32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2590 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2590  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 956 aa  1981    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0686  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 673 aa  131  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0317867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3052  glycoside hydrolase family protein  33.48 
 
 		 348 aa  111  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1723  hypothetical protein  27.76 
 
 		 354 aa  92.8  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3944  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  29.79 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.055877  normal  0.867275 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  21.81 
 
 		 641 aa  67.8  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  21.63 
 
 		 626 aa  61.2  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  21.24 
 
 		 807 aa  60.1  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  22.25 
 
 		 843 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.25 
 
 		 609 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  20.63 
 
 		 619 aa  53.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  20.19 
 
 		 778 aa  53.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.08 
 
 		 688 aa  51.6  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3073  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  21.78 
 
 		 591 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  19.75 
 
 		 619 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.28 
 
 		 774 aa  50.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  20.64 
 
 		 606 aa  50.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1725  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.02 
 
 		 758 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  20.72 
 
 		 711 aa  49.3  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  23.48 
 
 		 736 aa  48.5  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.26 
 
 		 665 aa  48.1  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7462  hypothetical protein  30.21 
 
 		 449 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.66 
 
 		 683 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  31.58 
 
 		 503 aa  47  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.46 
 
 		 772 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.02 
 
 		 655 aa  45.8  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.73 
 
 		 549 aa  45.1  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  21.28 
 
 		 599 aa  45.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.47 
 
 		 533 aa  45.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.81 
 
 		 834 aa  45.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.18 
 
 		 545 aa  44.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1815  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.88 
 
 		 728 aa  44.7  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0101329  normal  0.0951479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>