177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0488 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
626 aa  1281    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  43.34 
 
 
641 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  39.84 
 
 
619 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  40.36 
 
 
619 aa  469  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  38.61 
 
 
599 aa  429  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3043  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  32.49 
 
 
589 aa  320  6e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805232 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1238  glycosy hydrolase family protein  44.01 
 
 
610 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.247532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1051  glycosy hydrolase family protein  44.01 
 
 
610 aa  319  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  39.01 
 
 
606 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3073  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  33.81 
 
 
591 aa  297  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3733  glycoside hydrolase family 20  29.69 
 
 
595 aa  256  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0925128  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  37.43 
 
 
711 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  35.41 
 
 
843 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0222  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  30.79 
 
 
571 aa  126  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  22.57 
 
 
699 aa  121  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1661  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 
556 aa  115  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0521911  hitchhiker  0.0032281 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1297  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 
557 aa  107  6e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00968279  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1725  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.08 
 
 
758 aa  101  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  29.24 
 
 
503 aa  96.3  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3571  glycoside hydrolase family protein  23.34 
 
 
631 aa  93.6  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.475227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.2 
 
 
797 aa  92  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.76 
 
 
821 aa  90.5  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.74 
 
 
811 aa  89.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.1 
 
 
526 aa  87.4  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  24.4 
 
 
777 aa  87.4  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3944  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  28.62 
 
 
389 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.055877  normal  0.867275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.4 
 
 
762 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.86 
 
 
534 aa  84.7  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.86 
 
 
794 aa  84.3  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.92 
 
 
515 aa  84.3  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.39 
 
 
634 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  25.27 
 
 
558 aa  82.4  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.95 
 
 
688 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.41 
 
 
688 aa  82.4  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  26.2 
 
 
602 aa  81.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.82 
 
 
609 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.36 
 
 
905 aa  80.9  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.32 
 
 
605 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0959  glycosyl hydrolase family 20 protein  23.76 
 
 
640 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00497875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  24.33 
 
 
473 aa  79.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.32 
 
 
542 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  23.34 
 
 
836 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  25.36 
 
 
833 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.75 
 
 
827 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  25 
 
 
833 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3250  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.71 
 
 
651 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0167827  decreased coverage  0.00105641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  24 
 
 
553 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  23.51 
 
 
833 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  25 
 
 
856 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0686  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 
673 aa  77.8  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0317867 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  23.51 
 
 
833 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  23.51 
 
 
833 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  23.51 
 
 
833 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.75 
 
 
827 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 
529 aa  77.4  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.62 
 
 
422 aa  77.4  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1103  glycosy hydrolase family protein  24.09 
 
 
640 aa  77  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00087575  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.09 
 
 
584 aa  76.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.18 
 
 
775 aa  76.3  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2206  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.39 
 
 
837 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.993622  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2820  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.39 
 
 
837 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2831  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.39 
 
 
828 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  24.01 
 
 
525 aa  75.5  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.06 
 
 
528 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.42 
 
 
774 aa  74.7  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.48 
 
 
534 aa  74.3  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6150  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.08 
 
 
827 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.68 
 
 
683 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  23.56 
 
 
1471 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.58 
 
 
816 aa  73.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.56 
 
 
790 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.17 
 
 
618 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  24.76 
 
 
1140 aa  72.4  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.43 
 
 
781 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.29 
 
 
858 aa  71.6  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.44 
 
 
812 aa  71.2  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.52 
 
 
785 aa  71.2  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.7 
 
 
812 aa  70.9  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.9 
 
 
493 aa  70.9  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.69 
 
 
613 aa  70.5  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  25.44 
 
 
637 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.02 
 
 
527 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1815  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.2 
 
 
728 aa  70.1  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0101329  normal  0.0951479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.55 
 
 
593 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.4 
 
 
533 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.59 
 
 
779 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.74 
 
 
756 aa  67.4  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.96 
 
 
795 aa  67.4  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.57 
 
 
505 aa  67.4  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.77 
 
 
545 aa  67.4  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  22.28 
 
 
795 aa  67  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  24.17 
 
 
639 aa  67  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.94 
 
 
549 aa  67  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.12 
 
 
533 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  27.62 
 
 
736 aa  67  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.72 
 
 
765 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  25.67 
 
 
807 aa  65.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.6 
 
 
639 aa  65.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.75 
 
 
655 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  22.25 
 
 
883 aa  65.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>