201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0019 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  53.94 
 
 		 699 aa  731    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 679 aa  1420    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  54.44 
 
 		 661 aa  750    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  82.72 
 
 		 679 aa  1194    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  50.96 
 
 		 690 aa  689    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  83.01 
 
 		 679 aa  1197    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  82.72 
 
 		 679 aa  1194    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  52.87 
 
 		 668 aa  706    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  82.87 
 
 		 679 aa  1196    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  82.87 
 
 		 679 aa  1196    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  42.63 
 
 		 695 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  34.84 
 
 		 783 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  32.58 
 
 		 806 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  32.48 
 
 		 791 aa  317  6e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  31.95 
 
 		 973 aa  280  7e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  33.12 
 
 		 969 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  29.95 
 
 		 995 aa  277  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  30.23 
 
 		 770 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  31.94 
 
 		 1024 aa  265  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  32.32 
 
 		 951 aa  263  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  31.64 
 
 		 944 aa  259  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  32.1 
 
 		 840 aa  252  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3277  glycoside hydrolase family protein  30.68 
 
 		 974 aa  242  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  28.65 
 
 		 836 aa  232  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  25.46 
 
 		 836 aa  221  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  28.88 
 
 		 801 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  27.81 
 
 		 839 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  30.2 
 
 		 764 aa  217  7e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  28.62 
 
 		 749 aa  216  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  30.2 
 
 		 764 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  29.05 
 
 		 821 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  28.89 
 
 		 779 aa  213  9e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  28.44 
 
 		 777 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  29.65 
 
 		 757 aa  211  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  26.68 
 
 		 776 aa  211  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  28.42 
 
 		 765 aa  207  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  26.61 
 
 		 760 aa  206  9e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  27.95 
 
 		 743 aa  204  3e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  30.84 
 
 		 795 aa  203  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  25.55 
 
 		 765 aa  200  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  28.49 
 
 		 780 aa  200  7.999999999999999e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  28.06 
 
 		 803 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  26 
 
 		 815 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  27.19 
 
 		 766 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  26.39 
 
 		 770 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  27.1 
 
 		 775 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  29.58 
 
 		 778 aa  197  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  28.14 
 
 		 779 aa  197  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  26.47 
 
 		 695 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  26.72 
 
 		 760 aa  196  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  27.8 
 
 		 774 aa  195  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  27.56 
 
 		 687 aa  194  4e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  26.12 
 
 		 775 aa  194  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  28.51 
 
 		 775 aa  193  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  30.12 
 
 		 771 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  26.77 
 
 		 768 aa  192  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  25.75 
 
 		 821 aa  192  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  27.34 
 
 		 792 aa  190  7e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  25.82 
 
 		 772 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  27.35 
 
 		 681 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  25.43 
 
 		 772 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  25.43 
 
 		 772 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  25.43 
 
 		 772 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  25.43 
 
 		 772 aa  188  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  25.43 
 
 		 772 aa  188  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  25.43 
 
 		 772 aa  188  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  25.27 
 
 		 772 aa  188  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  27.15 
 
 		 763 aa  187  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  26.16 
 
 		 752 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  26.99 
 
 		 685 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  26.94 
 
 		 772 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  28.04 
 
 		 779 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  25.96 
 
 		 772 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 		 799 aa  184  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  28.6 
 
 		 794 aa  183  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  26.59 
 
 		 777 aa  182  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  25.58 
 
 		 779 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  25.84 
 
 		 797 aa  181  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  27.54 
 
 		 752 aa  180  7e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  24.15 
 
 		 746 aa  180  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  26.75 
 
 		 828 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  26.07 
 
 		 772 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  26.07 
 
 		 772 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  29.49 
 
 		 806 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  25.86 
 
 		 763 aa  178  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  25.89 
 
 		 772 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  29.06 
 
 		 712 aa  177  7e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  25.89 
 
 		 772 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.02 
 
 		 787 aa  175  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  25.89 
 
 		 772 aa  174  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  26.08 
 
 		 785 aa  173  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  25.8 
 
 		 804 aa  172  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  28.21 
 
 		 825 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  26.52 
 
 		 823 aa  171  4e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  26.35 
 
 		 780 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  26.92 
 
 		 821 aa  167  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  24.96 
 
 		 794 aa  167  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  24.15 
 
 		 911 aa  166  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.36 
 
 		 788 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  27.04 
 
 		 683 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>