161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1725 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1725  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  100 
 
 
758 aa  1574    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  24.95 
 
 
599 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  23.82 
 
 
619 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 
619 aa  107  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  24.08 
 
 
626 aa  101  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  23.35 
 
 
606 aa  94  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1238  glycosy hydrolase family protein  30.17 
 
 
610 aa  93.6  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.247532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  27.38 
 
 
843 aa  93.6  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1051  glycosy hydrolase family protein  30.6 
 
 
610 aa  92.4  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315037  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  22.37 
 
 
641 aa  91.3  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  28.28 
 
 
503 aa  90.1  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  25.25 
 
 
558 aa  88.6  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7462  hypothetical protein  26.85 
 
 
449 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3250  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.63 
 
 
651 aa  85.9  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0167827  decreased coverage  0.00105641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.95 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.61 
 
 
913 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.16 
 
 
533 aa  82.4  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  24.8 
 
 
543 aa  82.4  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.05 
 
 
766 aa  81.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.86 
 
 
545 aa  81.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.26 
 
 
533 aa  81.3  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.65 
 
 
915 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.4 
 
 
910 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  25.5 
 
 
711 aa  80.5  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.54 
 
 
534 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  24.2 
 
 
525 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.26 
 
 
549 aa  78.6  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  21.77 
 
 
807 aa  78.6  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  25 
 
 
639 aa  78.2  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.53 
 
 
913 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.53 
 
 
655 aa  77.8  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.7 
 
 
699 aa  77.4  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.34 
 
 
634 aa  77.4  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.27 
 
 
762 aa  77.4  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.45 
 
 
683 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.45 
 
 
584 aa  76.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.84 
 
 
905 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.46 
 
 
688 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.59 
 
 
528 aa  75.1  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.33 
 
 
775 aa  73.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.14 
 
 
618 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  28.27 
 
 
816 aa  73.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  27.33 
 
 
602 aa  73.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 
593 aa  72.4  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2136  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.9 
 
 
756 aa  72.4  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.386965  normal  0.21464 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.78 
 
 
797 aa  72  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.15 
 
 
605 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.36 
 
 
530 aa  71.6  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.46 
 
 
553 aa  70.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.94 
 
 
515 aa  70.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.85 
 
 
534 aa  70.9  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.47 
 
 
821 aa  70.5  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.43 
 
 
827 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.43 
 
 
827 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.95 
 
 
542 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6150  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.82 
 
 
827 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.5 
 
 
676 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.95 
 
 
794 aa  69.7  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.72 
 
 
765 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  27.47 
 
 
1001 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.86 
 
 
781 aa  68.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  26.69 
 
 
883 aa  68.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  21.64 
 
 
777 aa  68.6  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2206  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.35 
 
 
837 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.993622  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2820  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.35 
 
 
837 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2831  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.35 
 
 
828 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.45 
 
 
613 aa  68.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.16 
 
 
609 aa  67.8  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.56 
 
 
529 aa  67.8  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.76 
 
 
811 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.38 
 
 
526 aa  67.4  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  29.28 
 
 
833 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.33 
 
 
772 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.63 
 
 
795 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  29.28 
 
 
833 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  29.28 
 
 
856 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  29.28 
 
 
833 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  29.28 
 
 
833 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  29.28 
 
 
833 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  29.28 
 
 
833 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  23.66 
 
 
639 aa  65.9  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  28.73 
 
 
836 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.73 
 
 
774 aa  65.1  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0232  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.56 
 
 
479 aa  65.1  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107558  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  24.46 
 
 
473 aa  65.1  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.93 
 
 
785 aa  64.7  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.76 
 
 
857 aa  64.3  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.91 
 
 
613 aa  64.3  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1815  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.48 
 
 
728 aa  63.9  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0101329  normal  0.0951479 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1924  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.46 
 
 
664 aa  63.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234624  decreased coverage  0.00104389 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.66 
 
 
504 aa  63.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02424  beta-N-hexosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00640)  22.64 
 
 
773 aa  62.4  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0398118 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  22.27 
 
 
1471 aa  62.4  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.7 
 
 
493 aa  62.4  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.92 
 
 
863 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  23.18 
 
 
776 aa  61.2  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  26.57 
 
 
637 aa  61.2  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.74 
 
 
779 aa  60.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  23.57 
 
 
736 aa  59.7  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3043  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  25.29 
 
 
589 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805232 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>