200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2087 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  100 
 
 
762 aa  1495    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  48.17 
 
 
779 aa  479  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  39.31 
 
 
801 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  38.2 
 
 
777 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  39.89 
 
 
776 aa  433  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  39.15 
 
 
821 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  36.42 
 
 
779 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  37.35 
 
 
746 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  38.28 
 
 
792 aa  424  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  37.83 
 
 
752 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  41.98 
 
 
803 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  44.54 
 
 
779 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  39.32 
 
 
768 aa  410  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  40.42 
 
 
785 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  40.22 
 
 
806 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  34.96 
 
 
728 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  33.55 
 
 
799 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  41.18 
 
 
743 aa  380  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  35.07 
 
 
794 aa  375  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  35.69 
 
 
702 aa  368  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  37.39 
 
 
798 aa  363  6e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  39.53 
 
 
825 aa  363  6e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  32.79 
 
 
797 aa  361  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  40.83 
 
 
828 aa  356  6.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  35.74 
 
 
700 aa  355  2e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  37.31 
 
 
828 aa  354  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  37.48 
 
 
683 aa  348  3e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  39.12 
 
 
685 aa  347  6e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  39.22 
 
 
816 aa  347  7e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  34 
 
 
715 aa  340  5.9999999999999996e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2334  alpha-glucosidase  33.04 
 
 
715 aa  332  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  31.4 
 
 
692 aa  332  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2648  glycosy hydrolase family protein  33.04 
 
 
715 aa  331  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  35.23 
 
 
661 aa  329  1.0000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  37.45 
 
 
687 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  36.86 
 
 
815 aa  328  3e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  33.82 
 
 
845 aa  320  9e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  35.35 
 
 
656 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  33.7 
 
 
911 aa  297  4e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11054  alpha glucosidase II, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03500)  33.04 
 
 
952 aa  290  5.0000000000000004e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.464256  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05150  alpha glucosidase, putative  31.54 
 
 
956 aa  273  1e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133027  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  30.9 
 
 
836 aa  273  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  32.02 
 
 
770 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50836  alpha subunit of glucosidase  33.7 
 
 
712 aa  258  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.312978  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  30.37 
 
 
795 aa  249  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  30.29 
 
 
791 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  30.37 
 
 
795 aa  249  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  32.15 
 
 
788 aa  249  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  30.13 
 
 
791 aa  248  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  30.5 
 
 
789 aa  246  8e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  31.61 
 
 
788 aa  246  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  31.67 
 
 
788 aa  244  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  31.08 
 
 
799 aa  238  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  30.74 
 
 
791 aa  233  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  30.81 
 
 
787 aa  233  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  31.41 
 
 
806 aa  231  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  31.41 
 
 
806 aa  230  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  31.41 
 
 
806 aa  230  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  31.26 
 
 
806 aa  230  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  31.2 
 
 
790 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  30.59 
 
 
813 aa  228  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  30.51 
 
 
803 aa  227  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  30.85 
 
 
803 aa  227  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  31.51 
 
 
803 aa  226  9e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  30.98 
 
 
806 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  31.84 
 
 
784 aa  223  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  30.74 
 
 
806 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  31.81 
 
 
821 aa  221  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  30.11 
 
 
760 aa  218  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  29.23 
 
 
795 aa  214  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4624  Alpha-glucosidase  25.45 
 
 
1025 aa  214  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  28.45 
 
 
839 aa  213  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  32.9 
 
 
778 aa  209  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  29.72 
 
 
765 aa  208  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  26.74 
 
 
752 aa  202  3e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  29.46 
 
 
821 aa  200  9e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  28.55 
 
 
783 aa  198  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  29.3 
 
 
951 aa  193  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  25.54 
 
 
799 aa  193  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.77 
 
 
973 aa  191  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  27.5 
 
 
791 aa  190  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  29.74 
 
 
765 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  27.08 
 
 
1024 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  26.99 
 
 
764 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  26.99 
 
 
764 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  31.25 
 
 
969 aa  185  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  28.6 
 
 
749 aa  184  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  27.67 
 
 
836 aa  184  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 
944 aa  184  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  27.97 
 
 
775 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  26.09 
 
 
794 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  25.35 
 
 
772 aa  179  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  27.51 
 
 
840 aa  178  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  26.83 
 
 
779 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  25.95 
 
 
772 aa  175  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  24.68 
 
 
770 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  26.98 
 
 
806 aa  174  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  28.21 
 
 
777 aa  173  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  25.59 
 
 
775 aa  173  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  26.7 
 
 
695 aa  173  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>