201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1017 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  66.01 
 
 
792 aa  1089    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  42.93 
 
 
801 aa  643    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  100 
 
 
768 aa  1595    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  41.73 
 
 
752 aa  597  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  38.4 
 
 
777 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  37.68 
 
 
803 aa  547  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  36.68 
 
 
785 aa  545  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  40.06 
 
 
779 aa  529  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  43.62 
 
 
779 aa  521  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  38.56 
 
 
821 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  36.5 
 
 
779 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  37.74 
 
 
797 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  37.6 
 
 
828 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  39.77 
 
 
746 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  40.58 
 
 
794 aa  499  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  34.66 
 
 
776 aa  496  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  37.48 
 
 
799 aa  492  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  36.1 
 
 
845 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  37.34 
 
 
825 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  35.21 
 
 
728 aa  427  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  38.3 
 
 
828 aa  425  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  36.46 
 
 
702 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  40.04 
 
 
743 aa  409  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  36.96 
 
 
715 aa  397  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  39.32 
 
 
762 aa  394  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  33.43 
 
 
798 aa  389  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  39.44 
 
 
816 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  32.93 
 
 
836 aa  388  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  35.07 
 
 
806 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2648  glycosy hydrolase family protein  32.98 
 
 
715 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2334  alpha-glucosidase  33.18 
 
 
715 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  33.17 
 
 
692 aa  376  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  33.06 
 
 
770 aa  364  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  34.13 
 
 
815 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  32.57 
 
 
700 aa  330  6e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  33.33 
 
 
656 aa  319  1e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  32.33 
 
 
661 aa  310  6.999999999999999e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11054  alpha glucosidase II, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03500)  34.87 
 
 
952 aa  310  9e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.464256  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  31.65 
 
 
685 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50836  alpha subunit of glucosidase  33.81 
 
 
712 aa  298  3e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.312978  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  29.57 
 
 
791 aa  297  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.12 
 
 
788 aa  296  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  29.41 
 
 
791 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.28 
 
 
788 aa  294  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  29.57 
 
 
789 aa  293  8e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  32.05 
 
 
683 aa  291  2e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  30.13 
 
 
788 aa  291  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.22 
 
 
791 aa  291  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  32.09 
 
 
687 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.8 
 
 
787 aa  290  7e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  28.66 
 
 
790 aa  287  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  29.04 
 
 
775 aa  286  9e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  29.84 
 
 
795 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  29.84 
 
 
795 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  31.79 
 
 
911 aa  286  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  32 
 
 
764 aa  282  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  30 
 
 
803 aa  281  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  29.89 
 
 
779 aa  281  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  30.07 
 
 
803 aa  280  9e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  31.03 
 
 
765 aa  280  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  31.64 
 
 
764 aa  279  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  26.62 
 
 
839 aa  277  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  29.9 
 
 
803 aa  277  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05150  alpha glucosidase, putative  31.88 
 
 
956 aa  277  6e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133027  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  27.9 
 
 
821 aa  276  8e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  30 
 
 
749 aa  276  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  31.91 
 
 
813 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  27.21 
 
 
774 aa  276  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  30.97 
 
 
772 aa  275  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  31.16 
 
 
760 aa  274  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  29.18 
 
 
799 aa  274  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  27.04 
 
 
763 aa  274  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  28.27 
 
 
780 aa  273  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  29.02 
 
 
760 aa  272  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  28.85 
 
 
775 aa  271  4e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  28.35 
 
 
806 aa  270  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  28.16 
 
 
806 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  28.8 
 
 
806 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 
806 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 
806 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  28.53 
 
 
771 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  28.44 
 
 
836 aa  268  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  28.77 
 
 
783 aa  266  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  29.68 
 
 
784 aa  266  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  28.67 
 
 
821 aa  265  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  29.82 
 
 
772 aa  265  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  30.49 
 
 
770 aa  264  4.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  27.79 
 
 
760 aa  264  6e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  28.85 
 
 
806 aa  263  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  28.59 
 
 
772 aa  261  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  28.08 
 
 
772 aa  260  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  28.86 
 
 
777 aa  260  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  28.24 
 
 
772 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  28.27 
 
 
772 aa  259  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  28.27 
 
 
772 aa  259  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  28.27 
 
 
772 aa  258  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  28.27 
 
 
772 aa  259  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  28.08 
 
 
772 aa  259  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  28.27 
 
 
772 aa  258  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  28.27 
 
 
772 aa  259  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>