174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0519 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  90.28 
 
 
619 aa  1134    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
619 aa  1271    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  47.67 
 
 
599 aa  513  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  40.23 
 
 
641 aa  483  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  40.36 
 
 
626 aa  476  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3043  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  38.83 
 
 
589 aa  357  3.9999999999999996e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3073  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  37.07 
 
 
591 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3733  glycoside hydrolase family 20  34.65 
 
 
595 aa  311  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0925128  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1238  glycosy hydrolase family protein  39.14 
 
 
610 aa  284  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.247532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1051  glycosy hydrolase family protein  39.14 
 
 
610 aa  283  9e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  34.22 
 
 
606 aa  280  5e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.84 
 
 
711 aa  233  7.000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  29.64 
 
 
843 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.84 
 
 
699 aa  154  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1661  glycoside hydrolase family protein  25.18 
 
 
556 aa  137  8e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0521911  hitchhiker  0.0032281 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1297  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 
557 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00968279  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0222  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.48 
 
 
571 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1725  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.85 
 
 
758 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.13 
 
 
688 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3571  glycoside hydrolase family protein  20.63 
 
 
631 aa  97.8  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.475227  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  26.9 
 
 
503 aa  90.9  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.42 
 
 
821 aa  89  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.47 
 
 
683 aa  88.2  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.17 
 
 
422 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.43 
 
 
905 aa  85.5  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.66 
 
 
797 aa  84.3  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  23.51 
 
 
777 aa  84  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.21 
 
 
688 aa  83.6  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.53 
 
 
526 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.96 
 
 
534 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.59 
 
 
529 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  24 
 
 
775 aa  81.6  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0686  glycoside hydrolase family protein  22.52 
 
 
673 aa  81.3  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0317867 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.81 
 
 
618 aa  81.3  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  22.62 
 
 
525 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.8 
 
 
790 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.74 
 
 
781 aa  80.1  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3944  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  25.09 
 
 
389 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.055877  normal  0.867275 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  24.09 
 
 
1471 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  24.84 
 
 
558 aa  77.8  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  23.85 
 
 
778 aa  77  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.14 
 
 
794 aa  76.6  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  28.18 
 
 
833 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  28.18 
 
 
833 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  28.18 
 
 
856 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  28.18 
 
 
833 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  28.18 
 
 
833 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  28.18 
 
 
833 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  28.18 
 
 
833 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.48 
 
 
605 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.15 
 
 
527 aa  75.5  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  27.87 
 
 
836 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  26.47 
 
 
807 aa  74.7  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.6 
 
 
525 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  22.38 
 
 
816 aa  74.3  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.33 
 
 
762 aa  73.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  25.39 
 
 
736 aa  73.9  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  20 
 
 
602 aa  73.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.1 
 
 
613 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.6 
 
 
863 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.35 
 
 
868 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 
812 aa  72.8  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.22 
 
 
812 aa  72.4  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.26 
 
 
493 aa  72.4  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.45 
 
 
504 aa  72.4  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  24.84 
 
 
543 aa  72.8  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.42 
 
 
779 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  22.71 
 
 
469 aa  72.4  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.68 
 
 
528 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.72 
 
 
546 aa  72  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.57 
 
 
827 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.57 
 
 
827 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0701  glycoside hydrolase family protein  25.26 
 
 
652 aa  71.6  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308289  normal  0.494324 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.95 
 
 
518 aa  71.2  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.69 
 
 
542 aa  70.5  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.2 
 
 
545 aa  70.5  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.64 
 
 
613 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2206  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.92 
 
 
837 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.993622  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2820  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.92 
 
 
837 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2831  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.92 
 
 
828 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.73 
 
 
515 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.02 
 
 
553 aa  67.8  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.21 
 
 
811 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  25.34 
 
 
1140 aa  68.2  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1924  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.26 
 
 
664 aa  67.8  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234624  decreased coverage  0.00104389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.02 
 
 
857 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  37.08 
 
 
883 aa  67.4  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.75 
 
 
593 aa  67  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.03 
 
 
447 aa  67  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.36 
 
 
765 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32069  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  23.33 
 
 
614 aa  67  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.28283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.75 
 
 
853 aa  66.6  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  32.95 
 
 
881 aa  66.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6150  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.37 
 
 
827 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  21.47 
 
 
795 aa  65.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.26 
 
 
676 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.76 
 
 
609 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.35 
 
 
500 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.78 
 
 
655 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  37.08 
 
 
883 aa  65.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>