195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2334 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2648  glycosy hydrolase family protein  97.48 
 
 		 715 aa  1441    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2334  alpha-glucosidase  100 
 
 		 715 aa  1468    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  52.1 
 
 		 692 aa  743    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  47.72 
 
 		 728 aa  697    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  39.8 
 
 		 702 aa  457  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  34.16 
 
 		 777 aa  426  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  36.75 
 
 		 715 aa  416  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  35.1 
 
 		 779 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  33.18 
 
 		 768 aa  384  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  34.06 
 
 		 752 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  32.86 
 
 		 801 aa  375  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  32.33 
 
 		 746 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  33.44 
 
 		 776 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  31.76 
 
 		 803 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  34.54 
 
 		 792 aa  368  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  30.28 
 
 		 779 aa  360  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  31.78 
 
 		 821 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  31.52 
 
 		 743 aa  347  5e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  30.14 
 
 		 785 aa  346  8e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  31.08 
 
 		 797 aa  343  9e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  29.9 
 
 		 794 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  30.89 
 
 		 799 aa  338  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  29.54 
 
 		 779 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  33.04 
 
 		 762 aa  323  6e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  31.57 
 
 		 816 aa  317  4e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  29.27 
 
 		 828 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  28.63 
 
 		 845 aa  304  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  28.91 
 
 		 825 aa  303  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  30.27 
 
 		 806 aa  297  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  27.29 
 
 		 828 aa  287  5.999999999999999e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  29.87 
 
 		 798 aa  284  4.0000000000000003e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  30.65 
 
 		 661 aa  282  1e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  28.48 
 
 		 700 aa  281  2e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  27.77 
 
 		 815 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  26.48 
 
 		 770 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  27.49 
 
 		 683 aa  258  3e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  30.68 
 
 		 687 aa  258  4e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  30.74 
 
 		 685 aa  254  3e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  28.28 
 
 		 656 aa  247  4e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.301391 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11054  alpha glucosidase II, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03500)  26.5 
 
 		 952 aa  231  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.464256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  24.96 
 
 		 839 aa  229  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  26.09 
 
 		 836 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  25.84 
 
 		 911 aa  220  6e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05150  alpha glucosidase, putative  27.23 
 
 		 956 aa  216  9e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133027  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  24.26 
 
 		 821 aa  214  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50836  alpha subunit of glucosidase  26.59 
 
 		 712 aa  208  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.312978  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07345  Alpha/beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR7]  25.69 
 
 		 894 aa  206  9e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0209313  normal  0.448 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  23.55 
 
 		 764 aa  200  6e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  25.62 
 
 		 780 aa  195  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  23.89 
 
 		 764 aa  195  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  23.81 
 
 		 770 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  23.82 
 
 		 772 aa  188  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  24.84 
 
 		 752 aa  188  3e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01310  alpha-glucosidase precursor, putative  24.78 
 
 		 971 aa  183  9.000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.538823  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  25.57 
 
 		 813 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  26.34 
 
 		 806 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  23.72 
 
 		 749 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  24.41 
 
 		 765 aa  182  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  26.19 
 
 		 806 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  26.19 
 
 		 806 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  24.89 
 
 		 788 aa  180  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  25.73 
 
 		 806 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  24.16 
 
 		 775 aa  178  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  24.55 
 
 		 760 aa  177  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  26.29 
 
 		 783 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  21.56 
 
 		 836 aa  176  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  23.05 
 
 		 775 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4624  Alpha-glucosidase  24.37 
 
 		 1025 aa  174  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  25.35 
 
 		 799 aa  174  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  25.57 
 
 		 806 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  25.57 
 
 		 806 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  24.26 
 
 		 795 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  22.48 
 
 		 780 aa  173  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00941  alpha-1,4-glucosidase (Eurofung)  23.61 
 
 		 839 aa  172  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  25.78 
 
 		 784 aa  171  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  22.53 
 
 		 772 aa  171  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  22.84 
 
 		 772 aa  171  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  22.84 
 
 		 772 aa  171  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  23 
 
 		 772 aa  171  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  22.84 
 
 		 772 aa  170  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  24.5 
 
 		 791 aa  170  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  22.84 
 
 		 772 aa  170  9e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  22.68 
 
 		 772 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  22.57 
 
 		 765 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  22.68 
 
 		 772 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  24.5 
 
 		 791 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  24.02 
 
 		 791 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  24.85 
 
 		 789 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.27 
 
 		 788 aa  169  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  24.44 
 
 		 787 aa  168  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  23.91 
 
 		 771 aa  168  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  24.27 
 
 		 790 aa  168  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  23.4 
 
 		 1024 aa  167  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  24.82 
 
 		 840 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  23.69 
 
 		 681 aa  167  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  22.68 
 
 		 772 aa  166  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  22.59 
 
 		 772 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  24.58 
 
 		 803 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  24.12 
 
 		 712 aa  166  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  25 
 
 		 803 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>