203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0413 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  57.2 
 
 		 775 aa  796    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  52.8 
 
 		 772 aa  808    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  52.55 
 
 		 775 aa  788    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  49.16 
 
 		 780 aa  714    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  50.89 
 
 		 764 aa  773    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  52.19 
 
 		 772 aa  800    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  52.19 
 
 		 772 aa  800    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  62.33 
 
 		 749 aa  873    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  52.32 
 
 		 772 aa  801    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  52.53 
 
 		 772 aa  806    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  52.46 
 
 		 772 aa  803    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  62.18 
 
 		 681 aa  817    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  51.85 
 
 		 763 aa  783    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  52.53 
 
 		 772 aa  802    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  52.32 
 
 		 772 aa  801    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  46.94 
 
 		 712 aa  645    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  63.3 
 
 		 804 aa  877    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  61.57 
 
 		 777 aa  888    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  59.32 
 
 		 779 aa  805    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  52.92 
 
 		 823 aa  713    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  52.8 
 
 		 772 aa  808    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  52.12 
 
 		 770 aa  781    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  53.07 
 
 		 772 aa  810    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  61.26 
 
 		 760 aa  900    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  50.62 
 
 		 764 aa  766    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  60.08 
 
 		 771 aa  900    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  100 
 
 		 763 aa  1524    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  52.46 
 
 		 772 aa  801    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  52.19 
 
 		 772 aa  800    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  52.19 
 
 		 772 aa  800    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  64.38 
 
 		 775 aa  909    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  65.59 
 
 		 760 aa  951    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  57.58 
 
 		 774 aa  869    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  52.53 
 
 		 772 aa  805    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  50.48 
 
 		 780 aa  760    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  50.55 
 
 		 772 aa  789    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  67.39 
 
 		 766 aa  976    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  45.98 
 
 		 608 aa  535  1e-151  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  43.27 
 
 		 760 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  39.76 
 
 		 765 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  44.51 
 
 		 765 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  37.25 
 
 		 794 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  38.94 
 
 		 795 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  35.48 
 
 		 799 aa  364  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  35.22 
 
 		 757 aa  361  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  35.63 
 
 		 778 aa  332  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  35.06 
 
 		 695 aa  319  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  30.86 
 
 		 752 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  29.69 
 
 		 784 aa  289  1e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  27.03 
 
 		 768 aa  288  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  32.01 
 
 		 828 aa  286  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  35.26 
 
 		 779 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  31.86 
 
 		 770 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  29.46 
 
 		 801 aa  269  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  31.59 
 
 		 803 aa  265  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  27.58 
 
 		 755 aa  264  4.999999999999999e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  29.02 
 
 		 776 aa  263  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  29.89 
 
 		 836 aa  262  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  28.25 
 
 		 779 aa  261  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  31.67 
 
 		 779 aa  259  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  27.69 
 
 		 792 aa  256  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  29.36 
 
 		 821 aa  250  9e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  26.3 
 
 		 746 aa  246  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  25.85 
 
 		 777 aa  245  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  28.97 
 
 		 752 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  27.95 
 
 		 794 aa  233  8.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  30.81 
 
 		 813 aa  229  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  27.99 
 
 		 799 aa  226  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  30.78 
 
 		 821 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  30.19 
 
 		 806 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  27.87 
 
 		 797 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  30.65 
 
 		 806 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  29.17 
 
 		 785 aa  223  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 806 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  29.45 
 
 		 806 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  30.03 
 
 		 806 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  30.03 
 
 		 806 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  29.26 
 
 		 806 aa  220  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  26.1 
 
 		 836 aa  218  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  27.53 
 
 		 798 aa  217  5e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  30.44 
 
 		 803 aa  217  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  26.02 
 
 		 743 aa  212  3e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.67 
 
 		 788 aa  210  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  25.65 
 
 		 839 aa  210  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  30.69 
 
 		 784 aa  209  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  29.4 
 
 		 816 aa  209  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  29.01 
 
 		 845 aa  208  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  28.16 
 
 		 803 aa  207  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  26.61 
 
 		 821 aa  204  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.5 
 
 		 791 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  27.87 
 
 		 803 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  30.54 
 
 		 695 aa  200  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  25.91 
 
 		 806 aa  200  9e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  26.42 
 
 		 791 aa  198  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  27.15 
 
 		 679 aa  197  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  27.37 
 
 		 679 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  26.11 
 
 		 791 aa  195  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  27.22 
 
 		 679 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  28.07 
 
 		 825 aa  195  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  29.26 
 
 		 828 aa  196  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>