203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5548 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  43.83 
 
 		 973 aa  844    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  100 
 
 		 951 aa  1976    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  45.36 
 
 		 969 aa  849    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  44.29 
 
 		 944 aa  854    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  44.07 
 
 		 783 aa  505  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  42.05 
 
 		 791 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  36.49 
 
 		 806 aa  357  7.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  34.39 
 
 		 770 aa  340  8e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3277  glycoside hydrolase family protein  40.55 
 
 		 974 aa  320  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  40.28 
 
 		 995 aa  315  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  33.39 
 
 		 779 aa  289  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  33.97 
 
 		 668 aa  287  8e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  34.08 
 
 		 695 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  32.23 
 
 		 840 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  33.15 
 
 		 801 aa  274  6e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  33.04 
 
 		 777 aa  272  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  32.79 
 
 		 679 aa  272  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  32.79 
 
 		 679 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  32.79 
 
 		 679 aa  271  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  32.59 
 
 		 679 aa  270  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  32.59 
 
 		 679 aa  270  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  32.08 
 
 		 785 aa  270  8e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  31.33 
 
 		 776 aa  268  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  30.59 
 
 		 1024 aa  266  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  32.37 
 
 		 661 aa  264  8e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  32.32 
 
 		 679 aa  263  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  33.27 
 
 		 690 aa  260  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  32.39 
 
 		 699 aa  259  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  30.66 
 
 		 779 aa  254  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  31.58 
 
 		 828 aa  251  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  30.43 
 
 		 779 aa  249  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  32.49 
 
 		 821 aa  248  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  30.6 
 
 		 836 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  29.55 
 
 		 803 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  28.74 
 
 		 752 aa  239  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  30.05 
 
 		 794 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  31.54 
 
 		 799 aa  231  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  30.65 
 
 		 825 aa  230  7e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  30.4 
 
 		 821 aa  228  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  31.07 
 
 		 743 aa  224  8e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  29.92 
 
 		 828 aa  223  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  28.74 
 
 		 836 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  32.42 
 
 		 760 aa  219  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  29.57 
 
 		 768 aa  219  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  29.01 
 
 		 746 aa  219  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  29.19 
 
 		 792 aa  218  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  29.02 
 
 		 839 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  31.47 
 
 		 797 aa  213  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  27.52 
 
 		 798 aa  212  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.85 
 
 		 788 aa  204  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  30.99 
 
 		 765 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  30.66 
 
 		 765 aa  201  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  30.43 
 
 		 806 aa  198  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  28.62 
 
 		 795 aa  197  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  28.62 
 
 		 795 aa  197  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.02 
 
 		 791 aa  197  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.06 
 
 		 788 aa  195  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  28.89 
 
 		 752 aa  190  1e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  31.89 
 
 		 845 aa  189  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  28.11 
 
 		 815 aa  188  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  27.23 
 
 		 775 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.19 
 
 		 788 aa  186  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  28.63 
 
 		 764 aa  183  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  29.3 
 
 		 762 aa  183  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  28.14 
 
 		 791 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  28.63 
 
 		 823 aa  181  4e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  28.14 
 
 		 791 aa  182  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  27.27 
 
 		 790 aa  182  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  28.8 
 
 		 700 aa  181  4.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  26.58 
 
 		 799 aa  179  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  28.14 
 
 		 789 aa  179  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.66 
 
 		 787 aa  177  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  28.27 
 
 		 764 aa  177  6e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2529  glycoside hydrolase family protein  28.02 
 
 		 1010 aa  177  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  28.26 
 
 		 695 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  28.57 
 
 		 771 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11054  alpha glucosidase II, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03500)  29.74 
 
 		 952 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.464256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  27.65 
 
 		 760 aa  175  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  29.37 
 
 		 804 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  27.63 
 
 		 687 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  27.84 
 
 		 757 aa  172  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  27.86 
 
 		 770 aa  172  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  29.48 
 
 		 816 aa  172  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  28.92 
 
 		 685 aa  171  5e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  26.07 
 
 		 774 aa  171  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  25.8 
 
 		 728 aa  171  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  26.84 
 
 		 692 aa  170  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 		 799 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  26.55 
 
 		 702 aa  169  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  28.27 
 
 		 779 aa  169  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  28.66 
 
 		 778 aa  168  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  27.49 
 
 		 715 aa  167  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  28.52 
 
 		 763 aa  166  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  26.71 
 
 		 760 aa  165  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  25.46 
 
 		 1016 aa  165  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  25.96 
 
 		 766 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1956  glycoside hydrolase family protein  24.62 
 
 		 927 aa  163  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  24.96 
 
 		 784 aa  162  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  26.03 
 
 		 1207 aa  162  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  26.1 
 
 		 780 aa  161  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>