197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3785 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2648  glycosy hydrolase family protein  52.1 
 
 		 715 aa  745    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2334  alpha-glucosidase  52.1 
 
 		 715 aa  743    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  100 
 
 		 692 aa  1442    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  44.17 
 
 		 728 aa  603  1.0000000000000001e-171  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  35.94 
 
 		 777 aa  432  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  36.5 
 
 		 702 aa  405  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  35.58 
 
 		 776 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  32.97 
 
 		 792 aa  380  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  33.17 
 
 		 768 aa  376  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  31.69 
 
 		 785 aa  376  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  33.72 
 
 		 779 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  34.46 
 
 		 715 aa  375  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  32.23 
 
 		 803 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  33.72 
 
 		 801 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  31.34 
 
 		 752 aa  365  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  33.01 
 
 		 779 aa  352  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  33.11 
 
 		 779 aa  350  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  31.91 
 
 		 746 aa  349  1e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  32.93 
 
 		 821 aa  343  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  31.13 
 
 		 794 aa  339  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  31.99 
 
 		 797 aa  333  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  28.39 
 
 		 828 aa  326  8.000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  31.54 
 
 		 743 aa  325  1e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  31.13 
 
 		 799 aa  323  6e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  31.4 
 
 		 762 aa  320  6e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  31.16 
 
 		 828 aa  317  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  29.85 
 
 		 700 aa  311  4e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  31.55 
 
 		 845 aa  310  5e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  29.01 
 
 		 825 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  32.59 
 
 		 806 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  30.26 
 
 		 816 aa  293  6e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  28.14 
 
 		 815 aa  287  4e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  30.4 
 
 		 661 aa  282  1e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  28.46 
 
 		 798 aa  282  2e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  27.21 
 
 		 770 aa  275  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  29.48 
 
 		 685 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  29.48 
 
 		 656 aa  249  1e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  29.6 
 
 		 683 aa  247  6e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  29.57 
 
 		 687 aa  243  7e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  27.98 
 
 		 836 aa  237  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11054  alpha glucosidase II, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03500)  28.16 
 
 		 952 aa  231  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.464256  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05150  alpha glucosidase, putative  27.34 
 
 		 956 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  24.76 
 
 		 839 aa  211  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  25.57 
 
 		 760 aa  207  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50836  alpha subunit of glucosidase  25.44 
 
 		 712 aa  206  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.312978  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  25.71 
 
 		 911 aa  202  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  23.97 
 
 		 821 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  23.26 
 
 		 836 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  23.23 
 
 		 795 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4624  Alpha-glucosidase  26.26 
 
 		 1025 aa  197  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  25.37 
 
 		 777 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  24.84 
 
 		 770 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00941  alpha-1,4-glucosidase (Eurofung)  26.84 
 
 		 839 aa  193  9e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  23.86 
 
 		 749 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  23.92 
 
 		 771 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  25 
 
 		 779 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  24.46 
 
 		 765 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  23.73 
 
 		 765 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01310  alpha-glucosidase precursor, putative  25.14 
 
 		 971 aa  188  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.538823  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  24.38 
 
 		 780 aa  188  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  26.86 
 
 		 806 aa  183  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  25.15 
 
 		 784 aa  183  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  26.47 
 
 		 806 aa  183  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  26.72 
 
 		 791 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  23.85 
 
 		 772 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  24.32 
 
 		 764 aa  182  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  23.86 
 
 		 778 aa  181  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  26.18 
 
 		 813 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  26.31 
 
 		 806 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  26.15 
 
 		 806 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  22.93 
 
 		 772 aa  180  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  23.8 
 
 		 772 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  23.99 
 
 		 764 aa  180  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  23.8 
 
 		 772 aa  180  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  26.15 
 
 		 806 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  26.15 
 
 		 806 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  25.35 
 
 		 821 aa  177  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  23.55 
 
 		 772 aa  177  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  23.51 
 
 		 799 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  23.55 
 
 		 772 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  26.43 
 
 		 944 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  24.03 
 
 		 775 aa  174  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  22.64 
 
 		 772 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  22.64 
 
 		 772 aa  172  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  22.64 
 
 		 772 aa  172  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  22.75 
 
 		 772 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  22.64 
 
 		 772 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  22.64 
 
 		 772 aa  172  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  22.64 
 
 		 772 aa  171  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  23.71 
 
 		 794 aa  170  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  26.84 
 
 		 951 aa  170  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  22.79 
 
 		 772 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  26.4 
 
 		 803 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.06 
 
 		 788 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  22.77 
 
 		 775 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  23.61 
 
 		 806 aa  167  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  22.6 
 
 		 681 aa  166  9e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  23.82 
 
 		 752 aa  167  9e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  23.46 
 
 		 775 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  22.18 
 
 		 760 aa  165  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>