198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1611 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  100 
 
 
702 aa  1425    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  56.98 
 
 
715 aa  791    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  41.5 
 
 
728 aa  489  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  39.67 
 
 
752 aa  475  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  39.73 
 
 
777 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2334  alpha-glucosidase  39.8 
 
 
715 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2648  glycosy hydrolase family protein  39.15 
 
 
715 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  39.08 
 
 
801 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  38.35 
 
 
779 aa  433  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  35.39 
 
 
803 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  38.89 
 
 
776 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  36.46 
 
 
768 aa  409  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  36.5 
 
 
779 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  36.92 
 
 
821 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  36.5 
 
 
692 aa  405  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  34.79 
 
 
794 aa  401  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  35.21 
 
 
792 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  33.44 
 
 
785 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  34.91 
 
 
779 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  35.81 
 
 
797 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  35.36 
 
 
746 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  37.85 
 
 
743 aa  383  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  35.49 
 
 
799 aa  379  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  33.74 
 
 
825 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  32.87 
 
 
828 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  35.3 
 
 
816 aa  360  7e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  35.69 
 
 
762 aa  358  2.9999999999999997e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  31.85 
 
 
798 aa  330  8e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  31.28 
 
 
828 aa  318  3e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  31.79 
 
 
845 aa  314  4.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  30.03 
 
 
806 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  32.26 
 
 
661 aa  306  9.000000000000001e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  29.74 
 
 
700 aa  303  6.000000000000001e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  31.73 
 
 
836 aa  301  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  30.81 
 
 
815 aa  291  3e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  31.88 
 
 
911 aa  283  6.000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  30.05 
 
 
656 aa  283  6.000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  31.13 
 
 
685 aa  281  4e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  31.13 
 
 
687 aa  277  6e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  29.58 
 
 
683 aa  266  8.999999999999999e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  30.03 
 
 
770 aa  258  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.62 
 
 
788 aa  257  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  29.84 
 
 
795 aa  256  7e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  29.84 
 
 
795 aa  256  7e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.82 
 
 
788 aa  257  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.19 
 
 
788 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.77 
 
 
791 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50836  alpha subunit of glucosidase  29.22 
 
 
712 aa  253  9.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.312978  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.67 
 
 
787 aa  250  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  27.75 
 
 
791 aa  250  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  27.6 
 
 
791 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05150  alpha glucosidase, putative  28.84 
 
 
956 aa  248  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133027  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11054  alpha glucosidase II, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03500)  29.05 
 
 
952 aa  248  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.464256  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  27.45 
 
 
789 aa  246  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  27.75 
 
 
790 aa  243  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  28.73 
 
 
799 aa  234  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  27.42 
 
 
806 aa  228  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  27.12 
 
 
806 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  26.3 
 
 
806 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  27.24 
 
 
806 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  30.65 
 
 
1024 aa  216  8e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 
806 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 
806 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07345  Alpha/beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR7]  26.62 
 
 
894 aa  215  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0209313  normal  0.448 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  28.62 
 
 
765 aa  213  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  26.72 
 
 
821 aa  212  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  26.92 
 
 
784 aa  211  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  26.4 
 
 
803 aa  211  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  25.89 
 
 
803 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  26.69 
 
 
780 aa  206  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  26.68 
 
 
803 aa  206  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  27.24 
 
 
760 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  26.97 
 
 
775 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  26.83 
 
 
764 aa  200  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01310  alpha-glucosidase precursor, putative  27.33 
 
 
971 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.538823  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  26.83 
 
 
764 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  27.55 
 
 
765 aa  198  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  26.34 
 
 
813 aa  195  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  25.4 
 
 
749 aa  193  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4624  Alpha-glucosidase  25.95 
 
 
1025 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  24.31 
 
 
779 aa  188  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  28.76 
 
 
712 aa  188  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  27.66 
 
 
840 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  30.12 
 
 
757 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  27.19 
 
 
784 aa  184  6e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 
799 aa  183  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  26.11 
 
 
763 aa  183  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  25.79 
 
 
772 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  25 
 
 
780 aa  181  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  24.32 
 
 
771 aa  181  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  25.79 
 
 
681 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  24.46 
 
 
839 aa  180  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  28.5 
 
 
969 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  25.29 
 
 
770 aa  177  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  25.53 
 
 
777 aa  177  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  26.21 
 
 
804 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  28.08 
 
 
944 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  23.6 
 
 
775 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  24.88 
 
 
778 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00941  alpha-1,4-glucosidase (Eurofung)  24.46 
 
 
839 aa  174  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>