195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0073 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  100 
 
 
608 aa  1262    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  46.41 
 
 
766 aa  568  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  45.95 
 
 
804 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  45.72 
 
 
760 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  43.4 
 
 
772 aa  550  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  45.59 
 
 
775 aa  551  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  45.52 
 
 
775 aa  547  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  45.45 
 
 
771 aa  548  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  45.98 
 
 
763 aa  532  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  41.72 
 
 
764 aa  530  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  41.57 
 
 
764 aa  527  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  42.14 
 
 
775 aa  521  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  42.71 
 
 
770 aa  509  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  41.08 
 
 
772 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  41.76 
 
 
772 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  40.79 
 
 
772 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  40.94 
 
 
772 aa  505  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  40.79 
 
 
772 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  41.47 
 
 
772 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  41.47 
 
 
772 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  40.94 
 
 
772 aa  504  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  40.79 
 
 
772 aa  505  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  41.62 
 
 
772 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  40.94 
 
 
772 aa  505  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  41.47 
 
 
772 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  40.5 
 
 
772 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  40.18 
 
 
763 aa  491  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  41.03 
 
 
772 aa  490  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  42.71 
 
 
749 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  42.37 
 
 
777 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  40.03 
 
 
780 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  41.9 
 
 
681 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  57.81 
 
 
774 aa  442  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  41.3 
 
 
760 aa  442  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  38.3 
 
 
779 aa  418  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  53.37 
 
 
823 aa  407  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  37.85 
 
 
780 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  50.13 
 
 
712 aa  377  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  31.88 
 
 
765 aa  290  8e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  38.4 
 
 
760 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  30.61 
 
 
794 aa  245  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  32.06 
 
 
757 aa  242  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  30.8 
 
 
799 aa  241  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  30.62 
 
 
795 aa  232  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  36.84 
 
 
765 aa  229  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  29.8 
 
 
695 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  27.56 
 
 
778 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  30.9 
 
 
752 aa  183  9.000000000000001e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  36.98 
 
 
784 aa  171  4e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  25.96 
 
 
770 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  28.27 
 
 
755 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  23.99 
 
 
768 aa  150  9e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  21.69 
 
 
792 aa  147  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  25.79 
 
 
779 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  32.53 
 
 
813 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  24.29 
 
 
668 aa  134  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  25.15 
 
 
803 aa  133  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  23.27 
 
 
679 aa  132  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4250  alpha-glucosidase  33.45 
 
 
678 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4341  alpha-glucosidase  33.45 
 
 
678 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4407  alpha-glucosidase  33.45 
 
 
678 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264935  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4295  alpha-glucosidase  33.09 
 
 
678 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4229  alpha-glucosidase  32.97 
 
 
678 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  24.25 
 
 
661 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4263  alpha-glucosidase  32.37 
 
 
678 aa  125  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  24.45 
 
 
828 aa  124  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4401  alpha-glucosidase  32.37 
 
 
678 aa  124  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  29.57 
 
 
803 aa  124  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4108  glycoside hydrolase family 31  32.37 
 
 
678 aa  124  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  29.81 
 
 
803 aa  124  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  23.35 
 
 
836 aa  124  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5324  alpha-glucosidase  31.9 
 
 
678 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.539055 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03712  hypothetical protein  32.01 
 
 
654 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03763  alpha-glucosidase  32.01 
 
 
667 aa  122  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  22.88 
 
 
779 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  30.1 
 
 
679 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  30.1 
 
 
679 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  25.47 
 
 
799 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  29.32 
 
 
803 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  27.3 
 
 
806 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  29.12 
 
 
845 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  29.28 
 
 
821 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  29.77 
 
 
679 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  29.43 
 
 
679 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  29.43 
 
 
679 aa  117  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  25.2 
 
 
839 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  23.89 
 
 
801 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  26.74 
 
 
951 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  29.13 
 
 
806 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  24.8 
 
 
746 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  24.86 
 
 
821 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  28.8 
 
 
806 aa  114  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  28.77 
 
 
815 aa  114  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 
806 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  24.25 
 
 
836 aa  113  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  23.42 
 
 
779 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1663  alpha-glucosidase  26.64 
 
 
681 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  23.37 
 
 
785 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  29.7 
 
 
699 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  23 
 
 
821 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>