201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2455 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  56.37 
 
 
775 aa  887    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  46.19 
 
 
780 aa  701    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  52.33 
 
 
763 aa  838    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  53.82 
 
 
772 aa  868    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  53.04 
 
 
772 aa  859    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  56.33 
 
 
771 aa  892    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  53.17 
 
 
772 aa  860    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  100 
 
 
770 aa  1602    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  52.9 
 
 
777 aa  836    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  57.07 
 
 
764 aa  897    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  51.88 
 
 
804 aa  798    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  54.32 
 
 
772 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  53.17 
 
 
772 aa  860    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  49.93 
 
 
712 aa  709    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  58.51 
 
 
775 aa  936    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  54.32 
 
 
772 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  50.2 
 
 
760 aa  781    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  53.27 
 
 
775 aa  823    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  48.24 
 
 
823 aa  711    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  54.26 
 
 
766 aa  830    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  54.32 
 
 
772 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  54.14 
 
 
772 aa  858    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  54.98 
 
 
749 aa  858    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  56.94 
 
 
764 aa  897    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  52.34 
 
 
763 aa  761    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  54.67 
 
 
681 aa  783    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  52.99 
 
 
760 aa  817    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  53.04 
 
 
772 aa  858    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  53.04 
 
 
772 aa  859    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  53.04 
 
 
772 aa  859    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  60.55 
 
 
772 aa  958    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  54.32 
 
 
772 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  58.86 
 
 
774 aa  907    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  60.22 
 
 
780 aa  941    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  54.09 
 
 
779 aa  865    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  53.69 
 
 
772 aa  867    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  54.32 
 
 
772 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  42.71 
 
 
608 aa  509  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  34.49 
 
 
760 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  39.93 
 
 
765 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  35.33 
 
 
765 aa  432  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  40.35 
 
 
795 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  35.7 
 
 
799 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  35.19 
 
 
757 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  38.75 
 
 
794 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  36.41 
 
 
695 aa  342  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  35.87 
 
 
778 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  32.33 
 
 
752 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  30.13 
 
 
770 aa  287  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  29.59 
 
 
784 aa  286  1.0000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  29.58 
 
 
792 aa  270  5e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  31.41 
 
 
755 aa  264  4e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  30.49 
 
 
768 aa  264  4.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  28.01 
 
 
779 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  28.86 
 
 
801 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  29.88 
 
 
779 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  27.33 
 
 
828 aa  255  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  25.42 
 
 
799 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  27.61 
 
 
836 aa  240  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  25.51 
 
 
752 aa  237  8e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  26.75 
 
 
776 aa  233  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  26.35 
 
 
746 aa  232  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  28.1 
 
 
821 aa  232  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  26.38 
 
 
803 aa  231  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  30.07 
 
 
779 aa  228  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  27.52 
 
 
797 aa  227  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  26.99 
 
 
785 aa  226  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  24.58 
 
 
777 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  28.79 
 
 
806 aa  224  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  27.94 
 
 
794 aa  223  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  25 
 
 
743 aa  222  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  24.27 
 
 
836 aa  207  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  26.68 
 
 
813 aa  206  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  26.66 
 
 
700 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  30.53 
 
 
668 aa  201  5e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  25.18 
 
 
845 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  26.39 
 
 
679 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  24.65 
 
 
839 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  24.74 
 
 
783 aa  197  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  26.92 
 
 
816 aa  196  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  28.04 
 
 
679 aa  195  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  24.84 
 
 
692 aa  195  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  24.01 
 
 
825 aa  194  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  28.04 
 
 
679 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  27.86 
 
 
679 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  27.86 
 
 
679 aa  193  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  27.86 
 
 
679 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  24.5 
 
 
828 aa  192  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2648  glycosy hydrolase family protein  24.33 
 
 
715 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2334  alpha-glucosidase  23.81 
 
 
715 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  25.97 
 
 
695 aa  191  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  26.73 
 
 
1024 aa  190  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  27.96 
 
 
803 aa  189  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  26.29 
 
 
661 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  26.46 
 
 
661 aa  185  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  25.1 
 
 
806 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  25.97 
 
 
815 aa  185  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  27.27 
 
 
803 aa  185  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  24.22 
 
 
806 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  26.12 
 
 
806 aa  183  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>