203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0055 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  88.47 
 
 		 772 aa  1466    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  98.58 
 
 		 772 aa  1596    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  48.94 
 
 		 780 aa  705    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  52.35 
 
 		 760 aa  792    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  97.54 
 
 		 763 aa  1566    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  100 
 
 		 772 aa  1617    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  99.87 
 
 		 772 aa  1616    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  100 
 
 		 772 aa  1617    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  55.32 
 
 		 749 aa  858    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  54.13 
 
 		 777 aa  870    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  55.93 
 
 		 779 aa  892    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  52.65 
 
 		 772 aa  874    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  99.87 
 
 		 772 aa  1616    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  50.52 
 
 		 764 aa  822    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  52.89 
 
 		 804 aa  820    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  47.61 
 
 		 712 aa  681    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  53.17 
 
 		 770 aa  860    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  88.86 
 
 		 772 aa  1469    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  98.19 
 
 		 772 aa  1591    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  56.81 
 
 		 775 aa  890    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  88.73 
 
 		 772 aa  1467    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  46.06 
 
 		 823 aa  689    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  88.47 
 
 		 772 aa  1464    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  55.08 
 
 		 760 aa  867    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  53.66 
 
 		 775 aa  852    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  54.66 
 
 		 771 aa  895    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  83.94 
 
 		 772 aa  1395    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  50.26 
 
 		 764 aa  815    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  88.47 
 
 		 772 aa  1461    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  52.47 
 
 		 763 aa  780    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  53.48 
 
 		 681 aa  758    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  99.74 
 
 		 772 aa  1615    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  99.74 
 
 		 772 aa  1615    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  51.81 
 
 		 775 aa  870    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  57.22 
 
 		 774 aa  921    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  54.77 
 
 		 766 aa  847    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  51.03 
 
 		 780 aa  839    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  40.94 
 
 		 608 aa  505  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  38.13 
 
 		 760 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  36.02 
 
 		 765 aa  429  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  40.7 
 
 		 765 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  39.53 
 
 		 794 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  38.38 
 
 		 757 aa  383  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  38.27 
 
 		 795 aa  379  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  34.63 
 
 		 799 aa  371  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  34.73 
 
 		 695 aa  333  6e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  32.34 
 
 		 778 aa  332  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  29.63 
 
 		 752 aa  304  4.0000000000000003e-81  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  29.25 
 
 		 784 aa  295  3e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  29.43 
 
 		 755 aa  266  1e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  29.01 
 
 		 770 aa  260  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  28.27 
 
 		 768 aa  258  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  29.41 
 
 		 779 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  26.58 
 
 		 792 aa  244  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  28.8 
 
 		 779 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  27.35 
 
 		 828 aa  241  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  29.63 
 
 		 803 aa  238  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  27.27 
 
 		 836 aa  235  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  27.53 
 
 		 801 aa  231  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  29.16 
 
 		 799 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  27.06 
 
 		 821 aa  229  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  28.22 
 
 		 797 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  26.46 
 
 		 794 aa  218  5e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  24.43 
 
 		 776 aa  217  7e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  27.36 
 
 		 785 aa  215  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  26.06 
 
 		 746 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  28.38 
 
 		 813 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  26.78 
 
 		 779 aa  209  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  28.49 
 
 		 798 aa  204  7e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  25.8 
 
 		 752 aa  203  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  27.45 
 
 		 743 aa  202  3e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  23.66 
 
 		 777 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  24.47 
 
 		 839 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  28.08 
 
 		 806 aa  194  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  28.08 
 
 		 806 aa  194  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  28.08 
 
 		 806 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  28.33 
 
 		 806 aa  193  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  28.18 
 
 		 803 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  27.34 
 
 		 695 aa  190  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  26.79 
 
 		 803 aa  191  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  26.5 
 
 		 806 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  25.13 
 
 		 700 aa  189  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  28.24 
 
 		 821 aa  189  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  27.24 
 
 		 806 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  25.43 
 
 		 679 aa  188  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  23.21 
 
 		 728 aa  188  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  25.58 
 
 		 806 aa  188  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  24.97 
 
 		 828 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  27.95 
 
 		 803 aa  184  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  25.34 
 
 		 845 aa  182  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  25.33 
 
 		 783 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  25.88 
 
 		 806 aa  180  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  25.15 
 
 		 1024 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  26.03 
 
 		 656 aa  179  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.301391 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  24.39 
 
 		 699 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.845548 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  26.69 
 
 		 661 aa  178  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4263  alpha-glucosidase  24.73 
 
 		 678 aa  178  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  26.43 
 
 		 815 aa  177  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  25.66 
 
 		 661 aa  177  5e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  25.55 
 
 		 816 aa  177  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>