201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2338 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  52.59 
 
 		 836 aa  893    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  50.94 
 
 		 821 aa  815    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  100 
 
 		 839 aa  1741    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  33.9 
 
 		 770 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  31.69 
 
 		 779 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  28.47 
 
 		 828 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  28.1 
 
 		 801 aa  327  7e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  28.69 
 
 		 836 aa  319  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  29.36 
 
 		 803 aa  314  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  27.03 
 
 		 821 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  29.05 
 
 		 777 aa  303  6.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  28.75 
 
 		 794 aa  300  6e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  26.02 
 
 		 779 aa  297  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  27.18 
 
 		 797 aa  296  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  26.16 
 
 		 746 aa  290  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  25.91 
 
 		 752 aa  289  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  29.78 
 
 		 806 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  25.94 
 
 		 799 aa  280  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  26.62 
 
 		 768 aa  277  6e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  28.22 
 
 		 798 aa  275  4.0000000000000004e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  29.64 
 
 		 779 aa  272  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  28.57 
 
 		 785 aa  270  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  29.44 
 
 		 765 aa  265  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  28.83 
 
 		 760 aa  259  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  27.35 
 
 		 792 aa  252  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  26.18 
 
 		 776 aa  251  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  28.74 
 
 		 700 aa  249  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  31.76 
 
 		 840 aa  248  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  29.17 
 
 		 765 aa  243  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  25.89 
 
 		 1024 aa  243  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  28.93 
 
 		 743 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  26.9 
 
 		 764 aa  240  6.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  26.51 
 
 		 775 aa  240  9e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  26.73 
 
 		 764 aa  239  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  30.02 
 
 		 783 aa  239  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  25.86 
 
 		 845 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  26.92 
 
 		 825 aa  234  7.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  26.48 
 
 		 791 aa  232  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2648  glycosy hydrolase family protein  25.16 
 
 		 715 aa  232  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  26.48 
 
 		 791 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  28.03 
 
 		 791 aa  231  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2334  alpha-glucosidase  24.96 
 
 		 715 aa  229  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  24 
 
 		 779 aa  228  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  27.48 
 
 		 806 aa  228  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  26.86 
 
 		 774 aa  228  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  25.86 
 
 		 795 aa  227  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  25.86 
 
 		 795 aa  227  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  29.62 
 
 		 815 aa  225  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  26.17 
 
 		 789 aa  225  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  27.59 
 
 		 757 aa  224  8e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  29.64 
 
 		 661 aa  223  9e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  27.49 
 
 		 828 aa  223  9e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  25.48 
 
 		 772 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  28.18 
 
 		 778 aa  220  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  24.92 
 
 		 787 aa  220  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.45 
 
 		 973 aa  219  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  25.21 
 
 		 728 aa  220  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  24.57 
 
 		 799 aa  219  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2529  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 		 1010 aa  218  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  27.81 
 
 		 679 aa  218  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  27.66 
 
 		 749 aa  217  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  28.22 
 
 		 690 aa  216  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  29.02 
 
 		 951 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  24.93 
 
 		 788 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  26.7 
 
 		 795 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  27.49 
 
 		 679 aa  213  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  27.31 
 
 		 679 aa  212  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  25.94 
 
 		 790 aa  212  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  24.76 
 
 		 692 aa  211  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  27.16 
 
 		 661 aa  211  6e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  27.12 
 
 		 679 aa  211  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.26 
 
 		 788 aa  210  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  27.15 
 
 		 799 aa  210  9e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  24.79 
 
 		 780 aa  209  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  27.12 
 
 		 679 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  27.12 
 
 		 679 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  27.79 
 
 		 816 aa  209  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  25.57 
 
 		 760 aa  208  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.14 
 
 		 791 aa  209  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.43 
 
 		 788 aa  207  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  24.38 
 
 		 784 aa  206  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  28.5 
 
 		 969 aa  205  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  26.07 
 
 		 687 aa  206  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  26.95 
 
 		 695 aa  204  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  26.57 
 
 		 699 aa  203  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  27.36 
 
 		 685 aa  202  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  29.49 
 
 		 668 aa  202  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  25.84 
 
 		 777 aa  202  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  26.22 
 
 		 766 aa  201  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  25.37 
 
 		 775 aa  201  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  25.73 
 
 		 771 aa  201  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  28.21 
 
 		 656 aa  201  7e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  25.65 
 
 		 821 aa  199  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  24.65 
 
 		 770 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 		 944 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  27.48 
 
 		 794 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  27.43 
 
 		 683 aa  197  6e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  24.47 
 
 		 772 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  24.47 
 
 		 772 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  24.31 
 
 		 772 aa  196  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>