200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4401 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4229  alpha-glucosidase  87.32 
 
 
678 aa  1262    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03763  alpha-glucosidase  99.69 
 
 
667 aa  1365    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4108  glycoside hydrolase family 31  99.85 
 
 
678 aa  1417    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4341  alpha-glucosidase  87.02 
 
 
678 aa  1262    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4250  alpha-glucosidase  87.17 
 
 
678 aa  1259    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4407  alpha-glucosidase  87.61 
 
 
678 aa  1266    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264935  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03712  hypothetical protein  99.69 
 
 
654 aa  1365    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4401  alpha-glucosidase  100 
 
 
678 aa  1419    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4295  alpha-glucosidase  87.17 
 
 
678 aa  1261    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4263  alpha-glucosidase  97.49 
 
 
678 aa  1385    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5324  alpha-glucosidase  97.49 
 
 
678 aa  1390    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.539055 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2446  alpha-glucosidase  42.16 
 
 
669 aa  554  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1663  alpha-glucosidase  42.35 
 
 
681 aa  553  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2586  alpha-glucosidase  36.24 
 
 
738 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2463  alpha-glucosidase  36.49 
 
 
768 aa  355  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_956  predicted protein  36.13 
 
 
577 aa  340  5e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00413725  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  27.85 
 
 
764 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  27.52 
 
 
764 aa  211  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  26.19 
 
 
681 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  27.32 
 
 
779 aa  201  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  27.06 
 
 
766 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  26.63 
 
 
772 aa  193  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  26.06 
 
 
760 aa  189  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  26.39 
 
 
749 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  26.36 
 
 
774 aa  185  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  24.59 
 
 
772 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  25 
 
 
772 aa  182  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  30.54 
 
 
757 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  28.49 
 
 
771 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  26.78 
 
 
775 aa  181  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  27 
 
 
712 aa  180  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  24.41 
 
 
772 aa  180  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  24.41 
 
 
772 aa  180  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  26.33 
 
 
775 aa  180  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  25.25 
 
 
760 aa  180  9e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  26.78 
 
 
780 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  26.33 
 
 
765 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  25.55 
 
 
839 aa  179  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  26.53 
 
 
823 aa  179  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  26.42 
 
 
763 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  26.52 
 
 
777 aa  177  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  24.04 
 
 
772 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  24.23 
 
 
772 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  24.55 
 
 
772 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  24.55 
 
 
772 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  24.55 
 
 
772 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  24.55 
 
 
772 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  24.55 
 
 
772 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  24.55 
 
 
772 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  24.36 
 
 
772 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  25.7 
 
 
804 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  24.36 
 
 
772 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  26.67 
 
 
775 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  25.9 
 
 
765 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  25.27 
 
 
760 aa  172  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  28.6 
 
 
770 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  25.61 
 
 
770 aa  169  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  24.23 
 
 
763 aa  168  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  26.03 
 
 
836 aa  167  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  26.73 
 
 
778 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  27.63 
 
 
801 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  24.59 
 
 
799 aa  163  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  24.02 
 
 
752 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  25.94 
 
 
795 aa  163  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  25.12 
 
 
792 aa  161  3e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1145  glycoside hydrolase family protein  32.12 
 
 
739 aa  161  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0954  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 
831 aa  156  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 
813 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  25.95 
 
 
836 aa  153  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  28.28 
 
 
743 aa  152  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  26.8 
 
 
806 aa  151  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  25.68 
 
 
825 aa  151  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  26.48 
 
 
806 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  30.53 
 
 
695 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  28.73 
 
 
806 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  24.05 
 
 
821 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  24.52 
 
 
752 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  25.98 
 
 
806 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  27.59 
 
 
779 aa  148  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  27.39 
 
 
803 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  24.52 
 
 
780 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  25.7 
 
 
794 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  24.13 
 
 
768 aa  145  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  25.09 
 
 
779 aa  144  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  27.15 
 
 
803 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 
806 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 
806 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  25.23 
 
 
755 aa  142  3e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  27.43 
 
 
803 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4334  glycoside hydrolase family protein  28.18 
 
 
616 aa  137  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  27.51 
 
 
797 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  25.12 
 
 
806 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  25.57 
 
 
746 aa  135  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  28 
 
 
679 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  28 
 
 
679 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  24.34 
 
 
828 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  27.75 
 
 
679 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  26.43 
 
 
679 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  27.18 
 
 
799 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  26.43 
 
 
679 aa  132  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>