193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2463 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2463  alpha-glucosidase  100 
 
 
768 aa  1491    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2586  alpha-glucosidase  42.45 
 
 
738 aa  480  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4263  alpha-glucosidase  33.92 
 
 
678 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5324  alpha-glucosidase  35.32 
 
 
678 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.539055 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03763  alpha-glucosidase  35.32 
 
 
667 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03712  hypothetical protein  35.32 
 
 
654 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4108  glycoside hydrolase family 31  35.32 
 
 
678 aa  369  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4401  alpha-glucosidase  35.32 
 
 
678 aa  369  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4229  alpha-glucosidase  35.28 
 
 
678 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4250  alpha-glucosidase  35.28 
 
 
678 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4407  alpha-glucosidase  35.12 
 
 
678 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264935  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4341  alpha-glucosidase  34.95 
 
 
678 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4295  alpha-glucosidase  34.78 
 
 
678 aa  362  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2446  alpha-glucosidase  40.89 
 
 
669 aa  341  4e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1663  alpha-glucosidase  39.93 
 
 
681 aa  334  5e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_956  predicted protein  37.1 
 
 
577 aa  333  9e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00413725  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  32.11 
 
 
760 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  34.37 
 
 
779 aa  144  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  29.32 
 
 
757 aa  142  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  23.09 
 
 
712 aa  141  4.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  23.81 
 
 
764 aa  140  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  31.59 
 
 
765 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  23.63 
 
 
764 aa  137  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  27.91 
 
 
765 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  29.61 
 
 
749 aa  137  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  30.5 
 
 
779 aa  136  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  24.61 
 
 
839 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  31.04 
 
 
766 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1145  glycoside hydrolase family protein  31.86 
 
 
739 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  21.82 
 
 
772 aa  134  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  29.12 
 
 
774 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0954  glycoside hydrolase family protein  27.62 
 
 
831 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  30.19 
 
 
760 aa  131  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  26.15 
 
 
777 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  30.71 
 
 
804 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  25.4 
 
 
771 aa  127  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  30.11 
 
 
775 aa  126  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  29.3 
 
 
775 aa  126  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  26.59 
 
 
775 aa  124  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  27.42 
 
 
772 aa  124  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  22.48 
 
 
780 aa  124  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  26.87 
 
 
772 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  26.87 
 
 
772 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  26.87 
 
 
772 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  26.87 
 
 
772 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  26.87 
 
 
772 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  26.87 
 
 
772 aa  123  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  27.09 
 
 
823 aa  122  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  26.59 
 
 
772 aa  122  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  24.8 
 
 
752 aa  122  3.9999999999999996e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  28.19 
 
 
770 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  26.59 
 
 
772 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  25.59 
 
 
772 aa  121  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  26.59 
 
 
772 aa  121  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  26.59 
 
 
772 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  26.32 
 
 
772 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  28.81 
 
 
681 aa  118  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  27.11 
 
 
661 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  27.48 
 
 
760 aa  117  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  25.24 
 
 
1024 aa  117  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  26.32 
 
 
772 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  30.2 
 
 
763 aa  116  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  26.28 
 
 
668 aa  115  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  26.29 
 
 
780 aa  115  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  26.75 
 
 
836 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  26.23 
 
 
679 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  26.23 
 
 
679 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  25.98 
 
 
679 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  26.5 
 
 
763 aa  114  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  28.63 
 
 
695 aa  114  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  25.25 
 
 
679 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  24.87 
 
 
792 aa  113  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  25.42 
 
 
770 aa  113  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  25.25 
 
 
679 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  27.59 
 
 
743 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  26.06 
 
 
799 aa  111  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  23.76 
 
 
840 aa  110  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  24.63 
 
 
679 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  23.95 
 
 
836 aa  110  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4334  glycoside hydrolase family protein  27.25 
 
 
616 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  28.22 
 
 
795 aa  109  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  28.03 
 
 
784 aa  109  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 
778 aa  107  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  26.95 
 
 
806 aa  107  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  25.31 
 
 
821 aa  107  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  24.75 
 
 
752 aa  106  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  24.7 
 
 
777 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  28.14 
 
 
785 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  26.21 
 
 
430 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  27.66 
 
 
803 aa  101  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  28.53 
 
 
794 aa  100  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  25.06 
 
 
803 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  27.81 
 
 
816 aa  99.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  25.84 
 
 
806 aa  98.6  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  26.23 
 
 
695 aa  98.2  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  23.88 
 
 
768 aa  97.8  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  26.91 
 
 
779 aa  96.3  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  24.56 
 
 
803 aa  95.9  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  24.68 
 
 
797 aa  95.5  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  25.58 
 
 
806 aa  95.5  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>