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  28.02 
 
 		 867 aa  279  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  29.8 
 
 		 840 aa  271  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 803 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 		 840 aa  270  7e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  30.47 
 
 		 855 aa  270  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  29.68 
 
 		 799 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  30.25 
 
 		 806 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  31.04 
 
 		 807 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  28.72 
 
 		 817 aa  252  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  29 
 
 		 856 aa  251  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  31.42 
 
 		 840 aa  245  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  28.75 
 
 		 868 aa  237  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  27.1 
 
 		 832 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 		 830 aa  232  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  26.86 
 
 		 814 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 815 aa  230  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  29.04 
 
 		 814 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  29.04 
 
 		 820 aa  225  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  29.04 
 
 		 820 aa  225  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  28.81 
 
 		 804 aa  221  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  26.68 
 
 		 815 aa  220  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 		 816 aa  219  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 814 aa  217  8e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1404  MscS Mechanosensitive ion channel  27.09 
 
 		 817 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  39.14 
 
 		 849 aa  214  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  43.87 
 
 		 847 aa  210  8e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  43.87 
 
 		 847 aa  210  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 		 803 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.36 
 
 		 809 aa  205  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  28.36 
 
 		 809 aa  205  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  28.36 
 
 		 809 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4029  putative mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 		 832 aa  204  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  41.88 
 
 		 796 aa  203  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  28.49 
 
 		 808 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  31.11 
 
 		 773 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 794 aa  199  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 813 aa  195  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  34.56 
 
 		 752 aa  187  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  34.83 
 
 		 891 aa  185  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  37.09 
 
 		 806 aa  184  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  38.14 
 
 		 785 aa  184  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  34.93 
 
 		 877 aa  181  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  34.78 
 
 		 732 aa  159  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 795 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  34.98 
 
 		 753 aa  155  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  38.02 
 
 		 1127 aa  155  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  38.05 
 
 		 1235 aa  154  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  33.84 
 
 		 299 aa  152  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  41.31 
 
 		 472 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  33.23 
 
 		 1080 aa  151  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  36.89 
 
 		 981 aa  150  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.88 
 
 		 1144 aa  149  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  38.31 
 
 		 816 aa  148  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  37.73 
 
 		 1117 aa  144  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  32.12 
 
 		 1067 aa  144  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  32.12 
 
 		 1072 aa  144  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  32.12 
 
 		 1072 aa  144  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  32.12 
 
 		 1072 aa  144  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  34.92 
 
 		 807 aa  144  9e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  34.78 
 
 		 291 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  34.29 
 
 		 864 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  33.87 
 
 		 298 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  31.75 
 
 		 1067 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 636 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  34.55 
 
 		 1120 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  36.19 
 
 		 1118 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  34.55 
 
 		 1120 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  34.55 
 
 		 1120 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  35.68 
 
 		 1066 aa  142  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  36.19 
 
 		 1118 aa  142  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 636 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  34.85 
 
 		 1060 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  32.12 
 
 		 1118 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  32.12 
 
 		 1118 aa  141  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  32.12 
 
 		 1120 aa  141  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 		 843 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  32.12 
 
 		 1120 aa  141  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>