203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1569 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  46.39 
 
 
778 aa  729    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  56.98 
 
 
799 aa  977    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  100 
 
 
794 aa  1647    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  52.72 
 
 
795 aa  854    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  37.6 
 
 
760 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  35.1 
 
 
765 aa  420  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  38.34 
 
 
765 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  35.09 
 
 
757 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  39.92 
 
 
772 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  39.53 
 
 
772 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  39.53 
 
 
772 aa  389  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  39.53 
 
 
772 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  39.53 
 
 
772 aa  389  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  39.33 
 
 
772 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  39.53 
 
 
772 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  39.53 
 
 
772 aa  389  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  38.1 
 
 
749 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  38.94 
 
 
772 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  38.75 
 
 
772 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  38.75 
 
 
772 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  38.55 
 
 
772 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  37.09 
 
 
764 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  38.94 
 
 
763 aa  379  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  38.55 
 
 
772 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  38.55 
 
 
772 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  34.7 
 
 
779 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  38.6 
 
 
764 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  38.75 
 
 
770 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  37.08 
 
 
777 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  39.47 
 
 
774 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  35.42 
 
 
775 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  39.3 
 
 
775 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  38.34 
 
 
772 aa  371  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  37.92 
 
 
771 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  36.57 
 
 
780 aa  369  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  35.05 
 
 
775 aa  365  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  35.28 
 
 
804 aa  365  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  37.25 
 
 
763 aa  365  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  35.74 
 
 
823 aa  360  6e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  36.59 
 
 
766 aa  355  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  37.26 
 
 
681 aa  351  3e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  35.27 
 
 
780 aa  348  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  35.41 
 
 
760 aa  345  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  34.56 
 
 
760 aa  344  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  37.52 
 
 
712 aa  338  1.9999999999999998e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  34.34 
 
 
695 aa  328  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  30.22 
 
 
752 aa  311  4e-83  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  31.72 
 
 
836 aa  273  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  29.16 
 
 
828 aa  262  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  31.02 
 
 
770 aa  257  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  30.27 
 
 
801 aa  252  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  27.15 
 
 
755 aa  249  1e-64  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  31.51 
 
 
779 aa  248  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  30.61 
 
 
608 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  27.87 
 
 
768 aa  244  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  40.56 
 
 
784 aa  242  2e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  30.18 
 
 
779 aa  237  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  29.92 
 
 
803 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  30.7 
 
 
779 aa  233  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  27.87 
 
 
794 aa  226  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  25.91 
 
 
776 aa  225  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  26.94 
 
 
797 aa  225  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  27.41 
 
 
746 aa  223  8e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  27.97 
 
 
799 aa  223  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  28.31 
 
 
792 aa  222  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  27.64 
 
 
752 aa  219  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  27.47 
 
 
777 aa  218  5e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  29.13 
 
 
785 aa  217  9e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  29.94 
 
 
668 aa  209  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  30.36 
 
 
695 aa  207  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  27.01 
 
 
821 aa  204  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  28.39 
 
 
783 aa  203  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  27.14 
 
 
825 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  27.48 
 
 
839 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  29.3 
 
 
1024 aa  197  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  28.46 
 
 
816 aa  195  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  28.36 
 
 
806 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  25.78 
 
 
845 aa  194  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  27.44 
 
 
806 aa  193  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  28.8 
 
 
661 aa  192  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  28.07 
 
 
836 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  28.77 
 
 
828 aa  189  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  26.33 
 
 
699 aa  189  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  27.08 
 
 
791 aa  187  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.04 
 
 
788 aa  187  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  27.74 
 
 
798 aa  186  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  26.91 
 
 
791 aa  186  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.59 
 
 
788 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  23.75 
 
 
728 aa  184  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  27.71 
 
 
791 aa  184  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.95 
 
 
787 aa  184  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4630  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 
744 aa  183  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  28.6 
 
 
679 aa  183  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  28.7 
 
 
784 aa  183  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  30.79 
 
 
815 aa  183  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  25.37 
 
 
743 aa  183  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  27.73 
 
 
679 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  27.73 
 
 
679 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  27.32 
 
 
679 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  26.91 
 
 
789 aa  182  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>