202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4683 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  53.7 
 
 
763 aa  872    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  54.45 
 
 
772 aa  887    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  52.2 
 
 
775 aa  859    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  48.6 
 
 
780 aa  720    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  61.09 
 
 
775 aa  934    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  54.53 
 
 
772 aa  895    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  56.33 
 
 
770 aa  892    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  54.53 
 
 
772 aa  895    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  54.66 
 
 
772 aa  895    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  100 
 
 
771 aa  1566    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  61.63 
 
 
760 aa  942    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  55.11 
 
 
764 aa  847    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  54.32 
 
 
772 aa  883    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  63.65 
 
 
766 aa  958    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  58.73 
 
 
804 aa  879    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  54.53 
 
 
772 aa  892    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  60.34 
 
 
775 aa  931    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  55.05 
 
 
772 aa  902    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  54.32 
 
 
772 aa  888    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  55.38 
 
 
779 aa  830    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  54.66 
 
 
772 aa  895    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  49.3 
 
 
712 aa  711    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  58.61 
 
 
681 aa  798    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  47.68 
 
 
823 aa  697    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  54.45 
 
 
772 aa  889    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  53.89 
 
 
772 aa  885    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  55.91 
 
 
764 aa  837    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  65.86 
 
 
749 aa  1022    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  61.54 
 
 
763 aa  870    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  55.12 
 
 
772 aa  914    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  60.98 
 
 
777 aa  951    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  54.4 
 
 
772 aa  894    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  54.4 
 
 
772 aa  893    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  56.85 
 
 
760 aa  863    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  62.07 
 
 
774 aa  993    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  52.09 
 
 
780 aa  820    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  54.71 
 
 
772 aa  892    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  43.26 
 
 
608 aa  496  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  37.7 
 
 
760 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  37.63 
 
 
765 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  40.48 
 
 
765 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  36.68 
 
 
795 aa  382  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  38.72 
 
 
757 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  37.92 
 
 
794 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  34.65 
 
 
799 aa  361  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  35.94 
 
 
695 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  34.29 
 
 
778 aa  332  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  30.96 
 
 
784 aa  292  2e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  29.45 
 
 
752 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  28.75 
 
 
770 aa  283  9e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  29.36 
 
 
755 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  28.53 
 
 
768 aa  268  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  29.37 
 
 
828 aa  268  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  30.54 
 
 
779 aa  260  8e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  29.91 
 
 
803 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  28.62 
 
 
779 aa  254  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  30.12 
 
 
779 aa  253  8.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  28.16 
 
 
792 aa  252  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  29.15 
 
 
801 aa  249  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  26.68 
 
 
836 aa  246  9e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  28.89 
 
 
794 aa  243  7e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  28.86 
 
 
799 aa  240  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  27.21 
 
 
821 aa  239  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  26.54 
 
 
777 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  29.96 
 
 
785 aa  235  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  27.8 
 
 
776 aa  235  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  26.71 
 
 
752 aa  226  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  26.17 
 
 
746 aa  224  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  25.86 
 
 
797 aa  223  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  31.01 
 
 
695 aa  223  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  31.15 
 
 
813 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  29.45 
 
 
803 aa  214  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  26.09 
 
 
836 aa  214  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  25.91 
 
 
845 aa  211  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  28.59 
 
 
806 aa  208  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  28.59 
 
 
806 aa  208  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  27.99 
 
 
806 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  28.46 
 
 
806 aa  207  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  29.38 
 
 
803 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  27.74 
 
 
806 aa  206  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  25.88 
 
 
798 aa  205  3e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  28.22 
 
 
828 aa  204  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  31.41 
 
 
679 aa  203  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  28.3 
 
 
821 aa  203  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  31.41 
 
 
679 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  27.45 
 
 
783 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  29.17 
 
 
806 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  31.41 
 
 
679 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  28.83 
 
 
806 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  31.41 
 
 
679 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  29.41 
 
 
668 aa  202  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  28.85 
 
 
803 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  26.93 
 
 
743 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  31.21 
 
 
679 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  25.73 
 
 
839 aa  201  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  26.16 
 
 
825 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  27.97 
 
 
815 aa  197  6e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 
799 aa  193  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  30.12 
 
 
679 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  26.76 
 
 
656 aa  191  4e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.301391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>