200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32530 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  49.6 
 
 
760 aa  717    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  45.78 
 
 
772 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  51.77 
 
 
780 aa  724    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  45.34 
 
 
763 aa  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  49.42 
 
 
766 aa  741    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  50.06 
 
 
764 aa  750    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  46.19 
 
 
772 aa  690    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  46.06 
 
 
772 aa  689    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  46.11 
 
 
772 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  46.06 
 
 
772 aa  689    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  45.93 
 
 
772 aa  687    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  51.71 
 
 
760 aa  702    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  50.77 
 
 
749 aa  712    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  45.93 
 
 
772 aa  686    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  45.65 
 
 
772 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  48.84 
 
 
772 aa  728    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  52.09 
 
 
777 aa  733    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  45.65 
 
 
772 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  100 
 
 
823 aa  1703    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  51.82 
 
 
681 aa  722    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  47.46 
 
 
775 aa  712    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  51.85 
 
 
775 aa  752    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  46.39 
 
 
775 aa  719    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  45.65 
 
 
772 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  46.83 
 
 
772 aa  698    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  48.24 
 
 
770 aa  711    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  49.94 
 
 
764 aa  745    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  47.68 
 
 
771 aa  697    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  52.78 
 
 
763 aa  693    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  45.93 
 
 
772 aa  689    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  45.93 
 
 
772 aa  688    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  51.65 
 
 
774 aa  753    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  50.97 
 
 
779 aa  715    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  46.38 
 
 
780 aa  701    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  52.26 
 
 
804 aa  756    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  46.19 
 
 
772 aa  690    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  45.13 
 
 
712 aa  606  9.999999999999999e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  38.88 
 
 
760 aa  415  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  35.82 
 
 
765 aa  411  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  53.37 
 
 
608 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  40.61 
 
 
765 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  37.79 
 
 
757 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  36.33 
 
 
799 aa  364  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  35.74 
 
 
794 aa  360  6e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  35.29 
 
 
795 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  33.44 
 
 
778 aa  324  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  32.71 
 
 
695 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  33.23 
 
 
784 aa  301  3e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  30.72 
 
 
752 aa  281  3e-74  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  29.84 
 
 
770 aa  270  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  31.31 
 
 
836 aa  267  7e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  30.26 
 
 
755 aa  263  1e-68  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  29.4 
 
 
779 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  27.55 
 
 
776 aa  238  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  27.2 
 
 
828 aa  233  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  26.88 
 
 
801 aa  232  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  28.37 
 
 
806 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  30.6 
 
 
803 aa  229  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  28.47 
 
 
821 aa  227  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  27.05 
 
 
777 aa  224  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  28.42 
 
 
779 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  28.68 
 
 
779 aa  221  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  28.52 
 
 
746 aa  219  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  27.44 
 
 
797 aa  218  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  28.01 
 
 
794 aa  218  5e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  26.24 
 
 
752 aa  217  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  28.36 
 
 
799 aa  217  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  27.56 
 
 
792 aa  206  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  29.81 
 
 
668 aa  205  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  29.85 
 
 
803 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  26.18 
 
 
768 aa  201  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  28.55 
 
 
1024 aa  201  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  28.52 
 
 
806 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 
813 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  27.34 
 
 
743 aa  197  5.000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  30.59 
 
 
806 aa  197  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  28.98 
 
 
803 aa  197  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  30 
 
 
806 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  25.83 
 
 
798 aa  195  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 
806 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 
806 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  30.14 
 
 
803 aa  196  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  28.59 
 
 
783 aa  195  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  30.39 
 
 
806 aa  195  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  29.71 
 
 
695 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  26.31 
 
 
700 aa  191  5e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  29.35 
 
 
840 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  28.54 
 
 
661 aa  188  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  24.78 
 
 
845 aa  187  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  27.92 
 
 
815 aa  187  9e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  27.09 
 
 
816 aa  187  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  26.63 
 
 
836 aa  185  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 
699 aa  185  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  23.76 
 
 
839 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  26.8 
 
 
795 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  26.8 
 
 
795 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  25.66 
 
 
806 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  28.63 
 
 
951 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03763  alpha-glucosidase  26.53 
 
 
667 aa  179  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4250  alpha-glucosidase  25.89 
 
 
678 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>