200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10130 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  50.14 
 
 		 780 aa  727    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  100 
 
 		 766 aa  1547    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  63.65 
 
 		 771 aa  958    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  65.16 
 
 		 749 aa  945    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  54.63 
 
 		 772 aa  847    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  54.77 
 
 		 772 aa  847    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  68.04 
 
 		 760 aa  1027    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  54.77 
 
 		 772 aa  847    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  54.69 
 
 		 772 aa  849    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  52.14 
 
 		 775 aa  832    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  64.01 
 
 		 681 aa  885    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  53.4 
 
 		 772 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  60.14 
 
 		 775 aa  867    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  53.92 
 
 		 764 aa  848    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  65.89 
 
 		 775 aa  959    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  50.56 
 
 		 712 aa  712    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  53.01 
 
 		 772 aa  851    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  49.42 
 
 		 823 aa  741    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  53.67 
 
 		 772 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  53.4 
 
 		 772 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  63.49 
 
 		 777 aa  945    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  54.16 
 
 		 763 aa  833    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  55.03 
 
 		 772 aa  847    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  72.89 
 
 		 760 aa  1097    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  53.52 
 
 		 764 aa  838    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  54.26 
 
 		 770 aa  830    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  67.39 
 
 		 763 aa  949    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  67.98 
 
 		 804 aa  987    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  54.63 
 
 		 772 aa  845    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  54.63 
 
 		 772 aa  846    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  60.61 
 
 		 779 aa  850    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  62.89 
 
 		 774 aa  957    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  52.67 
 
 		 780 aa  792    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  53.67 
 
 		 772 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  54.63 
 
 		 772 aa  845    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  54.63 
 
 		 772 aa  847    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  53.4 
 
 		 772 aa  833    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  46.41 
 
 		 608 aa  568  1e-160  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  38.55 
 
 		 760 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  41.22 
 
 		 765 aa  429  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  40.72 
 
 		 765 aa  415  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  35.75 
 
 		 757 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  36.59 
 
 		 794 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  33.44 
 
 		 799 aa  351  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  39.58 
 
 		 795 aa  351  4e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  35.06 
 
 		 778 aa  321  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  33.82 
 
 		 695 aa  300  7e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  31.89 
 
 		 752 aa  296  7e-79  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  30.41 
 
 		 784 aa  291  3e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  31.14 
 
 		 803 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  30.83 
 
 		 755 aa  269  1e-70  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  31.13 
 
 		 770 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  31.47 
 
 		 828 aa  261  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  29.23 
 
 		 768 aa  256  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  32.36 
 
 		 779 aa  243  9e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  28.14 
 
 		 746 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  28.81 
 
 		 836 aa  240  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  29.37 
 
 		 801 aa  236  9e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  28.91 
 
 		 779 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  28.55 
 
 		 792 aa  235  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  29.78 
 
 		 821 aa  232  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  27.19 
 
 		 752 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  27.72 
 
 		 794 aa  221  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  25.6 
 
 		 777 aa  218  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  27.84 
 
 		 806 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  31 
 
 		 806 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  27.88 
 
 		 779 aa  215  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  26.28 
 
 		 797 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  26.14 
 
 		 776 aa  214  5.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  26.73 
 
 		 743 aa  213  1e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  30.16 
 
 		 806 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  30.71 
 
 		 806 aa  212  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  30.71 
 
 		 806 aa  212  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  28.07 
 
 		 799 aa  210  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  30.31 
 
 		 806 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  28.99 
 
 		 785 aa  208  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  29.76 
 
 		 806 aa  207  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  31.03 
 
 		 803 aa  205  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  30.04 
 
 		 813 aa  205  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  30.78 
 
 		 679 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  30.6 
 
 		 679 aa  204  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  30.6 
 
 		 679 aa  203  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  30.6 
 
 		 679 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  30.6 
 
 		 679 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  28.96 
 
 		 803 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  26.22 
 
 		 839 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4263  alpha-glucosidase  28.54 
 
 		 678 aa  200  7.999999999999999e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  27.19 
 
 		 679 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  28.18 
 
 		 816 aa  198  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.28 
 
 		 788 aa  197  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  28.78 
 
 		 803 aa  197  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4108  glycoside hydrolase family 31  27.06 
 
 		 678 aa  196  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4401  alpha-glucosidase  27.06 
 
 		 678 aa  196  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  29.89 
 
 		 695 aa  195  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  25.95 
 
 		 845 aa  195  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03763  alpha-glucosidase  26.89 
 
 		 667 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03712  hypothetical protein  27.98 
 
 		 654 aa  194  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5324  alpha-glucosidase  26.72 
 
 		 678 aa  193  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539055 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  30.71 
 
 		 690 aa  192  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  25.45 
 
 		 836 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>