201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4029 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  99.35 
 
 		 772 aa  1610    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  48.73 
 
 		 780 aa  704    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  54.3 
 
 		 749 aa  853    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  49.94 
 
 		 764 aa  818    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  50.81 
 
 		 760 aa  786    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  88.73 
 
 		 772 aa  1468    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  88.86 
 
 		 772 aa  1469    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  53.57 
 
 		 804 aa  828    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  54.71 
 
 		 771 aa  892    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  88.86 
 
 		 772 aa  1473    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  88.73 
 
 		 772 aa  1468    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  53.67 
 
 		 766 aa  835    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  54.32 
 
 		 770 aa  863    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  54.13 
 
 		 772 aa  873    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  55.63 
 
 		 760 aa  867    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  88.86 
 
 		 772 aa  1469    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  99.35 
 
 		 772 aa  1606    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  54.37 
 
 		 775 aa  851    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  48.03 
 
 		 712 aa  687    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  88.99 
 
 		 772 aa  1471    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  57.12 
 
 		 775 aa  902    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  100 
 
 		 772 aa  1616    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  45.78 
 
 		 823 aa  681    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  86.92 
 
 		 763 aa  1424    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  86.01 
 
 		 772 aa  1425    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  49.42 
 
 		 764 aa  809    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  53.63 
 
 		 777 aa  863    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  52.95 
 
 		 763 aa  785    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  54.52 
 
 		 681 aa  767    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  88.73 
 
 		 772 aa  1467    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  88.86 
 
 		 772 aa  1470    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  52.2 
 
 		 775 aa  868    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  56.07 
 
 		 774 aa  930    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  99.48 
 
 		 772 aa  1607    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  53.2 
 
 		 780 aa  839    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  99.48 
 
 		 772 aa  1610    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  55.84 
 
 		 779 aa  890    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  41.76 
 
 		 608 aa  506  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  36.85 
 
 		 760 aa  439  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  36.36 
 
 		 765 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  38.89 
 
 		 765 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  38.75 
 
 		 794 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  38.31 
 
 		 757 aa  382  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  37.37 
 
 		 795 aa  375  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  34.58 
 
 		 799 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  35.1 
 
 		 695 aa  331  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  33.52 
 
 		 778 aa  323  9.000000000000001e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  29.52 
 
 		 752 aa  300  9e-80  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  28.97 
 
 		 784 aa  294  4e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  29.82 
 
 		 779 aa  265  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  25.67 
 
 		 755 aa  264  6e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  28.66 
 
 		 770 aa  263  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  28.08 
 
 		 768 aa  260  7e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  27.04 
 
 		 779 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  28.53 
 
 		 803 aa  246  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  26.57 
 
 		 792 aa  245  3e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  26.27 
 
 		 828 aa  242  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  27.03 
 
 		 799 aa  240  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  27.23 
 
 		 836 aa  236  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  26.83 
 
 		 821 aa  232  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  28.31 
 
 		 801 aa  229  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  27.03 
 
 		 779 aa  216  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  25.76 
 
 		 794 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  28.04 
 
 		 797 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  25.84 
 
 		 746 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  25.68 
 
 		 785 aa  213  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  24.18 
 
 		 776 aa  211  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  27.99 
 
 		 743 aa  206  1e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  28.19 
 
 		 813 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  26.89 
 
 		 798 aa  205  3e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  26.6 
 
 		 752 aa  204  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  23.97 
 
 		 777 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  28.73 
 
 		 803 aa  200  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  25.17 
 
 		 815 aa  198  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  26.89 
 
 		 806 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  26.89 
 
 		 806 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  28.52 
 
 		 803 aa  197  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  26.61 
 
 		 806 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  24.63 
 
 		 839 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  28.54 
 
 		 806 aa  194  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  26.18 
 
 		 806 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  26.15 
 
 		 700 aa  191  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  26.22 
 
 		 695 aa  191  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  24.04 
 
 		 728 aa  190  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  27.91 
 
 		 806 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  27.05 
 
 		 806 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  24.78 
 
 		 1024 aa  188  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  28.49 
 
 		 821 aa  187  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  27.45 
 
 		 803 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  25.6 
 
 		 816 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  27.29 
 
 		 656 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  24.62 
 
 		 845 aa  184  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  26.92 
 
 		 661 aa  183  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03763  alpha-glucosidase  24.41 
 
 		 667 aa  181  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03712  hypothetical protein  24.41 
 
 		 654 aa  181  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  23.8 
 
 		 692 aa  180  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4108  glycoside hydrolase family 31  24.41 
 
 		 678 aa  180  9e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4263  alpha-glucosidase  24.59 
 
 		 678 aa  180  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4401  alpha-glucosidase  24.41 
 
 		 678 aa  180  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  27.98 
 
 		 840 aa  180  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>