200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4250 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4341  alpha-glucosidase  98.67 
 
 		 678 aa  1403    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4263  alpha-glucosidase  86.73 
 
 		 678 aa  1251    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03763  alpha-glucosidase  89.3 
 
 		 667 aa  1247    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4108  glycoside hydrolase family 31  87.32 
 
 		 678 aa  1260    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4229  alpha-glucosidase  95.28 
 
 		 678 aa  1357    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5324  alpha-glucosidase  87.32 
 
 		 678 aa  1259    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539055 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4407  alpha-glucosidase  95.58 
 
 		 678 aa  1362    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4250  alpha-glucosidase  100 
 
 		 678 aa  1421    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03712  hypothetical protein  89.3 
 
 		 654 aa  1248    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4295  alpha-glucosidase  98.38 
 
 		 678 aa  1399    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4401  alpha-glucosidase  87.17 
 
 		 678 aa  1259    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2446  alpha-glucosidase  42.22 
 
 		 669 aa  537  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1663  alpha-glucosidase  41.1 
 
 		 681 aa  527  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2586  alpha-glucosidase  35.87 
 
 		 738 aa  428  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2463  alpha-glucosidase  36.07 
 
 		 768 aa  350  6e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_956  predicted protein  35.78 
 
 		 577 aa  335  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00413725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  28.01 
 
 		 764 aa  207  7e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  27.64 
 
 		 764 aa  203  8e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  27.16 
 
 		 779 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  27.7 
 
 		 749 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  26.8 
 
 		 760 aa  194  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  26.35 
 
 		 681 aa  194  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  26.92 
 
 		 772 aa  193  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  26.83 
 
 		 839 aa  191  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  27.24 
 
 		 766 aa  189  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  29.13 
 
 		 771 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  26.75 
 
 		 765 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  26.92 
 
 		 775 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  25.48 
 
 		 774 aa  184  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  29.95 
 
 		 757 aa  183  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  25.89 
 
 		 823 aa  179  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  26.02 
 
 		 765 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  24.95 
 
 		 760 aa  177  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  26.11 
 
 		 775 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  27 
 
 		 780 aa  177  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  25.8 
 
 		 760 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  28.6 
 
 		 770 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  24.96 
 
 		 804 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  26.23 
 
 		 770 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  26.71 
 
 		 763 aa  174  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  27.87 
 
 		 836 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 		 799 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  25.68 
 
 		 775 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  23.62 
 
 		 772 aa  170  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  23.62 
 
 		 772 aa  170  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  23.62 
 
 		 772 aa  170  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  23.62 
 
 		 772 aa  170  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  23.62 
 
 		 772 aa  170  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  23.62 
 
 		 772 aa  170  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  23.43 
 
 		 772 aa  170  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  27.26 
 
 		 836 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  27.77 
 
 		 801 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  25.34 
 
 		 795 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  26.51 
 
 		 778 aa  167  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  25.05 
 
 		 712 aa  167  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  23.32 
 
 		 772 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  23.43 
 
 		 772 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  23.13 
 
 		 772 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  23.13 
 
 		 772 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  23.01 
 
 		 772 aa  164  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  24.91 
 
 		 777 aa  164  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  23.12 
 
 		 763 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  22.77 
 
 		 772 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  22.95 
 
 		 772 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1145  glycoside hydrolase family protein  33.53 
 
 		 739 aa  160  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  30.93 
 
 		 695 aa  160  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  26.69 
 
 		 755 aa  160  1e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  29.31 
 
 		 743 aa  159  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  25.56 
 
 		 821 aa  158  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  24.96 
 
 		 792 aa  157  6e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0954  glycoside hydrolase family protein  25.53 
 
 		 831 aa  156  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  25.13 
 
 		 752 aa  156  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  30.65 
 
 		 779 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  24.39 
 
 		 752 aa  153  8.999999999999999e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  25.78 
 
 		 779 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  28.69 
 
 		 813 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  25.62 
 
 		 768 aa  152  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  25.34 
 
 		 825 aa  150  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  24.25 
 
 		 794 aa  148  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  24.26 
 
 		 806 aa  143  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  25.29 
 
 		 780 aa  143  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  26.84 
 
 		 803 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  28.57 
 
 		 679 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  28.57 
 
 		 679 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  28.32 
 
 		 679 aa  141  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  24.05 
 
 		 806 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  28.07 
 
 		 679 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  28.07 
 
 		 679 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  23.99 
 
 		 821 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  27.39 
 
 		 803 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 		 806 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 		 806 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 		 806 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  28.31 
 
 		 797 aa  137  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  24.51 
 
 		 803 aa  137  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  27.25 
 
 		 806 aa  137  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  24.54 
 
 		 828 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  27.27 
 
 		 668 aa  136  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  28.53 
 
 		 803 aa  135  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0259  glycoside hydrolase family 31  31.15 
 
 		 631 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0820064 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>