200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0520 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  47.17 
 
 		 699 aa  642    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.845548 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  49.33 
 
 		 661 aa  676    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  52.87 
 
 		 679 aa  706    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  52.89 
 
 		 679 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  53.04 
 
 		 679 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  100 
 
 		 668 aa  1394    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  52.58 
 
 		 679 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  52.58 
 
 		 679 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  52.89 
 
 		 679 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  44.1 
 
 		 690 aa  618  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  43.61 
 
 		 695 aa  517  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  34.28 
 
 		 783 aa  347  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  30.99 
 
 		 806 aa  306  8.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  33.97 
 
 		 951 aa  287  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  29.73 
 
 		 791 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  33.19 
 
 		 973 aa  279  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  29.9 
 
 		 995 aa  270  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  30.72 
 
 		 969 aa  261  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  31.83 
 
 		 944 aa  261  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  29.79 
 
 		 770 aa  260  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  29.76 
 
 		 836 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3277  glycoside hydrolase family protein  27.7 
 
 		 974 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  31.64 
 
 		 840 aa  234  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  30.9 
 
 		 795 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  30.17 
 
 		 778 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  29.11 
 
 		 776 aa  223  7e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  29.72 
 
 		 801 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  28.16 
 
 		 779 aa  218  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  29.49 
 
 		 777 aa  216  9e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  28.19 
 
 		 1024 aa  215  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  26.42 
 
 		 836 aa  212  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  29.09 
 
 		 779 aa  210  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  29.94 
 
 		 794 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  28.9 
 
 		 743 aa  209  1e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  27.84 
 
 		 765 aa  208  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  30.08 
 
 		 765 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  29.58 
 
 		 815 aa  208  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  28.62 
 
 		 760 aa  207  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  29.81 
 
 		 823 aa  205  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  25.47 
 
 		 695 aa  204  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  28.99 
 
 		 752 aa  204  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  29.68 
 
 		 775 aa  203  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  28.78 
 
 		 799 aa  203  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  26.72 
 
 		 760 aa  203  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  28.4 
 
 		 779 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  29.49 
 
 		 839 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  27.69 
 
 		 764 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  29.41 
 
 		 771 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  28.09 
 
 		 772 aa  201  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  29.48 
 
 		 757 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  30.53 
 
 		 770 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  27.69 
 
 		 764 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  26.9 
 
 		 681 aa  201  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  29.77 
 
 		 803 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  29.59 
 
 		 774 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  27.09 
 
 		 775 aa  198  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  26.67 
 
 		 792 aa  196  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  28.19 
 
 		 749 aa  193  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  28.52 
 
 		 804 aa  193  7e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  28.36 
 
 		 752 aa  192  1e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  28.02 
 
 		 760 aa  191  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  29.18 
 
 		 780 aa  187  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  26.67 
 
 		 777 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  27.71 
 
 		 766 aa  185  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  26.48 
 
 		 821 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  27.47 
 
 		 772 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  25.26 
 
 		 768 aa  180  8e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  26.42 
 
 		 821 aa  179  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  26.61 
 
 		 772 aa  180  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  26.57 
 
 		 806 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  27.03 
 
 		 687 aa  178  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  26.44 
 
 		 772 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  26.44 
 
 		 772 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  27.91 
 
 		 656 aa  177  4e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  26.44 
 
 		 772 aa  177  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  26.44 
 
 		 772 aa  177  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  26.44 
 
 		 772 aa  177  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  26.44 
 
 		 772 aa  177  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  26.27 
 
 		 772 aa  177  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  26.74 
 
 		 779 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  26.08 
 
 		 775 aa  174  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  27.04 
 
 		 799 aa  174  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  26.41 
 
 		 772 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  25.19 
 
 		 746 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  25.22 
 
 		 685 aa  173  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  26.75 
 
 		 784 aa  172  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  26.41 
 
 		 772 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  26.23 
 
 		 772 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  26.23 
 
 		 772 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  26.21 
 
 		 763 aa  171  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  26.48 
 
 		 763 aa  171  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  27.37 
 
 		 755 aa  169  1e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  26.03 
 
 		 683 aa  169  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  26.23 
 
 		 772 aa  168  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  26.11 
 
 		 780 aa  167  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  28.15 
 
 		 794 aa  166  9e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  25.5 
 
 		 828 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  26.38 
 
 		 798 aa  166  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  26.48 
 
 		 797 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  26.94 
 
 		 911 aa  164  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>