206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00115 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  100 
 
 
969 aa  2001    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.75 
 
 
973 aa  988    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  45 
 
 
951 aa  854    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  54.49 
 
 
944 aa  1052    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  44.08 
 
 
783 aa  478  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  41.67 
 
 
791 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  40.22 
 
 
806 aa  399  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  41.78 
 
 
995 aa  330  8e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3277  glycoside hydrolase family protein  41.92 
 
 
974 aa  322  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  34.22 
 
 
770 aa  314  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  36.51 
 
 
695 aa  303  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  33.12 
 
 
679 aa  279  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  33.2 
 
 
661 aa  276  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  32.24 
 
 
679 aa  273  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  32.04 
 
 
679 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  32.04 
 
 
679 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  32.04 
 
 
679 aa  273  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  31.84 
 
 
679 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  33.63 
 
 
836 aa  264  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  30.72 
 
 
668 aa  261  4e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  33.33 
 
 
690 aa  260  7e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  32.12 
 
 
840 aa  260  8e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  32.52 
 
 
699 aa  254  7e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  31.43 
 
 
801 aa  254  8.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  32.04 
 
 
779 aa  253  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  31.86 
 
 
779 aa  241  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  29.88 
 
 
776 aa  241  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  29.82 
 
 
1024 aa  235  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  30.12 
 
 
779 aa  234  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  31.62 
 
 
785 aa  233  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  28.74 
 
 
777 aa  226  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  31.08 
 
 
792 aa  226  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  29.32 
 
 
836 aa  217  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  28.57 
 
 
803 aa  217  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  31.11 
 
 
828 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  30.94 
 
 
821 aa  212  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  30.31 
 
 
821 aa  212  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  28.86 
 
 
768 aa  211  6e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  29.25 
 
 
845 aa  208  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  28.79 
 
 
743 aa  206  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  28.5 
 
 
839 aa  205  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  31.2 
 
 
788 aa  205  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  29.12 
 
 
797 aa  200  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  29.88 
 
 
760 aa  197  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  29.49 
 
 
825 aa  196  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  28.55 
 
 
794 aa  194  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.96 
 
 
791 aa  193  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  26.81 
 
 
746 aa  193  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  30.93 
 
 
806 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  31.59 
 
 
687 aa  191  4e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  27.26 
 
 
752 aa  191  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  30.38 
 
 
788 aa  190  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1956  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 
927 aa  189  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289429  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  29.02 
 
 
799 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  28.69 
 
 
765 aa  187  9e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  26.52 
 
 
1207 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  29 
 
 
1128 aa  186  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  30 
 
 
788 aa  184  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  28.63 
 
 
765 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  29.83 
 
 
795 aa  181  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  29.83 
 
 
795 aa  181  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  27.42 
 
 
700 aa  180  9e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0133  glycoside hydrolase family 31  27.88 
 
 
798 aa  179  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15100  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  28.12 
 
 
816 aa  179  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  28.5 
 
 
702 aa  179  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  31.25 
 
 
762 aa  179  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  29.01 
 
 
799 aa  179  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  29.43 
 
 
821 aa  177  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  28.46 
 
 
803 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 
813 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  28.68 
 
 
815 aa  176  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  28.85 
 
 
828 aa  175  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  29.14 
 
 
806 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  28.16 
 
 
806 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  28.16 
 
 
806 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  28.34 
 
 
806 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  27.65 
 
 
803 aa  173  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  28.83 
 
 
806 aa  173  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  28.57 
 
 
806 aa  174  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  27.68 
 
 
803 aa  174  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.95 
 
 
787 aa  173  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  29.06 
 
 
685 aa  172  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  26.31 
 
 
764 aa  172  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  26.31 
 
 
764 aa  172  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  26.51 
 
 
798 aa  171  6e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  28.38 
 
 
790 aa  169  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  25.77 
 
 
728 aa  169  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2529  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 
1010 aa  169  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  28.76 
 
 
791 aa  169  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  28.76 
 
 
791 aa  168  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  27.95 
 
 
771 aa  168  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  27.79 
 
 
779 aa  168  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  30.69 
 
 
683 aa  167  8e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  27.54 
 
 
774 aa  167  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  29.27 
 
 
789 aa  166  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  28.46 
 
 
752 aa  163  1e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  28.03 
 
 
784 aa  162  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  27.2 
 
 
749 aa  162  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  29 
 
 
794 aa  161  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  28.54 
 
 
799 aa  161  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>