203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1244 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  47.75 
 
 
772 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  48.03 
 
 
772 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  47.89 
 
 
772 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  48.6 
 
 
775 aa  673    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  47.47 
 
 
772 aa  680    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  49.93 
 
 
770 aa  709    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  47.61 
 
 
772 aa  681    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  49.16 
 
 
764 aa  689    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  47.89 
 
 
772 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  49.3 
 
 
771 aa  711    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  47.89 
 
 
772 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  49.23 
 
 
775 aa  672    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  46.77 
 
 
763 aa  658    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  49.65 
 
 
779 aa  695    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  49.58 
 
 
749 aa  705    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  47.61 
 
 
772 aa  680    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  47.61 
 
 
772 aa  681    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  100 
 
 
712 aa  1482    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  50.56 
 
 
766 aa  712    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  47.33 
 
 
772 aa  678    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  49.37 
 
 
777 aa  709    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  46.01 
 
 
760 aa  655    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  48.88 
 
 
772 aa  696    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  49.16 
 
 
764 aa  686    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  48.67 
 
 
681 aa  717    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  47.83 
 
 
760 aa  684    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  47.47 
 
 
772 aa  679    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  47.47 
 
 
772 aa  680    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  50.56 
 
 
772 aa  702    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  50.63 
 
 
774 aa  724    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  48.94 
 
 
775 aa  698    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  48.88 
 
 
780 aa  690    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  47.47 
 
 
772 aa  680    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  47.61 
 
 
804 aa  677    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  48.28 
 
 
763 aa  633  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  44.21 
 
 
780 aa  619  1e-176  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  45.13 
 
 
823 aa  606  9.999999999999999e-173  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  40.66 
 
 
760 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  35.91 
 
 
765 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  40.61 
 
 
765 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  50.13 
 
 
608 aa  377  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  39.31 
 
 
795 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  38.55 
 
 
799 aa  358  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  37.97 
 
 
757 aa  350  6e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  37.52 
 
 
794 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  33.59 
 
 
778 aa  306  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  32.16 
 
 
752 aa  295  2e-78  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  31.79 
 
 
695 aa  276  9e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  31.66 
 
 
755 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  29.57 
 
 
784 aa  266  1e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  30.63 
 
 
779 aa  261  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  30.8 
 
 
828 aa  261  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  32.24 
 
 
770 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  30.59 
 
 
746 aa  250  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  30.25 
 
 
768 aa  250  7e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  30.77 
 
 
785 aa  248  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  30.98 
 
 
801 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  29.01 
 
 
792 aa  241  4e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  28.76 
 
 
821 aa  241  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  30.04 
 
 
836 aa  239  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  30.43 
 
 
803 aa  233  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  27.52 
 
 
779 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  29.62 
 
 
799 aa  231  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  30 
 
 
779 aa  226  9e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  29.9 
 
 
794 aa  224  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  30.58 
 
 
797 aa  223  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  29.21 
 
 
806 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  26.51 
 
 
752 aa  210  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  27.53 
 
 
743 aa  207  6e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  27.07 
 
 
776 aa  205  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  28.71 
 
 
803 aa  200  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  28.52 
 
 
813 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  28.2 
 
 
803 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  28.89 
 
 
803 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  27.04 
 
 
777 aa  197  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4630  glycoside hydrolase family protein  27.81 
 
 
744 aa  195  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  28.52 
 
 
821 aa  196  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 
806 aa  194  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  29.69 
 
 
815 aa  193  9e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  28.43 
 
 
806 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  25.16 
 
 
728 aa  191  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  28.04 
 
 
806 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  26.49 
 
 
798 aa  191  5.999999999999999e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  28.03 
 
 
806 aa  190  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  26.74 
 
 
825 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  25.47 
 
 
806 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  25.47 
 
 
806 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  28.76 
 
 
702 aa  188  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  26.13 
 
 
816 aa  188  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  27.04 
 
 
695 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  24.45 
 
 
828 aa  182  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5324  alpha-glucosidase  26.99 
 
 
678 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.539055 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4401  alpha-glucosidase  27 
 
 
678 aa  180  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  28.92 
 
 
840 aa  180  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4108  glycoside hydrolase family 31  27 
 
 
678 aa  180  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  25.68 
 
 
845 aa  179  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03712  hypothetical protein  26.82 
 
 
654 aa  178  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03763  alpha-glucosidase  26.82 
 
 
667 aa  178  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4263  alpha-glucosidase  26.82 
 
 
678 aa  177  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  29.06 
 
 
679 aa  177  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>