201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03950 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  49.75 
 
 		 836 aa  815    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  100 
 
 		 821 aa  1697    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  49.23 
 
 		 839 aa  820    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  32.43 
 
 		 770 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  28.59 
 
 		 801 aa  331  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  28.69 
 
 		 828 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  28.63 
 
 		 779 aa  307  7e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  26.71 
 
 		 797 aa  304  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  27.77 
 
 		 821 aa  300  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  26.14 
 
 		 779 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  27.93 
 
 		 803 aa  281  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  26.67 
 
 		 836 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  26.58 
 
 		 752 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  27.9 
 
 		 768 aa  276  8e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  26.31 
 
 		 799 aa  275  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  30.06 
 
 		 779 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  28.21 
 
 		 794 aa  270  8e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  26.33 
 
 		 746 aa  266  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  27.88 
 
 		 792 aa  256  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  25.54 
 
 		 776 aa  255  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  25.54 
 
 		 777 aa  254  6e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  31.47 
 
 		 840 aa  248  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  28.1 
 
 		 806 aa  247  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  29.25 
 
 		 798 aa  246  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  30.35 
 
 		 765 aa  243  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  25.95 
 
 		 785 aa  243  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  28.05 
 
 		 1024 aa  239  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  28.55 
 
 		 791 aa  232  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  30.4 
 
 		 951 aa  228  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  29 
 
 		 973 aa  226  9e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  26.8 
 
 		 783 aa  226  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  28.78 
 
 		 760 aa  226  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  27.82 
 
 		 743 aa  225  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  26.62 
 
 		 700 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  28.26 
 
 		 765 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  25.41 
 
 		 845 aa  222  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2648  glycosy hydrolase family protein  24.01 
 
 		 715 aa  219  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  27.86 
 
 		 681 aa  217  8e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  30.27 
 
 		 815 aa  216  9e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  25.98 
 
 		 775 aa  213  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2334  alpha-glucosidase  24.26 
 
 		 715 aa  214  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  26.32 
 
 		 749 aa  212  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  30.94 
 
 		 969 aa  212  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  24.92 
 
 		 779 aa  210  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  27.66 
 
 		 687 aa  209  1e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  24.92 
 
 		 728 aa  209  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  27.12 
 
 		 685 aa  208  4e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  26.45 
 
 		 775 aa  207  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  27.39 
 
 		 661 aa  206  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  30.37 
 
 		 944 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  26.67 
 
 		 806 aa  204  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  25.47 
 
 		 760 aa  203  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  27.18 
 
 		 679 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  24.46 
 
 		 764 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  25.75 
 
 		 816 aa  203  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  26.85 
 
 		 679 aa  202  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  27.01 
 
 		 679 aa  202  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  24.33 
 
 		 764 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  23.97 
 
 		 692 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  25.81 
 
 		 760 aa  201  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  26.68 
 
 		 679 aa  201  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  26.68 
 
 		 679 aa  200  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  24.8 
 
 		 772 aa  200  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  25.53 
 
 		 757 aa  199  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2529  glycoside hydrolase family protein  26.11 
 
 		 1010 aa  195  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  27.9 
 
 		 683 aa  195  3e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  26.5 
 
 		 715 aa  194  5e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  25.75 
 
 		 679 aa  192  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.67 
 
 		 787 aa  192  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  27.67 
 
 		 690 aa  192  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  26.38 
 
 		 804 aa  190  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  26.61 
 
 		 763 aa  189  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  25.83 
 
 		 661 aa  188  4e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  24.59 
 
 		 799 aa  187  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.56 
 
 		 788 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  24.84 
 
 		 774 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  27.12 
 
 		 778 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.35 
 
 		 788 aa  185  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  24.15 
 
 		 752 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  23.99 
 
 		 795 aa  184  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  23.99 
 
 		 795 aa  184  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  25.3 
 
 		 825 aa  184  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  26.13 
 
 		 777 aa  183  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05150  alpha glucosidase, putative  28.68 
 
 		 956 aa  183  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  23.25 
 
 		 780 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 		 995 aa  182  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  25.38 
 
 		 790 aa  182  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  24.57 
 
 		 789 aa  182  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  24.42 
 
 		 791 aa  181  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  24.42 
 
 		 791 aa  181  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  25.22 
 
 		 766 aa  180  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  27.23 
 
 		 911 aa  180  8e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  26.15 
 
 		 699 aa  180  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  29.46 
 
 		 762 aa  180  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  22.53 
 
 		 770 aa  179  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  26.42 
 
 		 668 aa  179  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  26.9 
 
 		 695 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  25.7 
 
 		 656 aa  179  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.301391 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  23.89 
 
 		 780 aa  178  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.04 
 
 		 791 aa  178  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>