132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3112 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  100 
 
 
843 aa  1744    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  35.41 
 
 
626 aa  214  5.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  30.47 
 
 
619 aa  191  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1051  glycosy hydrolase family protein  30.68 
 
 
610 aa  181  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  29.91 
 
 
619 aa  181  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1238  glycosy hydrolase family protein  30.68 
 
 
610 aa  181  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.247532  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  31.91 
 
 
641 aa  177  9e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 
599 aa  171  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  26.89 
 
 
606 aa  164  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  27 
 
 
711 aa  157  6e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.02 
 
 
699 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1297  glycoside hydrolase family protein  29.31 
 
 
557 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00968279  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3073  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  25.79 
 
 
591 aa  128  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0222  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  29.85 
 
 
571 aa  127  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1661  glycoside hydrolase family protein  30.41 
 
 
556 aa  121  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0521911  hitchhiker  0.0032281 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3733  glycoside hydrolase family 20  23.5 
 
 
595 aa  107  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0925128  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0959  glycosyl hydrolase family 20 protein  23.57 
 
 
640 aa  103  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00497875  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3043  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.88 
 
 
589 aa  103  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805232 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1103  glycosy hydrolase family protein  22.93 
 
 
640 aa  99.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00087575  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3571  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 
631 aa  99  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.475227  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1725  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  27.38 
 
 
758 aa  94  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  28.29 
 
 
503 aa  90.1  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  26.52 
 
 
558 aa  89.4  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.82 
 
 
688 aa  77  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.08 
 
 
528 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3944  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.61 
 
 
389 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.055877  normal  0.867275 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3239  glycoside hydrolase family protein  24.65 
 
 
635 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1924  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.91 
 
 
664 aa  76.6  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234624  decreased coverage  0.00104389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.51 
 
 
515 aa  76.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.48 
 
 
605 aa  75.5  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.17 
 
 
526 aa  75.5  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.97 
 
 
797 aa  74.3  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 
505 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  24.29 
 
 
543 aa  73.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.18 
 
 
683 aa  71.6  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0701  glycoside hydrolase family protein  21.11 
 
 
652 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308289  normal  0.494324 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.69 
 
 
816 aa  70.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  22.98 
 
 
807 aa  70.5  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.69 
 
 
905 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.85 
 
 
795 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.78 
 
 
533 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3250  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.08 
 
 
651 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0167827  decreased coverage  0.00105641 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.89 
 
 
794 aa  68.6  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.54 
 
 
774 aa  68.2  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.7 
 
 
618 aa  68.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.63 
 
 
529 aa  68.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 
593 aa  67.8  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0686  glycoside hydrolase family protein  21.43 
 
 
673 aa  67  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0317867 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.74 
 
 
785 aa  67  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.07 
 
 
481 aa  67.4  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.85 
 
 
613 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.39 
 
 
676 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.83 
 
 
584 aa  66.6  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.64 
 
 
613 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  23.64 
 
 
525 aa  66.6  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.87 
 
 
634 aa  65.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.32 
 
 
765 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.54 
 
 
772 aa  64.7  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.74 
 
 
811 aa  64.7  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.06 
 
 
542 aa  64.3  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.1 
 
 
756 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.49 
 
 
545 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.97 
 
 
688 aa  63.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  23.53 
 
 
473 aa  63.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1815  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.83 
 
 
728 aa  63.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0101329  normal  0.0951479 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.77 
 
 
775 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.24 
 
 
553 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.75 
 
 
790 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01502  N-acetylglucosaminidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HGI3]  23.26 
 
 
603 aa  61.6  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000172563  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.57 
 
 
533 aa  61.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  24 
 
 
812 aa  60.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.91 
 
 
534 aa  60.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 
762 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  23.32 
 
 
776 aa  59.3  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.42 
 
 
760 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2590  glycoside hydrolase family protein  22.25 
 
 
956 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.4 
 
 
812 aa  59.3  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.26 
 
 
549 aa  58.9  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.55 
 
 
655 aa  58.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.13 
 
 
665 aa  58.2  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0397  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.59 
 
 
722 aa  58.2  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.571244  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  24.4 
 
 
795 aa  57.8  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.2 
 
 
546 aa  57.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  24.57 
 
 
777 aa  57  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.88 
 
 
821 aa  57  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.32 
 
 
766 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.76 
 
 
530 aa  57.4  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  22.19 
 
 
736 aa  57.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7462  hypothetical protein  23.08 
 
 
449 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.96 
 
 
834 aa  56.2  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.44 
 
 
547 aa  55.8  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.24 
 
 
504 aa  55.8  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.41 
 
 
500 aa  55.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.94 
 
 
527 aa  55.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1424  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.39 
 
 
643 aa  55.1  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  23.96 
 
 
639 aa  55.1  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32069  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  22.55 
 
 
614 aa  54.7  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.28283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3052  glycoside hydrolase family protein  22.5 
 
 
348 aa  54.7  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.11 
 
 
493 aa  54.3  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  24.41 
 
 
778 aa  53.9  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>