85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1442 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  100 
 
 		 1001 aa  2054    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0875  putative hyaluronoglucosaminidase  37.96 
 
 		 1296 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.316601  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1248  fibronectin type III domain-containing protein  97.07 
 
 		 205 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0052  Hyalurononglucosaminidase  35.68 
 
 		 953 aa  341  4e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110511  normal  0.10576 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  48.45 
 
 		 1471 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2451  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.19 
 
 		 581 aa  269  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0472  hyalurononglucosaminidase  37.35 
 
 		 561 aa  259  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.779925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5708  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.09 
 
 		 664 aa  250  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03654  hypothetical protein  31.19 
 
 		 661 aa  249  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  26.24 
 
 		 1172 aa  239  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  40.98 
 
 		 1965 aa  231  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  47.11 
 
 		 1173 aa  193  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0116  Hyaluronidase  36.09 
 
 		 474 aa  189  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  37.47 
 
 		 1588 aa  183  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0184  hyaluronidase  27.88 
 
 		 1627 aa  181  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0148  Hyaluronidase  34.07 
 
 		 431 aa  162  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  75.27 
 
 		 2095 aa  152  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  75.27 
 
 		 2095 aa  150  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0687  fibronectin type III domain-containing protein  73.63 
 
 		 159 aa  145  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0685  fibronectin type III domain-containing protein  75 
 
 		 1686 aa  135  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3474  hyaluronidase  29.04 
 
 		 355 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0815  glycosy hydrolase family protein  56.63 
 
 		 1127 aa  110  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1649  hyaluronidase  27.56 
 
 		 355 aa  109  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0839085  normal  0.600926 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  40.54 
 
 		 591 aa  105  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  37.66 
 
 		 1264 aa  87.8  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.5 
 
 		 805 aa  85.9  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  44.23 
 
 		 850 aa  78.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.33 
 
 		 1289 aa  74.3  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1725  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  27.47 
 
 		 758 aa  68.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  40.79 
 
 		 780 aa  68.2  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1008  glycoside hydrolase family 31  33.09 
 
 		 1311 aa  67.8  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.590426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.85 
 
 		 1329 aa  65.5  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1258  Subtilisin-like serine protease  33.33 
 
 		 1937 aa  62  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.596545  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  28 
 
 		 777 aa  59.7  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.09 
 
 		 1781 aa  57  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.56 
 
 		 699 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.49 
 
 		 687 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0113  alpha-glucosidase  28.35 
 
 		 1019 aa  55.1  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.5746e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  27.81 
 
 		 619 aa  54.7  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  34.25 
 
 		 626 aa  54.3  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  25.87 
 
 		 619 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.81 
 
 		 779 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.27 
 
 		 834 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.87 
 
 		 605 aa  53.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.16 
 
 		 790 aa  51.2  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  31.71 
 
 		 1135 aa  51.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.75 
 
 		 816 aa  50.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.34 
 
 		 613 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.65 
 
 		 774 aa  50.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1815  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.62 
 
 		 728 aa  50.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0101329  normal  0.0951479 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.33 
 
 		 709 aa  50.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1238  glycosy hydrolase family protein  38.75 
 
 		 610 aa  50.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.247532  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.47 
 
 		 704 aa  49.7  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  40 
 
 		 618 aa  49.7  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  25.74 
 
 		 473 aa  49.3  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1051  glycosy hydrolase family protein  38.75 
 
 		 610 aa  48.9  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.11 
 
 		 634 aa  48.9  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1025  beta-hexosaminidase  30.95 
 
 		 879 aa  48.9  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  29.41 
 
 		 999 aa  48.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  36.05 
 
 		 600 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.42 
 
 		 529 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2557  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.86 
 
 		 375 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  31.71 
 
 		 598 aa  47.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.28 
 
 		 526 aa  47  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 		 606 aa  47  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  33.64 
 
 		 1070 aa  46.2  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.46 
 
 		 533 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  30.16 
 
 		 833 aa  45.8  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  30.16 
 
 		 833 aa  45.8  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  30.16 
 
 		 856 aa  45.8  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  30.16 
 
 		 833 aa  45.8  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  30.16 
 
 		 833 aa  45.8  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  30.16 
 
 		 833 aa  45.8  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.13 
 
 		 655 aa  46.2  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.16 
 
 		 827 aa  45.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.16 
 
 		 827 aa  45.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4992  hypothetical protein  30.25 
 
 		 597 aa  45.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2831  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.37 
 
 		 828 aa  45.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2820  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.37 
 
 		 837 aa  45.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.87 
 
 		 820 aa  45.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2206  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.37 
 
 		 837 aa  45.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.993622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6150  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.37 
 
 		 827 aa  45.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.87 
 
 		 542 aa  45.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.92 
 
 		 533 aa  45.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  29.37 
 
 		 836 aa  44.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>