More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2264 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  99.88 
 
 
808 aa  1417    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  51.51 
 
 
815 aa  779    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  68.27 
 
 
813 aa  966    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 
809 aa  1583    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  55.95 
 
 
794 aa  827    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  70.84 
 
 
815 aa  1122    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  71.62 
 
 
816 aa  1082    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  95.6 
 
 
773 aa  1347    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  99.63 
 
 
809 aa  1577    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  100 
 
 
809 aa  1583    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4029  putative mechanosensitive ion channel  66.84 
 
 
832 aa  958    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  70.46 
 
 
820 aa  1070    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  50.97 
 
 
817 aa  743    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  70.46 
 
 
814 aa  1072    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1404  MscS Mechanosensitive ion channel  52.72 
 
 
817 aa  767    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  72 
 
 
814 aa  1113    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  71.75 
 
 
832 aa  1108    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  53.18 
 
 
814 aa  763    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  70.46 
 
 
820 aa  1070    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  44.3 
 
 
806 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  44.46 
 
 
807 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  43.02 
 
 
799 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  42.42 
 
 
804 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  43.24 
 
 
855 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  43.24 
 
 
803 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  42.06 
 
 
803 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  41.76 
 
 
803 aa  512  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  37.47 
 
 
815 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  38.28 
 
 
856 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  35.52 
 
 
835 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2215  MscS mechanosensitive ion channel  36.4 
 
 
820 aa  382  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.311174 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  36.02 
 
 
840 aa  365  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  35.89 
 
 
840 aa  363  8e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  33 
 
 
809 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  32.27 
 
 
803 aa  295  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  31.26 
 
 
866 aa  282  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  30.09 
 
 
853 aa  274  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  31.38 
 
 
832 aa  269  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  30.27 
 
 
845 aa  267  5e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  30.47 
 
 
879 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  30.81 
 
 
874 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  30.45 
 
 
883 aa  258  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 
860 aa  247  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  29.74 
 
 
910 aa  235  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  28.89 
 
 
843 aa  228  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  28.96 
 
 
909 aa  226  9e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  28.96 
 
 
947 aa  226  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 
909 aa  223  9e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  27.05 
 
 
825 aa  221  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  30.24 
 
 
859 aa  221  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  28.24 
 
 
825 aa  206  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  31.79 
 
 
844 aa  205  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  31.38 
 
 
867 aa  203  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 
840 aa  183  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  27.05 
 
 
830 aa  177  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  31.99 
 
 
868 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  41.18 
 
 
1127 aa  166  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  27 
 
 
796 aa  163  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 
849 aa  157  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  32.23 
 
 
847 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 
847 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  32.78 
 
 
752 aa  152  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  37.7 
 
 
806 aa  148  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  33.76 
 
 
1235 aa  147  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  37.71 
 
 
1117 aa  147  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  37.17 
 
 
1144 aa  147  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  39.37 
 
 
1110 aa  144  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  29.74 
 
 
1107 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  37.05 
 
 
1115 aa  142  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  29.86 
 
 
1107 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  29.86 
 
 
1107 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 
1107 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  29.86 
 
 
1107 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  29.86 
 
 
1107 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  29.86 
 
 
1107 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  36.51 
 
 
795 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  29.86 
 
 
1107 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  40.09 
 
 
1117 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  29.86 
 
 
1107 aa  140  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  29.86 
 
 
1107 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  34.12 
 
 
1120 aa  140  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 
1120 aa  140  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  34.12 
 
 
1120 aa  140  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3934  hypothetical protein  29.23 
 
 
1107 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  34.12 
 
 
1120 aa  140  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  34.12 
 
 
1120 aa  140  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  41.41 
 
 
1111 aa  140  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  34.12 
 
 
1120 aa  140  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  34.12 
 
 
1120 aa  140  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  34.12 
 
 
1120 aa  140  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  34.12 
 
 
1118 aa  140  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  35.89 
 
 
1120 aa  139  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  35.89 
 
 
1120 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  35.89 
 
 
1120 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  29.2 
 
 
891 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  28.6 
 
 
1107 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  35 
 
 
877 aa  139  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 
785 aa  138  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  37.8 
 
 
1134 aa  137  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  34.54 
 
 
1118 aa  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>