201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2352 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  50.58 
 
 		 803 aa  752    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  79.13 
 
 		 791 aa  1315    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  74.36 
 
 		 795 aa  1246    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  100 
 
 		 788 aa  1637    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  48.27 
 
 		 803 aa  731    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  49.3 
 
 		 806 aa  720    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  50.06 
 
 		 803 aa  748    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  48.47 
 
 		 806 aa  716    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  53.81 
 
 		 784 aa  859    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  49.87 
 
 		 821 aa  731    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  48.21 
 
 		 806 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  74.36 
 
 		 795 aa  1246    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  77.17 
 
 		 791 aa  1301    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  48.41 
 
 		 806 aa  714    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  48.21 
 
 		 806 aa  709    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  47.2 
 
 		 813 aa  689    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  47.7 
 
 		 806 aa  708    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  75.26 
 
 		 787 aa  1261    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  63.34 
 
 		 799 aa  1067    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  77.3 
 
 		 791 aa  1301    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  76.34 
 
 		 788 aa  1281    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  78.09 
 
 		 790 aa  1291    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  95.05 
 
 		 788 aa  1568    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  77.04 
 
 		 789 aa  1292    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  30.58 
 
 		 801 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  33.11 
 
 		 803 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  32.02 
 
 		 779 aa  325  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  29.33 
 
 		 797 aa  322  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  28.67 
 
 		 777 aa  317  5e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  30.35 
 
 		 821 aa  314  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03504  alpha-glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06560)  29.54 
 
 		 830 aa  312  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  28.4 
 
 		 779 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  30.77 
 
 		 794 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  31.49 
 
 		 799 aa  310  8e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  30.19 
 
 		 776 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  28.65 
 
 		 785 aa  307  6e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  28.8 
 
 		 828 aa  306  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01640  glicosidase, putative  30.55 
 
 		 892 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  27.02 
 
 		 752 aa  295  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  29.28 
 
 		 768 aa  294  5e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  28.57 
 
 		 792 aa  293  8e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  31.82 
 
 		 779 aa  284  5.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  32.23 
 
 		 825 aa  277  5e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  29.77 
 
 		 770 aa  268  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  28.59 
 
 		 806 aa  267  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  28.17 
 
 		 746 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  28.76 
 
 		 798 aa  263  8.999999999999999e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  31.32 
 
 		 743 aa  262  2e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  29.25 
 
 		 836 aa  258  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  28.82 
 
 		 702 aa  257  8e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  28.24 
 
 		 828 aa  249  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  27.45 
 
 		 845 aa  248  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  31.35 
 
 		 762 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  31.48 
 
 		 765 aa  238  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  31.08 
 
 		 765 aa  232  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  29.91 
 
 		 816 aa  232  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  29.66 
 
 		 815 aa  229  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  30.97 
 
 		 760 aa  226  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  28.46 
 
 		 715 aa  222  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  27.04 
 
 		 911 aa  219  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  26.48 
 
 		 836 aa  218  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11054  alpha glucosidase II, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03500)  27.7 
 
 		 952 aa  214  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.464256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50836  alpha subunit of glucosidase  30 
 
 		 712 aa  214  5.999999999999999e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.312978  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  29.44 
 
 		 683 aa  211  5e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  27.33 
 
 		 728 aa  207  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  26.28 
 
 		 700 aa  207  5e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  29.45 
 
 		 1024 aa  207  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  25.43 
 
 		 839 aa  207  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  28.09 
 
 		 806 aa  204  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 695 aa  204  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  28.06 
 
 		 661 aa  204  6e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  27.02 
 
 		 687 aa  204  7e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  27.15 
 
 		 783 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  27.33 
 
 		 685 aa  201  3e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  27.75 
 
 		 804 aa  194  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  28.62 
 
 		 681 aa  194  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05150  alpha glucosidase, putative  27.91 
 
 		 956 aa  193  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133027  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  28.26 
 
 		 795 aa  191  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  30.38 
 
 		 969 aa  190  8e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  26.97 
 
 		 775 aa  188  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  28.04 
 
 		 794 aa  187  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  26.64 
 
 		 775 aa  187  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  27.19 
 
 		 951 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 944 aa  184  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  29.64 
 
 		 778 aa  183  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  26.47 
 
 		 763 aa  181  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  27.13 
 
 		 766 aa  180  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  26.23 
 
 		 821 aa  178  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  25.7 
 
 		 752 aa  178  4e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  28.11 
 
 		 656 aa  178  4e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  27.35 
 
 		 760 aa  177  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  24.47 
 
 		 757 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  26.89 
 
 		 784 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  26.76 
 
 		 760 aa  174  7.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  25.89 
 
 		 779 aa  172  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  25.49 
 
 		 764 aa  172  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2648  glycosy hydrolase family protein  24.89 
 
 		 715 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  25.49 
 
 		 764 aa  171  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  26.03 
 
 		 774 aa  171  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  26.27 
 
 		 791 aa  170  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>