109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3043 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3043  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  100 
 
 		 589 aa  1160    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3073  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  46.68 
 
 		 591 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3733  glycoside hydrolase family 20  45.53 
 
 		 595 aa  467  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0925128  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  38.83 
 
 		 619 aa  345  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  37.63 
 
 		 599 aa  336  7.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  37.15 
 
 		 619 aa  334  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  33.91 
 
 		 641 aa  330  4e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  32.49 
 
 		 626 aa  320  6e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 606 aa  224  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  30.83 
 
 		 711 aa  200  5e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1238  glycosy hydrolase family protein  28.43 
 
 		 610 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.247532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1051  glycosy hydrolase family protein  28.43 
 
 		 610 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315037  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1661  glycoside hydrolase family protein  24.6 
 
 		 556 aa  113  9e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0521911  hitchhiker  0.0032281 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.88 
 
 		 843 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1297  glycoside hydrolase family protein  30.66 
 
 		 557 aa  100  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00968279  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3571  glycoside hydrolase family protein  23.5 
 
 		 631 aa  97.1  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.475227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0222  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.28 
 
 		 571 aa  96.3  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.47 
 
 		 699 aa  85.1  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.85 
 
 		 636 aa  77  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.87 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.55 
 
 		 688 aa  70.9  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  31.22 
 
 		 503 aa  67.8  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.75 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.67 
 
 		 790 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.73 
 
 		 493 aa  67  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.76 
 
 		 504 aa  66.2  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.57 
 
 		 584 aa  63.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.87 
 
 		 518 aa  62.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.84 
 
 		 636 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.32 
 
 		 534 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.42 
 
 		 545 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.24 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7462  hypothetical protein  28.64 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  27.24 
 
 		 543 aa  60.5  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.92 
 
 		 781 aa  60.1  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1815  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.74 
 
 		 728 aa  60.1  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0101329  normal  0.0951479 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  26.09 
 
 		 639 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1725  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  25.29 
 
 		 758 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.23 
 
 		 422 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.4 
 
 		 593 aa  59.3  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3944  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  25.69 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.055877  normal  0.867275 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  25.78 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.17 
 
 		 794 aa  58.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  26.32 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  30.99 
 
 		 1140 aa  57  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.37 
 
 		 627 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0959  glycosyl hydrolase family 20 protein  22.4 
 
 		 640 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00497875  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.03 
 
 		 797 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.71 
 
 		 811 aa  56.2  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.81 
 
 		 481 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.67 
 
 		 774 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.59 
 
 		 639 aa  55.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0701  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 652 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308289  normal  0.494324 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1103  glycosy hydrolase family protein  22.27 
 
 		 640 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00087575  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.1 
 
 		 683 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  24.02 
 
 		 1471 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.54 
 
 		 785 aa  54.7  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3250  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.17 
 
 		 651 aa  53.9  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0167827  decreased coverage  0.00105641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.16 
 
 		 542 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.47 
 
 		 821 aa  53.5  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.84 
 
 		 760 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  26.72 
 
 		 736 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1723  hypothetical protein  22.31 
 
 		 354 aa  52  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.35 
 
 		 549 aa  52.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.74 
 
 		 905 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  38.05 
 
 		 856 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  38.05 
 
 		 833 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  38.05 
 
 		 833 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  38.05 
 
 		 833 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  38.05 
 
 		 833 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  38.05 
 
 		 833 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  38.05 
 
 		 833 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.48 
 
 		 795 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3239  glycoside hydrolase family protein  24.88 
 
 		 635 aa  50.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  21.74 
 
 		 602 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.19 
 
 		 827 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.4 
 
 		 527 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  27.24 
 
 		 614 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2820  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 		 837 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 		 688 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.19 
 
 		 827 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.84 
 
 		 605 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2206  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 		 837 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.993622  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.21 
 
 		 812 aa  48.1  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.7 
 
 		 868 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.38 
 
 		 655 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6150  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 		 827 aa  48.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2831  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.28 
 
 		 828 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  28.57 
 
 		 889 aa  47.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  35.04 
 
 		 836 aa  47  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.46 
 
 		 546 aa  47  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1025  beta-hexosaminidase  30.68 
 
 		 879 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1924  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.34 
 
 		 664 aa  47  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234624  decreased coverage  0.00104389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.67 
 
 		 866 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.56 
 
 		 500 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.6 
 
 		 634 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.26 
 
 		 858 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.48 
 
 		 628 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.92 
 
 		 857 aa  45.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  32.95 
 
 		 883 aa  45.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>