252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1301 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1008  glycoside hydrolase family 31  41.61 
 
 		 1311 aa  1025    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.590426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  100 
 
 		 1965 aa  4007    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  35.31 
 
 		 1108 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3814  glycoside hydrolase family 31  34.45 
 
 		 1119 aa  427  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0113  alpha-glucosidase  28.02 
 
 		 1019 aa  404  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.5746e-16 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  40.98 
 
 		 1001 aa  231  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  35.56 
 
 		 1471 aa  186  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  36.69 
 
 		 801 aa  174  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  32.49 
 
 		 828 aa  171  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  32.44 
 
 		 785 aa  161  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  34.93 
 
 		 776 aa  159  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  32.33 
 
 		 1588 aa  159  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1248  fibronectin type III domain-containing protein  62.6 
 
 		 205 aa  156  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  33.93 
 
 		 770 aa  155  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  34.8 
 
 		 777 aa  154  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  32.57 
 
 		 779 aa  150  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  30.42 
 
 		 803 aa  146  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  33.33 
 
 		 752 aa  145  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  61.9 
 
 		 2095 aa  142  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  32.5 
 
 		 768 aa  141  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  61.9 
 
 		 2095 aa  141  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  30.03 
 
 		 779 aa  140  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  32.72 
 
 		 792 aa  140  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  30.9 
 
 		 836 aa  139  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  30.87 
 
 		 779 aa  137  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  23.32 
 
 		 821 aa  135  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0687  fibronectin type III domain-containing protein  52.63 
 
 		 159 aa  135  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  24.39 
 
 		 743 aa  133  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  24.44 
 
 		 765 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  30.77 
 
 		 973 aa  130  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  28.44 
 
 		 969 aa  130  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  30.82 
 
 		 788 aa  128  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  24.44 
 
 		 806 aa  127  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  30.65 
 
 		 836 aa  126  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  29.55 
 
 		 845 aa  125  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  28 
 
 		 951 aa  125  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  52.88 
 
 		 1173 aa  125  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0685  fibronectin type III domain-containing protein  49.25 
 
 		 1686 aa  121  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  23.46 
 
 		 752 aa  120  1.9999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11054  alpha glucosidase II, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03500)  30.36 
 
 		 952 aa  120  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.464256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 		 799 aa  119  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  27.33 
 
 		 795 aa  119  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  27.33 
 
 		 795 aa  119  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  26.88 
 
 		 944 aa  118  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.07 
 
 		 788 aa  118  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  27.8 
 
 		 791 aa  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  27.8 
 
 		 789 aa  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  28.95 
 
 		 825 aa  117  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  27.8 
 
 		 791 aa  117  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  29.82 
 
 		 840 aa  115  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  29.55 
 
 		 806 aa  115  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.75 
 
 		 788 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  27.8 
 
 		 790 aa  114  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.61 
 
 		 791 aa  114  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  26.21 
 
 		 821 aa  113  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  28.91 
 
 		 746 aa  110  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  25.66 
 
 		 783 aa  110  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  28.81 
 
 		 911 aa  110  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  27.24 
 
 		 799 aa  109  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2648  glycosy hydrolase family protein  28.12 
 
 		 715 aa  108  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.69 
 
 		 787 aa  109  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  27.61 
 
 		 1016 aa  108  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0815  glycosy hydrolase family protein  56.63 
 
 		 1127 aa  108  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  29.59 
 
 		 1207 aa  108  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05150  alpha glucosidase, putative  28.97 
 
 		 956 aa  107  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133027  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  29.45 
 
 		 797 aa  107  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  23.6 
 
 		 764 aa  106  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  30.27 
 
 		 762 aa  105  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  28.72 
 
 		 803 aa  104  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  28.98 
 
 		 794 aa  105  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2334  alpha-glucosidase  28.43 
 
 		 715 aa  104  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  23.44 
 
 		 764 aa  104  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  27.37 
 
 		 1024 aa  103  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  28.62 
 
 		 784 aa  102  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  27.78 
 
 		 791 aa  103  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  27.53 
 
 		 803 aa  102  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  21.52 
 
 		 799 aa  102  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  28.05 
 
 		 1128 aa  102  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15100  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  26.12 
 
 		 816 aa  101  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  27.53 
 
 		 803 aa  100  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  34.29 
 
 		 779 aa  99.8  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  29.97 
 
 		 839 aa  99.8  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  27.02 
 
 		 815 aa  99.8  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  22.72 
 
 		 757 aa  99.4  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  27.6 
 
 		 683 aa  99.4  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  27.12 
 
 		 813 aa  99  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  26.76 
 
 		 816 aa  98.6  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  27.34 
 
 		 685 aa  97.8  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0196  alpha-glucosidase  21.52 
 
 		 829 aa  97.1  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.193664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 695 aa  96.7  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  24.37 
 
 		 794 aa  96.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  29.03 
 
 		 821 aa  95.1  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  30.98 
 
 		 687 aa  95.1  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  26.73 
 
 		 828 aa  94.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  28.26 
 
 		 806 aa  94  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  28.26 
 
 		 806 aa  94  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1877  glycoside hydrolase family protein  24.28 
 
 		 797 aa  93.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  28.26 
 
 		 806 aa  93.6  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  26.04 
 
 		 798 aa  92.8  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  21.71 
 
 		 775 aa  92  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>