201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03521 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  48.23 
 
 
806 aa  697    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  45.45 
 
 
806 aa  693    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  100 
 
 
795 aa  1663    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  74.62 
 
 
788 aa  1253    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  47.25 
 
 
803 aa  724    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  46.67 
 
 
806 aa  698    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  55.38 
 
 
784 aa  878    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  45.9 
 
 
806 aa  693    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  71.28 
 
 
791 aa  1194    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  100 
 
 
795 aa  1663    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  46.41 
 
 
806 aa  696    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  45.9 
 
 
806 aa  693    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  69.96 
 
 
788 aa  1190    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  49.68 
 
 
821 aa  767    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  71.28 
 
 
791 aa  1204    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  82.55 
 
 
787 aa  1406    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  61.86 
 
 
799 aa  1041    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  71.41 
 
 
791 aa  1197    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  48.34 
 
 
803 aa  745    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  73.75 
 
 
790 aa  1226    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  45.85 
 
 
813 aa  687    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  47.95 
 
 
803 aa  743    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  74.36 
 
 
788 aa  1246    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  71.03 
 
 
789 aa  1184    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  31.52 
 
 
779 aa  343  5e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  29.94 
 
 
777 aa  340  8e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  30.59 
 
 
801 aa  340  8e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  31.52 
 
 
821 aa  334  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  31.59 
 
 
797 aa  333  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03504  alpha-glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06560)  30.08 
 
 
830 aa  326  1e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  31.37 
 
 
828 aa  320  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  30.55 
 
 
776 aa  319  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  30.69 
 
 
794 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  28.7 
 
 
799 aa  311  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  30.25 
 
 
779 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  28.88 
 
 
785 aa  308  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  29.07 
 
 
752 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  31.29 
 
 
803 aa  302  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  31.29 
 
 
779 aa  302  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01640  glicosidase, putative  28.72 
 
 
892 aa  301  4e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  30.62 
 
 
792 aa  298  3e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  29.84 
 
 
768 aa  286  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  30.67 
 
 
836 aa  285  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  28.08 
 
 
825 aa  283  8.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  29.02 
 
 
770 aa  277  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  29.94 
 
 
746 aa  271  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  28.75 
 
 
798 aa  267  5e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  30.79 
 
 
743 aa  267  5e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  28.55 
 
 
845 aa  259  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  29.84 
 
 
702 aa  256  8e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  27.98 
 
 
806 aa  254  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  27.27 
 
 
911 aa  238  3e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  29.03 
 
 
815 aa  238  4e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  31.01 
 
 
765 aa  238  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  30.37 
 
 
762 aa  236  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  31.36 
 
 
760 aa  234  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  27.91 
 
 
828 aa  233  7.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  28.46 
 
 
715 aa  231  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  27.38 
 
 
816 aa  227  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  25.86 
 
 
839 aa  227  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  29.45 
 
 
765 aa  225  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  25.82 
 
 
836 aa  224  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  27.38 
 
 
687 aa  223  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  28.82 
 
 
683 aa  223  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  27.02 
 
 
700 aa  219  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  28.36 
 
 
783 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  28.03 
 
 
661 aa  214  4.9999999999999996e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  26.28 
 
 
806 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50836  alpha subunit of glucosidase  29.09 
 
 
712 aa  213  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.312978  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11054  alpha glucosidase II, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03500)  27.98 
 
 
952 aa  211  5e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.464256  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  26.83 
 
 
685 aa  210  8e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05150  alpha glucosidase, putative  28.11 
 
 
956 aa  209  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  29.89 
 
 
1024 aa  204  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  27.42 
 
 
681 aa  201  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  26.53 
 
 
795 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  27.54 
 
 
728 aa  199  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  28.62 
 
 
951 aa  197  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  27.08 
 
 
695 aa  194  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  26.93 
 
 
656 aa  192  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  23.99 
 
 
821 aa  184  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 
944 aa  184  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  26.8 
 
 
823 aa  183  8.000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  26.72 
 
 
760 aa  184  8.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  25.22 
 
 
791 aa  183  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  27.8 
 
 
804 aa  181  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  29.83 
 
 
969 aa  181  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  25.52 
 
 
775 aa  180  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  25.08 
 
 
779 aa  180  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  24.43 
 
 
764 aa  180  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  27.89 
 
 
778 aa  179  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  24.43 
 
 
764 aa  179  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  28.16 
 
 
794 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  29.39 
 
 
695 aa  177  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  24.45 
 
 
757 aa  176  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  25.4 
 
 
780 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  25.76 
 
 
766 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  26.15 
 
 
799 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  29.04 
 
 
840 aa  174  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  25.61 
 
 
752 aa  174  7.999999999999999e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.16 
 
 
973 aa  173  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>