223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6865 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  100 
 
 
1016 aa  2073    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  27.79 
 
 
779 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  28.45 
 
 
760 aa  197  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  31.48 
 
 
765 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  26.11 
 
 
783 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  28.01 
 
 
806 aa  185  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  22.71 
 
 
836 aa  184  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  24.77 
 
 
801 aa  182  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  24.78 
 
 
799 aa  182  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  28.86 
 
 
765 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  26.18 
 
 
828 aa  175  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  27.01 
 
 
944 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  22.99 
 
 
770 aa  172  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  25.19 
 
 
797 aa  170  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  25.47 
 
 
791 aa  169  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.4 
 
 
973 aa  168  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  23.42 
 
 
839 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  25.68 
 
 
794 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  25 
 
 
768 aa  166  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  22.8 
 
 
752 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  25.46 
 
 
951 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  23.21 
 
 
792 aa  164  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  26.87 
 
 
775 aa  161  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  28.77 
 
 
780 aa  160  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  26.07 
 
 
821 aa  160  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  23.88 
 
 
779 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  22.61 
 
 
777 aa  157  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  25 
 
 
785 aa  155  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  33.93 
 
 
969 aa  154  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  27.78 
 
 
1128 aa  153  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  23.75 
 
 
746 aa  152  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  24.96 
 
 
1207 aa  150  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  27.55 
 
 
795 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  27.84 
 
 
772 aa  148  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  27 
 
 
770 aa  147  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  27 
 
 
794 aa  147  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  24.6 
 
 
803 aa  147  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  27.26 
 
 
777 aa  146  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  25.76 
 
 
764 aa  146  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  26.53 
 
 
779 aa  146  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  25.76 
 
 
764 aa  146  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  27.72 
 
 
749 aa  144  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  26.3 
 
 
772 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  25.65 
 
 
779 aa  141  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  28.24 
 
 
772 aa  141  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  26.38 
 
 
772 aa  141  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  26.38 
 
 
772 aa  141  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  26.38 
 
 
772 aa  141  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  26.21 
 
 
772 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  26.21 
 
 
772 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  26.21 
 
 
772 aa  140  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  27.16 
 
 
775 aa  140  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  26.21 
 
 
772 aa  140  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  27.88 
 
 
771 aa  140  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  24.84 
 
 
1024 aa  139  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  28.07 
 
 
799 aa  140  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  27.39 
 
 
775 aa  137  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  26.95 
 
 
772 aa  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  25.33 
 
 
845 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  26.95 
 
 
772 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  23.88 
 
 
798 aa  135  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  26.65 
 
 
821 aa  135  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  26.95 
 
 
772 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  28.57 
 
 
774 aa  135  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  28.92 
 
 
804 aa  135  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  26.3 
 
 
763 aa  135  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  28.8 
 
 
763 aa  134  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  24.44 
 
 
743 aa  135  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  26.78 
 
 
772 aa  134  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  26.63 
 
 
836 aa  133  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  26.78 
 
 
772 aa  132  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  27.66 
 
 
776 aa  131  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  26.8 
 
 
766 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  27.44 
 
 
995 aa  128  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  28.28 
 
 
681 aa  128  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  28.57 
 
 
823 aa  127  8.000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  28.27 
 
 
1108 aa  127  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  26.92 
 
 
828 aa  126  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  26.19 
 
 
760 aa  124  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  24.92 
 
 
806 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  27.6 
 
 
780 aa  123  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3814  glycoside hydrolase family 31  28.96 
 
 
1119 aa  122  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  25.4 
 
 
825 aa  122  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2529  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 
1010 aa  121  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 
695 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  25.7 
 
 
778 aa  119  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  26.12 
 
 
760 aa  119  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  25.3 
 
 
821 aa  117  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  23.48 
 
 
679 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  26.91 
 
 
712 aa  116  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  24.67 
 
 
690 aa  117  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  23.43 
 
 
685 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  23.87 
 
 
700 aa  115  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  22.29 
 
 
813 aa  115  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  25.82 
 
 
762 aa  114  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  23.41 
 
 
757 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  24.56 
 
 
816 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  26.79 
 
 
840 aa  110  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  23.35 
 
 
803 aa  109  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  27.68 
 
 
1965 aa  108  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>