204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2500 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 973 aa  2016    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  50.75 
 
 		 969 aa  986    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  43.83 
 
 		 951 aa  844    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  52.51 
 
 		 944 aa  1037    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  39.39 
 
 		 791 aa  469  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  40.27 
 
 		 783 aa  452  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  38.05 
 
 		 806 aa  389  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  34.52 
 
 		 770 aa  317  7e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  37.61 
 
 		 995 aa  307  7e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3277  glycoside hydrolase family protein  37.39 
 
 		 974 aa  293  8e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  34.21 
 
 		 695 aa  291  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  30.37 
 
 		 1024 aa  280  8e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  31.95 
 
 		 679 aa  280  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  33.19 
 
 		 668 aa  279  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  32.02 
 
 		 679 aa  279  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  31.82 
 
 		 679 aa  279  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  32.02 
 
 		 679 aa  279  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  32.93 
 
 		 661 aa  277  6e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  31.62 
 
 		 679 aa  277  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  31.62 
 
 		 679 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  33 
 
 		 690 aa  275  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  31.95 
 
 		 840 aa  269  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  31.51 
 
 		 801 aa  261  5.0000000000000005e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  31.2 
 
 		 699 aa  254  8.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  29.9 
 
 		 776 aa  249  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  31.18 
 
 		 779 aa  247  6.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  30.6 
 
 		 779 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  30.77 
 
 		 836 aa  243  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  30.24 
 
 		 779 aa  241  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  29.24 
 
 		 836 aa  236  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  28.38 
 
 		 777 aa  233  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  29.48 
 
 		 785 aa  232  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  30.95 
 
 		 821 aa  231  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  28.75 
 
 		 828 aa  227  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  29 
 
 		 821 aa  226  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  28.7 
 
 		 746 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  28.64 
 
 		 803 aa  219  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  27.45 
 
 		 839 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  30.19 
 
 		 743 aa  219  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  29.93 
 
 		 768 aa  216  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  27.71 
 
 		 687 aa  212  3e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  28.97 
 
 		 792 aa  207  8e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  29.51 
 
 		 815 aa  207  9e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  29.51 
 
 		 765 aa  206  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  28.01 
 
 		 752 aa  204  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  29.31 
 
 		 845 aa  203  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  29.92 
 
 		 760 aa  197  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  27.5 
 
 		 685 aa  195  3e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  29.27 
 
 		 765 aa  195  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  28.8 
 
 		 799 aa  194  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  27.22 
 
 		 797 aa  191  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  28.44 
 
 		 806 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  28.45 
 
 		 794 aa  188  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  28.77 
 
 		 762 aa  185  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  26.87 
 
 		 825 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  27.36 
 
 		 828 aa  182  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  25.88 
 
 		 764 aa  178  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  28.26 
 
 		 700 aa  178  5e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  27.81 
 
 		 798 aa  178  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  27.69 
 
 		 683 aa  177  9e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  27.88 
 
 		 757 aa  177  9e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  25.8 
 
 		 764 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  26.16 
 
 		 795 aa  173  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  26.16 
 
 		 795 aa  173  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.41 
 
 		 788 aa  172  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.72 
 
 		 788 aa  170  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  25.89 
 
 		 779 aa  169  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  26.44 
 
 		 1016 aa  168  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.99 
 
 		 791 aa  168  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.97 
 
 		 787 aa  168  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  23.88 
 
 		 1207 aa  168  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  29.31 
 
 		 799 aa  168  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  24.56 
 
 		 804 aa  167  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  24.73 
 
 		 788 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  25.2 
 
 		 823 aa  166  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  24.61 
 
 		 791 aa  166  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  24.61 
 
 		 791 aa  165  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  24.78 
 
 		 789 aa  164  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  28.4 
 
 		 656 aa  163  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  26.09 
 
 		 770 aa  162  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  26.58 
 
 		 790 aa  162  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  25.4 
 
 		 777 aa  161  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  25.4 
 
 		 775 aa  162  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  25.96 
 
 		 695 aa  162  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 		 813 aa  161  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  26.21 
 
 		 771 aa  161  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  23.83 
 
 		 1128 aa  159  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  26.55 
 
 		 821 aa  158  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2529  glycoside hydrolase family protein  26.74 
 
 		 1010 aa  158  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  23.95 
 
 		 799 aa  157  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  25.75 
 
 		 775 aa  157  8e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  25.13 
 
 		 760 aa  157  8e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  25.64 
 
 		 774 aa  157  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  28.57 
 
 		 794 aa  157  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  25.62 
 
 		 692 aa  156  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  26.87 
 
 		 752 aa  154  5e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  26.94 
 
 		 911 aa  155  5e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  27.88 
 
 		 816 aa  155  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15100  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  25.57 
 
 		 816 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1956  glycoside hydrolase family protein  23.57 
 
 		 927 aa  154  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>