200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1013 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  69.38 
 
 		 806 aa  1157    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  48.34 
 
 		 795 aa  745    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  50.58 
 
 		 788 aa  752    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  82.42 
 
 		 803 aa  1384    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  69.88 
 
 		 806 aa  1151    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  100 
 
 		 803 aa  1665    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  50.32 
 
 		 788 aa  756    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  46.41 
 
 		 784 aa  684    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  68.88 
 
 		 806 aa  1146    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  50.06 
 
 		 791 aa  735    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  50.93 
 
 		 791 aa  756    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  49.87 
 
 		 788 aa  753    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  48.34 
 
 		 795 aa  745    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  68.83 
 
 		 806 aa  1145    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  68.88 
 
 		 806 aa  1146    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  60.22 
 
 		 821 aa  987    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  71.76 
 
 		 813 aa  1223    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  96.39 
 
 		 803 aa  1608    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  68.58 
 
 		 806 aa  1144    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  49.09 
 
 		 787 aa  754    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  49.42 
 
 		 799 aa  762    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  51.06 
 
 		 791 aa  757    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  50.32 
 
 		 790 aa  761    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  50.8 
 
 		 789 aa  752    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  32.37 
 
 		 803 aa  333  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  34.63 
 
 		 779 aa  325  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  31.2 
 
 		 777 aa  313  5.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  28.51 
 
 		 801 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  28.38 
 
 		 797 aa  300  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  27.38 
 
 		 799 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  29.15 
 
 		 779 aa  297  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  27.52 
 
 		 752 aa  293  6e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  31.2 
 
 		 743 aa  290  7e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  32.25 
 
 		 746 aa  290  9e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  28.84 
 
 		 828 aa  290  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  31 
 
 		 794 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  28.62 
 
 		 792 aa  286  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  29.64 
 
 		 776 aa  281  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  28.86 
 
 		 785 aa  280  8e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  30.07 
 
 		 768 aa  280  9e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  27.6 
 
 		 821 aa  278  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03504  alpha-glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06560)  27.42 
 
 		 830 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01640  glicosidase, putative  29.79 
 
 		 892 aa  271  4e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  28.85 
 
 		 779 aa  269  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  29.36 
 
 		 845 aa  265  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  31.75 
 
 		 770 aa  264  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  31.67 
 
 		 806 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  30.72 
 
 		 765 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  31.65 
 
 		 760 aa  247  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  27.81 
 
 		 798 aa  240  6.999999999999999e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  30.16 
 
 		 816 aa  240  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  27.19 
 
 		 836 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  29.75 
 
 		 681 aa  237  6e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  32.29 
 
 		 765 aa  228  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  28.67 
 
 		 700 aa  227  6e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  30.35 
 
 		 825 aa  227  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  32.24 
 
 		 685 aa  226  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  32.25 
 
 		 683 aa  223  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  30.85 
 
 		 762 aa  217  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  29.74 
 
 		 749 aa  216  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  28.52 
 
 		 815 aa  214  7e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  29.39 
 
 		 687 aa  213  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  28.21 
 
 		 828 aa  209  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  25.89 
 
 		 702 aa  209  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  29.66 
 
 		 804 aa  209  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  28.07 
 
 		 774 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  29.38 
 
 		 771 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  29.76 
 
 		 764 aa  206  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  29.91 
 
 		 779 aa  206  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  30 
 
 		 764 aa  206  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  26 
 
 		 728 aa  204  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  28.73 
 
 		 772 aa  204  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  28.34 
 
 		 780 aa  203  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  26.19 
 
 		 775 aa  201  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  28.96 
 
 		 766 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  28.73 
 
 		 772 aa  201  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  27.01 
 
 		 806 aa  201  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  28.73 
 
 		 772 aa  200  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  28.71 
 
 		 712 aa  200  7e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  28.75 
 
 		 760 aa  200  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  28.12 
 
 		 760 aa  200  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  29.15 
 
 		 795 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  28.55 
 
 		 772 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  28.55 
 
 		 772 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  27.6 
 
 		 775 aa  198  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  27.76 
 
 		 780 aa  197  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  29.89 
 
 		 656 aa  197  8.000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  29.42 
 
 		 772 aa  197  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  28.55 
 
 		 772 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  30.14 
 
 		 823 aa  196  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  28.16 
 
 		 763 aa  195  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  30.07 
 
 		 778 aa  194  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  28.72 
 
 		 775 aa  193  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  28.36 
 
 		 772 aa  192  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  28.18 
 
 		 772 aa  192  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  27.09 
 
 		 839 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  28.18 
 
 		 772 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  28.18 
 
 		 772 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  28.18 
 
 		 772 aa  191  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  28.18 
 
 		 772 aa  191  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>