200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3127 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  71.76 
 
 
803 aa  1223    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
813 aa  1684    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  45.85 
 
 
795 aa  687    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  71.32 
 
 
803 aa  1217    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  48.24 
 
 
788 aa  717    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  48.97 
 
 
791 aa  713    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  72.06 
 
 
803 aa  1227    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  65.77 
 
 
806 aa  1110    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  45.7 
 
 
784 aa  653    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  47.2 
 
 
788 aa  689    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  66.21 
 
 
806 aa  1108    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  47.28 
 
 
788 aa  703    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  47.77 
 
 
791 aa  713    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  61.41 
 
 
821 aa  1014    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  65.93 
 
 
806 aa  1102    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  66.17 
 
 
806 aa  1108    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  66.21 
 
 
806 aa  1108    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  66.58 
 
 
806 aa  1118    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  46.82 
 
 
787 aa  708    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  46.25 
 
 
799 aa  716    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  47.64 
 
 
791 aa  709    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  45.85 
 
 
795 aa  687    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  48.25 
 
 
790 aa  709    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  47.64 
 
 
789 aa  707    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  34.53 
 
 
779 aa  347  4e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  31.01 
 
 
803 aa  316  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  27.9 
 
 
777 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  32.03 
 
 
801 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  30.27 
 
 
779 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03504  alpha-glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06560)  34.5 
 
 
830 aa  298  4e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  29.27 
 
 
828 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  29.27 
 
 
797 aa  294  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  31.63 
 
 
779 aa  293  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  27.9 
 
 
752 aa  291  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01640  glicosidase, putative  30.68 
 
 
892 aa  288  4e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  29.75 
 
 
776 aa  283  6.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  32.89 
 
 
743 aa  281  3e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  28.21 
 
 
821 aa  280  7e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  26.77 
 
 
799 aa  279  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  28.88 
 
 
792 aa  278  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  31.91 
 
 
768 aa  276  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  30.57 
 
 
794 aa  273  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  28.04 
 
 
785 aa  269  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  29.84 
 
 
746 aa  265  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  29.41 
 
 
798 aa  257  8e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  30.69 
 
 
770 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  29.6 
 
 
806 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  28.49 
 
 
760 aa  248  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  31.56 
 
 
765 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  30.51 
 
 
681 aa  244  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  27.48 
 
 
845 aa  243  7e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  28.92 
 
 
816 aa  231  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  29.25 
 
 
779 aa  229  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  32.42 
 
 
765 aa  229  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  30.12 
 
 
815 aa  229  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  30.85 
 
 
764 aa  228  4e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  31.01 
 
 
749 aa  227  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  30.67 
 
 
764 aa  226  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  28.18 
 
 
760 aa  225  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  27.23 
 
 
836 aa  223  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  31.78 
 
 
683 aa  219  1e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  27.74 
 
 
828 aa  220  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  27.98 
 
 
825 aa  219  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  31.08 
 
 
762 aa  218  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  31.99 
 
 
685 aa  216  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  28.47 
 
 
700 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  27.78 
 
 
772 aa  216  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  31.15 
 
 
771 aa  215  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  25.84 
 
 
775 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  30.02 
 
 
687 aa  214  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  30.81 
 
 
763 aa  214  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  28.12 
 
 
911 aa  212  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  28.86 
 
 
760 aa  212  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  28.38 
 
 
772 aa  211  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  29.06 
 
 
772 aa  210  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  28.55 
 
 
772 aa  210  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  29.03 
 
 
774 aa  210  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  28.38 
 
 
772 aa  210  9e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  28.38 
 
 
772 aa  210  9e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  28.38 
 
 
772 aa  209  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  28.38 
 
 
772 aa  209  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  28.38 
 
 
772 aa  209  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  28.88 
 
 
780 aa  209  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  27.6 
 
 
806 aa  207  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  29.55 
 
 
804 aa  207  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  26.04 
 
 
772 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  26.68 
 
 
770 aa  206  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  28.19 
 
 
772 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  30.04 
 
 
766 aa  205  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  29.38 
 
 
780 aa  204  4e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  28.22 
 
 
772 aa  204  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  30.59 
 
 
661 aa  204  5e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  28.01 
 
 
772 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  28.68 
 
 
777 aa  203  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  29.96 
 
 
775 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  28.01 
 
 
772 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  29.82 
 
 
775 aa  201  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  28.01 
 
 
772 aa  200  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  28.52 
 
 
712 aa  199  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  28.25 
 
 
823 aa  199  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>