154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1226 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
641 aa  1298    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  43.34 
 
 
626 aa  495  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  40.66 
 
 
619 aa  478  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  40.23 
 
 
619 aa  472  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  35.44 
 
 
599 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3043  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  33.91 
 
 
589 aa  330  4e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3073  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  32.08 
 
 
591 aa  310  6.999999999999999e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  31.1 
 
 
606 aa  287  4e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3733  glycoside hydrolase family 20  31.24 
 
 
595 aa  285  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0925128  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1238  glycosy hydrolase family protein  38.38 
 
 
610 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.247532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1051  glycosy hydrolase family protein  38.38 
 
 
610 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  36.77 
 
 
711 aa  243  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  31.91 
 
 
843 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1661  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 
556 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0521911  hitchhiker  0.0032281 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0222  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  25.93 
 
 
571 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1297  glycoside hydrolase family protein  25.35 
 
 
557 aa  111  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00968279  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.04 
 
 
699 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3250  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.57 
 
 
651 aa  94.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0167827  decreased coverage  0.00105641 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3571  glycoside hydrolase family protein  22.82 
 
 
631 aa  94.7  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.475227  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1725  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  22.37 
 
 
758 aa  91.3  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.02 
 
 
821 aa  86.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  23.42 
 
 
777 aa  85.1  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.03 
 
 
905 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.31 
 
 
683 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  23.56 
 
 
602 aa  81.6  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.55 
 
 
688 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.35 
 
 
797 aa  78.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.93 
 
 
526 aa  77.4  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.98 
 
 
834 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.45 
 
 
774 aa  76.6  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0959  glycosyl hydrolase family 20 protein  22.51 
 
 
640 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00497875  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1103  glycosy hydrolase family protein  22.51 
 
 
640 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00087575  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.39 
 
 
549 aa  73.2  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1815  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.21 
 
 
728 aa  73.2  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0101329  normal  0.0951479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  23.99 
 
 
1140 aa  73.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.36 
 
 
527 aa  73.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  22.38 
 
 
639 aa  72  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.93 
 
 
609 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  21.79 
 
 
639 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.95 
 
 
794 aa  71.2  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.62 
 
 
655 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  23.45 
 
 
833 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  23.45 
 
 
833 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  23.45 
 
 
833 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  23.45 
 
 
833 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  23.45 
 
 
833 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  23.45 
 
 
833 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  23.45 
 
 
856 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.98 
 
 
605 aa  70.5  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  22.7 
 
 
836 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  23.42 
 
 
558 aa  70.1  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.18 
 
 
545 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0686  glycoside hydrolase family protein  21.6 
 
 
673 aa  69.3  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0317867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.47 
 
 
534 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  20.66 
 
 
525 aa  68.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.19 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.75 
 
 
584 aa  68.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.8 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7462  hypothetical protein  22.22 
 
 
449 aa  67.8  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.72 
 
 
863 aa  67.8  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2590  glycoside hydrolase family protein  21.81 
 
 
956 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0701  glycoside hydrolase family protein  23.91 
 
 
652 aa  67.4  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308289  normal  0.494324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.92 
 
 
542 aa  67  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3944  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  22.73 
 
 
389 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.055877  normal  0.867275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.06 
 
 
853 aa  67  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.61 
 
 
688 aa  67  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.06 
 
 
529 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2206  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.83 
 
 
837 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.993622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.23 
 
 
827 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2820  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.83 
 
 
837 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.23 
 
 
827 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.61 
 
 
775 aa  65.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  20 
 
 
534 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.29 
 
 
593 aa  65.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.6 
 
 
553 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.76 
 
 
676 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  21.17 
 
 
637 aa  65.1  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.14 
 
 
613 aa  64.3  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  25.67 
 
 
503 aa  64.3  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.54 
 
 
765 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2136  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.56 
 
 
756 aa  63.9  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.386965  normal  0.21464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.89 
 
 
515 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.17 
 
 
533 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  22.25 
 
 
795 aa  62.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.55 
 
 
811 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2831  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.44 
 
 
828 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.04 
 
 
760 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.2 
 
 
772 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.46 
 
 
852 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02424  beta-N-hexosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00640)  21.62 
 
 
773 aa  62  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0398118 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6150  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.83 
 
 
827 aa  62  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.8 
 
 
628 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.15 
 
 
779 aa  60.8  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  20.73 
 
 
543 aa  60.8  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2903  chitobiase  22.36 
 
 
891 aa  60.8  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000114665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2992  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.36 
 
 
891 aa  60.8  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720324  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.1 
 
 
518 aa  60.8  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  19.36 
 
 
533 aa  60.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  22.56 
 
 
889 aa  60.1  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.41 
 
 
885 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>