197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1956 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1956  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
927 aa  1913    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289429  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0133  glycoside hydrolase family 31  39.6 
 
 
798 aa  508  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1877  glycoside hydrolase family protein  39.5 
 
 
797 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1316  alpha-glucosidase  39.56 
 
 
845 aa  493  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.168857  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4758  glycoside hydrolase family 31  38.8 
 
 
761 aa  490  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15100  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  40.4 
 
 
816 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1288  glycosyl hydrolase, family 31  38.26 
 
 
915 aa  469  9.999999999999999e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10935  hypothetical protein  40 
 
 
813 aa  465  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0765  alpha-glucosidase  37.01 
 
 
739 aa  464  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0196  alpha-glucosidase  34.92 
 
 
829 aa  451  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.193664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  31.07 
 
 
1207 aa  313  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  31.39 
 
 
1128 aa  305  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  27.32 
 
 
770 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  26.8 
 
 
828 aa  212  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  26.61 
 
 
783 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  27.52 
 
 
803 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  25.78 
 
 
801 aa  197  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  27.41 
 
 
791 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  26.86 
 
 
969 aa  189  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  27.44 
 
 
779 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  24.7 
 
 
836 aa  179  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  26.56 
 
 
839 aa  178  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  23.63 
 
 
836 aa  174  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  25.78 
 
 
799 aa  172  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 
944 aa  171  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  24.24 
 
 
779 aa  171  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  25.22 
 
 
779 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  24.04 
 
 
768 aa  165  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  24.62 
 
 
951 aa  163  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  23.38 
 
 
797 aa  163  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  26.81 
 
 
760 aa  159  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  25.94 
 
 
821 aa  158  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  26.98 
 
 
765 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  24.02 
 
 
792 aa  156  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  24.4 
 
 
764 aa  156  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  24.4 
 
 
764 aa  155  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  23.57 
 
 
973 aa  154  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  25.71 
 
 
766 aa  153  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  23.96 
 
 
749 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  28.83 
 
 
1108 aa  153  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  23.26 
 
 
752 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  24.68 
 
 
785 aa  151  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  23.64 
 
 
775 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  31.1 
 
 
821 aa  149  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  24.7 
 
 
760 aa  148  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  24.8 
 
 
780 aa  146  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  22.84 
 
 
777 aa  146  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  23.48 
 
 
772 aa  144  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  23.26 
 
 
771 aa  144  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  24.57 
 
 
1024 aa  142  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  24.91 
 
 
828 aa  140  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  24.3 
 
 
712 aa  140  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  25.41 
 
 
795 aa  140  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  24.12 
 
 
804 aa  139  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  25.18 
 
 
825 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  23.84 
 
 
743 aa  139  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  23.85 
 
 
798 aa  139  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3814  glycoside hydrolase family 31  28.57 
 
 
1119 aa  139  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  23.36 
 
 
772 aa  138  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  23.04 
 
 
772 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  23.04 
 
 
772 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  23.04 
 
 
772 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  23.47 
 
 
794 aa  137  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  23.75 
 
 
772 aa  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  23.35 
 
 
772 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  23.35 
 
 
772 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  22.58 
 
 
772 aa  136  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  23.35 
 
 
772 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  23.35 
 
 
772 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  23.35 
 
 
772 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  23.35 
 
 
772 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  24.95 
 
 
765 aa  135  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  23.81 
 
 
774 aa  135  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  22.77 
 
 
780 aa  135  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  22.27 
 
 
770 aa  135  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  22.93 
 
 
777 aa  135  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  23.6 
 
 
775 aa  135  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  24.75 
 
 
815 aa  134  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  22.62 
 
 
779 aa  134  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  23.5 
 
 
681 aa  134  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  23.35 
 
 
772 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  23.58 
 
 
752 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  23.16 
 
 
772 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  21.6 
 
 
775 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  24.69 
 
 
685 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  25.06 
 
 
794 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  22.86 
 
 
757 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  23.87 
 
 
778 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  23.68 
 
 
763 aa  131  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  23.44 
 
 
806 aa  131  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  21.47 
 
 
760 aa  130  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  24.42 
 
 
679 aa  129  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  22.24 
 
 
746 aa  127  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  24.91 
 
 
813 aa  126  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  24.16 
 
 
803 aa  126  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  27.24 
 
 
845 aa  126  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 
784 aa  126  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  24.54 
 
 
806 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  24.78 
 
 
763 aa  125  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  26.61 
 
 
695 aa  124  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>