165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0071 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  100 
 
 
711 aa  1459    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  37.27 
 
 
606 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1238  glycosy hydrolase family protein  34.91 
 
 
610 aa  333  6e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.247532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1051  glycosy hydrolase family protein  33.93 
 
 
610 aa  329  8e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315037  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  33.95 
 
 
626 aa  256  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  37.89 
 
 
599 aa  246  9e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  36.77 
 
 
641 aa  242  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  33.92 
 
 
619 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  33.62 
 
 
619 aa  226  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3073  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  34.39 
 
 
591 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3043  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  30.83 
 
 
589 aa  201  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3733  glycoside hydrolase family 20  28.8 
 
 
595 aa  184  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0925128  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  27 
 
 
843 aa  157  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1297  glycoside hydrolase family protein  30.63 
 
 
557 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00968279  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1661  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 
556 aa  136  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0521911  hitchhiker  0.0032281 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0222  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  29.57 
 
 
571 aa  136  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.71 
 
 
699 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3571  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 
631 aa  96.3  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.475227  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2136  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  25 
 
 
756 aa  87.8  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.386965  normal  0.21464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.13 
 
 
605 aa  85.1  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  26.48 
 
 
602 aa  82.8  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1725  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  25.59 
 
 
758 aa  82  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  26.77 
 
 
639 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0686  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 
673 aa  79.7  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0317867 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1103  glycosy hydrolase family protein  23.19 
 
 
640 aa  79  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00087575  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0959  glycosyl hydrolase family 20 protein  22.59 
 
 
640 aa  77.4  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00497875  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  26.69 
 
 
639 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  28 
 
 
779 aa  75.5  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3944  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.53 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.055877  normal  0.867275 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.8 
 
 
772 aa  75.1  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.75 
 
 
915 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  28.3 
 
 
503 aa  75.1  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  25.6 
 
 
469 aa  75.1  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  22.73 
 
 
1471 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.38 
 
 
913 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.43 
 
 
910 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.86 
 
 
913 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.56 
 
 
888 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0701  glycoside hydrolase family protein  24.75 
 
 
652 aa  73.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308289  normal  0.494324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  24.64 
 
 
525 aa  72  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.99 
 
 
504 aa  72.4  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  25.9 
 
 
777 aa  71.6  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.86 
 
 
884 aa  72  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  26.47 
 
 
637 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.75 
 
 
811 aa  72  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.33 
 
 
534 aa  71.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.19 
 
 
779 aa  70.9  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03620  Beta-hexosaminidase precursor, putative  23.73 
 
 
586 aa  70.5  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.83 
 
 
688 aa  70.1  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.51 
 
 
760 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.87 
 
 
526 aa  68.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.51 
 
 
866 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.92 
 
 
534 aa  68.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  25.86 
 
 
558 aa  68.2  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0397  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.16 
 
 
722 aa  68.2  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.571244  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.34 
 
 
618 aa  68.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.92 
 
 
593 aa  67.8  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  26.39 
 
 
836 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7462  hypothetical protein  23.83 
 
 
449 aa  67.4  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.3 
 
 
500 aa  67.4  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.64 
 
 
790 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.29 
 
 
639 aa  66.6  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.13 
 
 
775 aa  66.6  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.92 
 
 
636 aa  67  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.03 
 
 
533 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01502  N-acetylglucosaminidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HGI3]  22.62 
 
 
603 aa  65.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000172563  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02424  beta-N-hexosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00640)  22.64 
 
 
773 aa  65.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0398118 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.94 
 
 
888 aa  65.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.15 
 
 
518 aa  65.5  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.03 
 
 
525 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  25.36 
 
 
543 aa  65.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.19 
 
 
529 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  26.55 
 
 
833 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.55 
 
 
545 aa  64.7  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  26.55 
 
 
833 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  26.55 
 
 
833 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  26.55 
 
 
833 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  26.55 
 
 
833 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  26.55 
 
 
856 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  22.92 
 
 
816 aa  64.7  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.1 
 
 
905 aa  64.3  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.15 
 
 
785 aa  64.3  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.82 
 
 
762 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  25.35 
 
 
833 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  27 
 
 
688 aa  63.9  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  21.32 
 
 
896 aa  62.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.94 
 
 
546 aa  62.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.66 
 
 
765 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.23 
 
 
683 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  24.56 
 
 
778 aa  62.4  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3239  glycoside hydrolase family protein  20.24 
 
 
635 aa  62  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.84 
 
 
613 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.83 
 
 
493 aa  62  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.6 
 
 
868 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.52 
 
 
781 aa  61.6  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.41 
 
 
853 aa  61.6  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.23 
 
 
515 aa  61.6  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  25.48 
 
 
639 aa  61.6  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.8 
 
 
852 aa  61.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.94 
 
 
888 aa  61.2  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>