201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0044 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  53.22 
 
 
699 aa  721    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  83.01 
 
 
679 aa  1197    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  53.03 
 
 
661 aa  747    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  100 
 
 
679 aa  1417    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  53.04 
 
 
668 aa  714    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  99.85 
 
 
679 aa  1417    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  51.25 
 
 
690 aa  702    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  99.41 
 
 
679 aa  1412    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  99.56 
 
 
679 aa  1412    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  99.26 
 
 
679 aa  1410    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  43.87 
 
 
695 aa  575  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  35.08 
 
 
783 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  32.93 
 
 
806 aa  330  7e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  31.4 
 
 
791 aa  302  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  32.02 
 
 
973 aa  279  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  32.04 
 
 
969 aa  272  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  29.94 
 
 
770 aa  273  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  32.79 
 
 
951 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  31.25 
 
 
1024 aa  266  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  30.92 
 
 
995 aa  264  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  32.22 
 
 
944 aa  261  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  30.58 
 
 
840 aa  250  5e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3277  glycoside hydrolase family protein  31.59 
 
 
974 aa  247  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  28.93 
 
 
836 aa  240  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  28.9 
 
 
801 aa  231  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  29.09 
 
 
749 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  26.29 
 
 
836 aa  223  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  27.31 
 
 
776 aa  223  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  30.81 
 
 
779 aa  220  8.999999999999998e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  27.31 
 
 
839 aa  212  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  29.69 
 
 
780 aa  210  5e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  27.96 
 
 
777 aa  209  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  29.21 
 
 
757 aa  209  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  29.36 
 
 
815 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  28.42 
 
 
681 aa  209  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  30.07 
 
 
764 aa  209  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  27.13 
 
 
821 aa  207  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  30.07 
 
 
764 aa  207  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  29.08 
 
 
779 aa  207  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  27.33 
 
 
768 aa  207  7e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  30.26 
 
 
795 aa  206  8e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  29.73 
 
 
803 aa  206  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  30.78 
 
 
766 aa  204  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  30.09 
 
 
778 aa  204  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  31.41 
 
 
771 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  28.95 
 
 
743 aa  203  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  27.01 
 
 
821 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 
695 aa  201  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  28.38 
 
 
765 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  27.81 
 
 
775 aa  200  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  28.04 
 
 
760 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  28.19 
 
 
687 aa  196  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  27.95 
 
 
760 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  28.04 
 
 
770 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  27.82 
 
 
775 aa  194  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  26.61 
 
 
752 aa  193  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  27.1 
 
 
797 aa  193  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  27.02 
 
 
765 aa  193  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  26.94 
 
 
685 aa  192  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  29.43 
 
 
774 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  26.98 
 
 
760 aa  190  5.999999999999999e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  25.23 
 
 
792 aa  190  8e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  26.81 
 
 
775 aa  189  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  28.04 
 
 
779 aa  189  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  27.95 
 
 
799 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  28.34 
 
 
804 aa  187  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  26.18 
 
 
752 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  26.68 
 
 
779 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  27.73 
 
 
794 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  28.06 
 
 
777 aa  182  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  26.68 
 
 
772 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  27.22 
 
 
763 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  26.61 
 
 
828 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  29.22 
 
 
806 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 
813 aa  178  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  26.21 
 
 
772 aa  178  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  24.47 
 
 
772 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  24.47 
 
 
772 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  24.47 
 
 
772 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  24.47 
 
 
772 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  24.47 
 
 
772 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  24.47 
 
 
772 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  24.47 
 
 
772 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  23.41 
 
 
746 aa  174  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.15 
 
 
787 aa  174  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  24.32 
 
 
772 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  27.12 
 
 
785 aa  174  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  25.7 
 
 
794 aa  173  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  24.32 
 
 
772 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  24.32 
 
 
772 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  24.32 
 
 
772 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  25.74 
 
 
911 aa  172  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  26.01 
 
 
821 aa  171  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  27.85 
 
 
825 aa  170  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  27.11 
 
 
683 aa  169  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  24.17 
 
 
772 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  27.06 
 
 
823 aa  169  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  24.32 
 
 
772 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  25.73 
 
 
763 aa  167  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  27.67 
 
 
803 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>