198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3867 on replicon NC_008042
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  46.33 
 
 
803 aa  674    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  55.38 
 
 
795 aa  878    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  47.45 
 
 
803 aa  685    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  53.65 
 
 
788 aa  850    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  55.13 
 
 
791 aa  865    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  48.12 
 
 
806 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  55.38 
 
 
795 aa  878    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  100 
 
 
784 aa  1628    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  44.8 
 
 
806 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  46.41 
 
 
803 aa  684    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  47.99 
 
 
806 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  48.58 
 
 
821 aa  710    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  44.8 
 
 
806 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  45.7 
 
 
813 aa  653    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  53.85 
 
 
788 aa  849    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  47.5 
 
 
806 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  55.88 
 
 
787 aa  888    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  53.97 
 
 
799 aa  886    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  55.67 
 
 
791 aa  900    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  53.81 
 
 
788 aa  859    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  54.23 
 
 
790 aa  846    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  47.61 
 
 
806 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  55.54 
 
 
789 aa  897    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  55.54 
 
 
791 aa  901    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  30.99 
 
 
801 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  32.3 
 
 
779 aa  314  4.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03504  alpha-glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06560)  31.21 
 
 
830 aa  309  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  28.61 
 
 
777 aa  303  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  30.69 
 
 
828 aa  293  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  31.98 
 
 
794 aa  291  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  32.18 
 
 
797 aa  290  8e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  31.5 
 
 
799 aa  280  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  32.27 
 
 
821 aa  280  7e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  28.22 
 
 
779 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  30.46 
 
 
792 aa  275  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  32.94 
 
 
779 aa  273  9e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  30.45 
 
 
785 aa  273  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  29.17 
 
 
776 aa  273  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01640  glicosidase, putative  29.13 
 
 
892 aa  269  2e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  29.68 
 
 
768 aa  266  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  29.01 
 
 
836 aa  260  7e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  28.99 
 
 
746 aa  253  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  28.66 
 
 
798 aa  248  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  27.86 
 
 
752 aa  249  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  30.62 
 
 
770 aa  247  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  32.09 
 
 
828 aa  246  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  30.85 
 
 
825 aa  245  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  28.94 
 
 
803 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  27.98 
 
 
845 aa  236  8e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  30.93 
 
 
760 aa  234  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  29.76 
 
 
815 aa  233  8.000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  29.77 
 
 
806 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  28.63 
 
 
816 aa  229  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  30.96 
 
 
765 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  29.62 
 
 
743 aa  226  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  25.12 
 
 
836 aa  214  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  29.15 
 
 
765 aa  213  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  29.12 
 
 
795 aa  211  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  26.92 
 
 
702 aa  211  4e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  31.84 
 
 
762 aa  207  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  24.38 
 
 
839 aa  206  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  29.23 
 
 
695 aa  204  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  27.33 
 
 
749 aa  201  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  26.09 
 
 
779 aa  198  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  26.03 
 
 
700 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  25.38 
 
 
728 aa  196  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  25.85 
 
 
715 aa  195  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  28.82 
 
 
685 aa  195  3e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  25.68 
 
 
775 aa  193  9e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50836  alpha subunit of glucosidase  26.63 
 
 
712 aa  192  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.312978  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  28.35 
 
 
683 aa  193  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  28.15 
 
 
661 aa  193  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  27.94 
 
 
681 aa  192  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  27.59 
 
 
687 aa  192  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  25.32 
 
 
911 aa  190  7e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  25.03 
 
 
764 aa  190  9e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  25.03 
 
 
764 aa  189  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  30.69 
 
 
763 aa  188  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  27.65 
 
 
783 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05150  alpha glucosidase, putative  28.21 
 
 
956 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  26.34 
 
 
771 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  28.9 
 
 
804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  25.28 
 
 
780 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  28.71 
 
 
1024 aa  183  9.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  28.7 
 
 
794 aa  183  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  27.98 
 
 
766 aa  183  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  25.15 
 
 
692 aa  183  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  25.76 
 
 
770 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  27.42 
 
 
760 aa  180  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2648  glycosy hydrolase family protein  26.43 
 
 
715 aa  179  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  25.81 
 
 
772 aa  178  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 
799 aa  178  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11054  alpha glucosidase II, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03500)  24.57 
 
 
952 aa  176  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.464256  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  25.39 
 
 
821 aa  177  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  25.6 
 
 
777 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  26.77 
 
 
775 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  25.54 
 
 
774 aa  174  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  25.49 
 
 
775 aa  173  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  26.97 
 
 
656 aa  171  4e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2334  alpha-glucosidase  25.78 
 
 
715 aa  171  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>