93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1415 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.35 
 
 		 688 aa  636    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 698 aa  1445    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  52.24 
 
 		 690 aa  753    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  52.14 
 
 		 704 aa  734    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.93 
 
 		 687 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.73 
 
 		 709 aa  509  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.87 
 
 		 704 aa  480  1e-134  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  43.78 
 
 		 638 aa  422  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  37.34 
 
 		 581 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.66 
 
 		 487 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  39.28 
 
 		 932 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  39.3 
 
 		 750 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  42.8 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  41.88 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  39.12 
 
 		 606 aa  364  3e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 460 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  33.06 
 
 		 460 aa  265  3e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  33.9 
 
 		 410 aa  234  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  32.83 
 
 		 434 aa  233  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.28 
 
 		 467 aa  162  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0652  F5/8 type C domain-containing protein  27.73 
 
 		 436 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0313432  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0640  F5/8 type C domain-containing protein  27.31 
 
 		 436 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  32.13 
 
 		 435 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  29.97 
 
 		 429 aa  114  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  30.25 
 
 		 581 aa  114  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  31.27 
 
 		 441 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  29.8 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  31.86 
 
 		 440 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  27.32 
 
 		 674 aa  106  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  28.36 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  31.63 
 
 		 452 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  26.49 
 
 		 447 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  31.6 
 
 		 478 aa  102  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  29.9 
 
 		 429 aa  100  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  31.22 
 
 		 450 aa  99  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.74 
 
 		 1289 aa  98.2  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  29.47 
 
 		 431 aa  95.9  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  24.86 
 
 		 473 aa  94.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  27.78 
 
 		 473 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  23.48 
 
 		 479 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  23.76 
 
 		 479 aa  91.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  34.62 
 
 		 474 aa  90.9  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  33.57 
 
 		 494 aa  90.1  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  26.83 
 
 		 538 aa  90.5  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  25.55 
 
 		 415 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  26.26 
 
 		 485 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  35.25 
 
 		 596 aa  84.3  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  31.71 
 
 		 711 aa  84.3  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  28.72 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  24.64 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.59 
 
 		 1967 aa  79.7  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  24.78 
 
 		 340 aa  79.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  33.75 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  29.07 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.65 
 
 		 1264 aa  75.5  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  44.32 
 
 		 627 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  37.17 
 
 		 490 aa  69.7  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  25.62 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  23.97 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  25.58 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  27.84 
 
 		 463 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  24.01 
 
 		 505 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  34.92 
 
 		 591 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.08 
 
 		 1329 aa  62  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  24.09 
 
 		 644 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  37.33 
 
 		 495 aa  60.1  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  23.48 
 
 		 532 aa  60.1  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  36 
 
 		 484 aa  59.7  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  32.14 
 
 		 482 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  26.97 
 
 		 731 aa  58.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  34.19 
 
 		 1471 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  48.21 
 
 		 212 aa  55.1  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  24.45 
 
 		 2095 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  35.04 
 
 		 478 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  27.34 
 
 		 1965 aa  53.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4324  coagulation factor 5/8 type, C-terminal  28.48 
 
 		 223 aa  52.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.010102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  24.04 
 
 		 2095 aa  51.2  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  32.69 
 
 		 850 aa  50.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  30.16 
 
 		 805 aa  50.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  36 
 
 		 584 aa  50.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  36 
 
 		 606 aa  50.4  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 464 aa  50.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  30.43 
 
 		 600 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.5 
 
 		 775 aa  49.7  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0197  endo-beta-N-acetylglucosaminidase D  35.45 
 
 		 927 aa  50.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0803  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.06 
 
 		 712 aa  48.9  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.969227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  28 
 
 		 466 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  41.07 
 
 		 474 aa  48.5  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  26.16 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  35.21 
 
 		 758 aa  45.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  30.67 
 
 		 1164 aa  45.4  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  24.1 
 
 		 473 aa  44.3  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>