200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1872 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  69.88 
 
 
803 aa  1151    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  59.53 
 
 
821 aa  955    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  46.67 
 
 
795 aa  698    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  50.19 
 
 
788 aa  737    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  69.75 
 
 
803 aa  1151    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  46.67 
 
 
795 aa  698    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  100 
 
 
806 aa  1659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  48.12 
 
 
784 aa  650    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  93.42 
 
 
806 aa  1554    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  65.77 
 
 
813 aa  1110    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  91.67 
 
 
806 aa  1526    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  52.39 
 
 
791 aa  726    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  93.42 
 
 
806 aa  1554    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  49.81 
 
 
791 aa  733    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  94.04 
 
 
806 aa  1565    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  91.67 
 
 
806 aa  1527    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  48.4 
 
 
787 aa  717    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  47.91 
 
 
799 aa  733    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  52.39 
 
 
791 aa  725    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  51.09 
 
 
790 aa  733    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  49.3 
 
 
788 aa  720    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  69.62 
 
 
803 aa  1153    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  49.17 
 
 
788 aa  724    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  52.25 
 
 
789 aa  721    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  34.34 
 
 
779 aa  331  3e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  32.9 
 
 
803 aa  324  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  28.22 
 
 
777 aa  318  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  29.32 
 
 
801 aa  318  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  29.49 
 
 
779 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  28.36 
 
 
797 aa  298  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  28.24 
 
 
752 aa  294  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  29.82 
 
 
828 aa  292  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03504  alpha-glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06560)  33.82 
 
 
830 aa  289  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  29.48 
 
 
779 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  28.67 
 
 
776 aa  281  5e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  30.87 
 
 
743 aa  278  2e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  27.98 
 
 
821 aa  279  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01640  glicosidase, putative  28.61 
 
 
892 aa  278  3e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  30.83 
 
 
794 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  28.87 
 
 
798 aa  275  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  29.65 
 
 
770 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  27.97 
 
 
746 aa  271  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  26.11 
 
 
799 aa  269  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  28.73 
 
 
792 aa  264  4e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  28.85 
 
 
768 aa  263  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  27.58 
 
 
845 aa  262  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  30.65 
 
 
806 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  28.94 
 
 
825 aa  257  6e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  27.9 
 
 
785 aa  256  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  29.48 
 
 
828 aa  237  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  28.06 
 
 
760 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  31.35 
 
 
765 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  31.79 
 
 
685 aa  226  2e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  25.1 
 
 
836 aa  224  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  27.24 
 
 
702 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  32.66 
 
 
765 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  30.07 
 
 
816 aa  221  5e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  31.26 
 
 
762 aa  220  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  31.28 
 
 
683 aa  218  4e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  28.31 
 
 
779 aa  216  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  29.36 
 
 
681 aa  216  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  29.56 
 
 
700 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  28.39 
 
 
804 aa  212  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  30.16 
 
 
766 aa  211  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  29.45 
 
 
763 aa  211  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  29.2 
 
 
687 aa  208  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  28.91 
 
 
760 aa  207  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  29.66 
 
 
749 aa  207  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  27.74 
 
 
771 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  26.49 
 
 
728 aa  205  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  28.95 
 
 
815 aa  204  7e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  29.09 
 
 
764 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  29.09 
 
 
764 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  29.05 
 
 
760 aa  202  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  27.91 
 
 
795 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  28.52 
 
 
823 aa  199  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  26.72 
 
 
774 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  27.2 
 
 
783 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05150  alpha glucosidase, putative  28.34 
 
 
956 aa  195  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133027  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  28.74 
 
 
772 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  27.67 
 
 
911 aa  195  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  26.36 
 
 
839 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  28.54 
 
 
772 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  27.76 
 
 
772 aa  194  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  28.54 
 
 
772 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  28.16 
 
 
780 aa  194  6e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  28.33 
 
 
772 aa  193  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  25.45 
 
 
775 aa  193  8e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  28.33 
 
 
772 aa  193  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  28.54 
 
 
772 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  28.33 
 
 
772 aa  193  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  28.33 
 
 
772 aa  193  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  27.62 
 
 
775 aa  193  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  30.53 
 
 
778 aa  193  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  28.33 
 
 
772 aa  193  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  27.7 
 
 
772 aa  193  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  28.33 
 
 
772 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  29.17 
 
 
661 aa  192  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  28.6 
 
 
772 aa  192  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  27.16 
 
 
772 aa  190  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>